Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 2,985,842 | Δ47,769 bp | yqeG–[idi] | 39 genes yqeG, yqeH, yqeI, yqeJ, yqeL, yqeK, ygeG, ygeH, ygeI, insD4, insC4, ygeQ, glyU, actS, xdhA, xdhB, xdhC, ygeV, ygeW, ygeX, ygeY, hyuA, yqeA, yqeB, yqeC, mocA, ygfK, ssnA, ygfM, xdhD, xanQ, guaD, ghxQ, ygfS, ygfT, uacT, yqfG, yqfH, [idi] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 2985842 | 3033610 | 47769 | 31 [0] | [0] 32 | yqeG–[idi] | yqeG,yqeH,yqeI,yqeJ,yqeL,yqeK,ygeG,ygeH,ygeI,insD4,insC4,ygeQ,glyU,actS,xdhA,xdhB,xdhC,ygeV,ygeW,ygeX,ygeY,hyuA,yqeA,yqeB,yqeC,mocA,ygfK,ssnA,ygfM,xdhD,xanQ,guaD,ghxQ,ygfS,ygfT,uacT,yqfG,yqfH,[idi] |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2985841 | 0 (0.000) | 31 (1.000) | 29/490 | 0.1 | 100% | intergenic (‑249/‑6) | yqeF/yqeG | putative acyltransferase/putative transporter YqeG |
? | NC_000913 | 3033611 = | 0 (0.000) | coding (547/549 nt) | idi | isopentenyl‑diphosphate Delta‑isomerase |
AATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAAGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTTTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2985607‑2985841 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTTCGTCGTCACCTGCGTCTTTCGCGGCAACCTG > NC_000913/3033611‑3033848 AATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGAAATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAACAACCCCGAC > 1:192098/1‑250 GCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAACAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGG > 1:300920/1‑251 GCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGG > 2:76440/1‑251 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TTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATA > 2:57436/1‑250 CACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCG > 1:102499/1‑251 AAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGT > 1:10316/1‑251 ATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGATTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCAT > 1:168270/1‑251 ATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGCAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGAAGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGAGGATGGTATGGCTGTTGGTTGACAGCAataacat > 2:90252/1‑244 GTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATT < 2:210379/251‑1 AACCCACCGATAGAGGGGTAGATACGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCCGGTTTATGGTAAATTGCCCCCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGCTACGTTATAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTAGCGGAGGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGTTACCACTTCCCCGTCCTGCTG > 2:176049/1‑251 ACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAAAAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGT > 1:190814/1‑251 AATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAAGTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACAAATTCCCAGACCTGCTGACGGCGGT < 1:254975/251‑1 ATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTACAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGGCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTAGGCGGT > 2:93184/1‑250 GAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCCTACGGTCGATCCCAATTTCCCGACCTGCTGTCGGCGGTAAGC > 2:30108/1‑251 GGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGCTACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCCGTAAGCCc > 2:198370/1‑250 GGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTG < 1:67623/251‑1 CCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTGGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCTGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGT < 2:45106/248‑1 ATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTT > 1:48787/1‑251 TATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATC < 1:172897/250‑1 TATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACAGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTG > 1:54335/1‑151 TATGGTAAATTGCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGGGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTG < 2:54335/151‑1 agaacCCCTCCATTCTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTGGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCGTGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCAGCGTAGAACATCGCTTCGTC < 2:148280/246‑1 AATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCGGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCAACGTAGAACATCGCTT < 2:122973/227‑1 AATTTGTAGATGATACGTTCTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGCTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCCTCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGCTGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTT > 1:122973/1‑227 AGATGATACGTTCTAAAAACACCCAGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCCTTACCATACGGTCGATACCAATTCCCCGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATTTTCCAGTGCGGGGACGTAATCTTCATCGTCGAACATCGCCTCGTCGTCACCTGCGTCTTTCGCGGCCACCTG > 2:299960/1‑251 AATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAAGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTTTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2985607‑2985841 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTTCGTCGTCACCTGCGTCTTTCGCGGCAACCTG > NC_000913/3033611‑3033848 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |