| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,139,288 | C→T | D141N (GAC→AAC) | fsaB ← | fructose‑6‑phosphate aldolase 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,139,288 | 0 | C | T | 98.0% | 171.0 / NA | 51 | D141N (GAC→AAC) | fsaB | fructose‑6‑phosphate aldolase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (28/21); total (29/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCCTTTAGAGATGAGTAGTGCCAAATGCGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTCTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCCCTGCGCGTCGCGGCTCATGGTCTGA > NC_000913/4139042‑4139535 | tCCTTTAGAGATGAGTAGTGCCAAATGCGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCg > 1:152672/1‑251 (MQ=255) ccTTTAGAGATGAGTAGTGCCAAATGCGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATGTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGc < 1:214739/251‑1 (MQ=255) tAGAGATGAGTAGTGCCAAATGCGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCt < 1:7915/250‑1 (MQ=255) gaTGAGTAGAGCAAAATGAGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTGCTATATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTTTTGCGCTACATATAAGGGCAGGGGGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGCAGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGTCGCGTGCATTTCTAACAGCATTTGCAGCTCCTGACCCCTCCGAATGCCTGT‑TCCGACCTGGGcc > 2:444694/1‑250 (MQ=255) gAGTAGTGCCAAATGCGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCt < 1:251938/251‑1 (MQ=255) aaaTGCGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTa > 1:443398/1‑250 (MQ=255) ggCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACCCTACCCCAGGCGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTAAATCTAAGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACg > 1:232443/1‑251 (MQ=255) cATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCTGTTAACATACgg > 1:248880/1‑250 (MQ=255) gTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGt < 1:442891/251‑1 (MQ=255) cGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTCAGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTAt > 1:314174/1‑251 (MQ=255) cGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGCGTTGAGCATTTGTTGCGCTACCTCTACGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTAt > 1:319165/1‑251 (MQ=255) gtgtTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTAtt > 2:350118/1‑251 (MQ=255) cggactcgcatgaaggtgtgtTGAGCATTGGTGGAGCTACATCGAGGGGCTGGGGGA‑TGTATTCACAGCCTGCCAGTAGACAGTCCAGCGCCTGAGGCGGCGTTTTAAAGCTGGCGGCCAGCGCCAGGCTTGCTTGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGGACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCAGCTACGCGGTTAACATGCGGAGCAGCGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGcg < 2:288128/234‑2 (MQ=255) cTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCt > 1:106014/1‑251 (MQ=255) ggggTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTgc > 2:347459/1‑251 (MQ=255) gggttACATCTAAGGGCAGGG‑GAGTGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTg < 2:218355/247‑1 (MQ=255) aTCTAAGGGAAGGGTGA‑TGGCTTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCAAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTAGCTGCCAGCACCCTGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGACCCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATACCCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAgtg > 2:466414/1‑251 (MQ=255) aaGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTgtagt < 1:350118/251‑1 (MQ=255) aGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTgtagt > 1:72066/1‑250 (MQ=255) a‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCttt > 1:385087/1‑251 (MQ=255) a‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGGAATACCCTCttt < 1:347459/251‑1 (MQ=255) atggattacccaccTGCCAATAAAAACTCCAGCGCCTCACGGCGCGCTGTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACCGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGATTGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGCTAACATACGTAGCAACGCTTTTT‑GCCCCTGCCCGTGAGCATAATAACCCTGGGGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTACTACCATCttt > 1:120602/13‑251 (MQ=255) ggATTCACACCCTTCCAGTAAACAGTCCAGCGCCGGTCGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGGATTTT‑TCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCGTGTGCGGCGCTATATTCAGCAGTGCCAAGTGGAGTAATACCCGCttttt < 2:319165/251‑1 (MQ=255) gATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCtttttt < 1:17301/251‑1 (MQ=255) gATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCtttttt > 1:364504/1‑251 (MQ=255) cacaTCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAg < 1:159618/250‑1 (MQ=255) acaTCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTCACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTCCCAAGGGGAGTAATAACCTCTTTTTTCAGt > 2:151332/1‑250 (MQ=255) tccgatcgaCAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATTCGGAGCAACGTATGTT‑TCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACATCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCGTTTTTCAGTATTTTaa < 1:299608/242‑1 (MQ=255) gCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTa < 1:34658/249‑1 (MQ=255) atAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTATAAAGCTGTCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGGTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTCTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGATCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATtgct < 2:118213/250‑1 (MQ=255) aCAGTCTAGCGCCTACCGCGGCGTATTAAACGTGGCTGCCCGCACCATTCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGACGTTCCTGAAACGTACGACTGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAACCACGTATTTT‑GCCCCTGCCCGTGCGGCTAATACCCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTaaatatcgga > 2:299608/1‑242 (MQ=255) aGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGcc > 1:61488/1‑248 (MQ=255) tCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTACAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGCATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGTAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATCCAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTCATTGCTACCAGAcc > 2:227633/1‑251 (MQ=255) gcCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGTATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCgg > 1:154857/1‑250 (MQ=255) cTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGa > 1:395269/1‑249 (MQ=255) ccggtgTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTAGTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGATAATATCCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAATTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCATTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCAcc < 2:420500/246‑1 (MQ=255) gctggctgCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTcacc > 1:105245/1‑250 (MQ=255) aGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCgg > 1:256370/1‑251 (MQ=255) gCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCgg > 1:64630/1‑251 (MQ=255) ccATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATa < 2:105245/251‑1 (MQ=255) ttCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCA‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTCTATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTcgc > 1:216243/1‑251 (MQ=255) tCTGGCGCGTGCATCTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTcgcg > 2:322122/1‑251 (MQ=255) aaCAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCGCCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCGTCGcttct < 2:154857/249‑1 (MQ=255) cAGCGCTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTcc > 1:139772/1‑250 (MQ=255) ttgaagcgccTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGTTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTTCCAAGTATAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGGCCTTCGGAAGTCTCCGGGATTTTCTCCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCCTCGCTTCTTCCGCCATc < 2:344562/242‑1 (MQ=255) gCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCCTCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTc > 2:90300/1‑217 (MQ=255) gCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCAGAATACCCGGAATAGCGTc < 1:90300/217‑1 (MQ=255) ccTGAACCGTACGAATGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCC‑TGCGCGt > 2:429589/1‑251 (MQ=255) aaTGCC‑GTTTCCCCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCC‑TGCGCCTCGCGGCTCATGGt < 2:314174/251‑1 (MQ=255) aTGCC‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCC‑TGCGCGTCGCGGCTCATGGTc < 2:106014/251‑1 (MQ=255) cc‑GTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCATGCTCTTCGCTTCTTCCACCATCCC‑TGCGCGTCGCGGCTCATGGTCTGa < 1:444694/251‑1 (MQ=255) | TCCTTTAGAGATGAGTAGTGCCAAATGCGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGA‑TGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCC‑GTCTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTT‑GCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCCCTGCGCGTCGCGGCTCATGGTCTGA > NC_000913/4139042‑4139535 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |