Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,675,411 | 0 | T | G | 32.7% | 70.3 / 10.7 | 52 | V209G (GTC→GGC) | yhjE | putative transporter YhjE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/31); new base G (17/0); total (21/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.73e-10 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTCTACTCTATGACCTTTAGTACCGCCGCCGCGCCAGTTGGGCTTGGCCTGCCGCGTAACGAAGTGTT > NC_000913/3675163‑3675657 | gctgctgGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTGCTCGGCGGTGCTGGt < 1:361869/249‑1 (MQ=255) gctcctggcgcgggcTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTGAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCTATTGGCTTCTTCTTTCCCAATGGCACTTTCTGGCTGCTTTCCTGGCTTCGGGCCGACGAGCAGTTGATGAGCGGGGGCTGGCGTGCGCCATTTAGCTTCTCTGCTGTGCTGGTCa < 2:24115/247‑1 (MQ=255) gTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTg < 2:131302/251‑1 (MQ=255) cGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCGGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGGTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCg < 1:218664/250‑1 (MQ=255) aaTGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGttt < 1:16162/251‑1 (MQ=255) gcggcgcTGCTGGCGACTGAAACCGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCGTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGc < 2:98223/251‑1 (MQ=255) gctgctGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGGCCCTA‑TCCGCCCGTATGTTCGCGTGTCGCCTCCT‑GAGTCCCCGGCGGTTG‑AG‑AAAGTCGC‑tcaac > 1:150072/1‑247 (MQ=255) gctgGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCg < 1:344505/250‑1 (MQ=255) ctgGCGCCTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGTGCCTTT‑TCGGCCTTGATGTTCGCGTGGTGCCGCCT‑GGGTCGCCGGTGtttttggaaagtggcgaagcga > 2:193340/1‑231 (MQ=255) cccACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCCGGGCCTTA‑TTGGCCTGGTTTTTTGCGGGGCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGGGGTTG‑GG‑AAAATCGC‑CAAAACG‑gaaaaaaaagggaagaacc > 1:434384/1‑238 (MQ=255) ccACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGGGCTGGTCATTT‑TCGGCCTGTATGTTCGCGGGTTGCTGCCT‑GAGTCGCCGGGGGTTG‑AG‑AAAAGCGC‑TAAAACG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑Accc > 1:100349/1‑251 (MQ=255) cgcgCAAACGTGCACTGGAGGGCTCCTTGCCGCAGCTGGGCGCACCGATGGGCTTCTTCTGTGCCAATGGCACCTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACTAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCTGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGGTCGCGTGTCGCTGCAT‑AAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑GAAAGCG‑AAAAAACAGTTGAA‑GA‑TCCCGCtt < 2:223114/251‑2 (MQ=255) cgcAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGGCCTTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGCGGCGCCGCAT‑GGGTCGCCGGGGTTTG‑TG‑GAAGACGC‑GTAAGCG‑AAAAAACAGGGGGA‑GA‑Tcccccttgg > 2:87392/1‑245 (MQ=255) aaaaCGGGCACTGGAGGGCTACGTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCGGTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCCTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCAGTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAG‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGGCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTa < 2:292914/250‑1 (MQ=255) cGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGGCCTTA‑TCGGCCTGGATGTTCTCGTGTCGCTGCAT‑GAGGTGCCGGGGGTTGTGG‑AAAG‑CGC‑TAAAACG‑GAAAAAAAGGGGAA‑GA‑ttcccccggggacgcc > 1:148519/1‑236 (MQ=255) tCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCCGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGGGCTTGGCCTTA‑TTCGCCTGCATGTTCCCGTGGCGCTGCCT‑GCGTCGCACGTGGTTG‑AG‑AAAGTTGC‑CCAAGGG‑AACAAAAAGGTGAA‑AA‑TCCCCCGGGGGAAGCTGCTG‑A‑CCCAAAATGt > 1:217666/1‑251 (MQ=255) tCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGGCATTA‑TCGGCCTTTATGTTCGCGTGTCGCTGCCT‑GGGTCGCCGGTGTTTT‑TG‑AAAGTCGC‑TTAAGCG‑AAAAAAAAGGTGAA‑GA‑TTCCGCTGGGGACGCTGCTG‑G‑CCAAACATGt > 1:125878/1‑251 (MQ=255) ccTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTGTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGtt < 1:166934/251‑1 (MQ=255) aGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCAGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGGGTTTG‑GG‑AAAGGCGC‑TAAAGCG‑AAAAAAAAGGGGAAAGA‑‑CCCCCTGGGGACGCCGGTG‑G‑CCAAACATGTTCGCGTTAcc > 1:189380/1‑251 (MQ=255) cgcACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGGACCGGGACTTA‑TAGGGCTGTATTGTCGCGCGTCCGGGCAT‑TAGTTCCCGGGGTTTT‑GG‑AAAGATGC‑TAAAGAG‑AAAAAAAAGGGGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTAAGCTGCTGGA‑CCaacaagttgtcgtgacccaactgg > 1:204962/1‑229 (MQ=255) ccGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TAc < 1:403307/251‑1 (MQ=255) tGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCGTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTGCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTc < 1:256871/250‑1 (MQ=255) ttcttTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑GCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCg < 1:30772/147‑1 (MQ=255) ccAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAAcc < 1:5938/251‑1 (MQ=255) aaTGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTCTGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTTGGCATTT‑TCGGCCTGTTTGTTTGCGTGTCGCTGGAT‑GAGGCGCCGGGGGTTG‑AG‑AAAGACGC‑TGAAGAG‑AAAAAACAGGGGAA‑GA‑TCCCCCTGGGGAAGCTGCTG‑A‑CCAAACACGTTCGCGTAACCGTACTGGGGAACGTTC‑TTATGGT‑GGCaaacct > 1:56317/1‑247 (MQ=255) aTGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGGCATTAATGGACCGGT‑TGTTTGGGAGTCCCTGCATTAAGCCCCGGGGGTTTG‑GG‑AAA‑TCGC‑CAAAGAG‑AAAAAAAAGGGGAA‑GAATCCC‑CTTGGGAAGCTGCTG‑AACCAAA‑ATGTTCGCGTAACCATACCGGG‑GAAGTTCACTATGTT‑GGCAAccctt > 1:419355/1‑248 (MQ=255) cACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGc < 1:17721/251‑1 (MQ=255) aCTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGCt < 1:460611/251‑1 (MQ=255) ttCTTGCGGCTTTCCTGGCTTCTGACCGCTGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCCTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCT‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGGAATCGTACTGGG‑TACGTTAATTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGt < 2:113841/250‑1 (MQ=255) tgctgcTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCGCGGCGGTGCTGGTCAGTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTGG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑GCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCATCCTATACGCTGtttt < 2:176817/249‑1 (MQ=255) gctTTCCTGGCTACTGGCCGGCGAGCAGGTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGGATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGGCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCCG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTAcatc < 2:20288/250‑1 (MQ=255) ctTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGGCATTA‑TCGGCCCTTATGTTTGCGTGTCGCTGCCT‑GAGTCCCCGGGGGTTT‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAAAAGGGGGA‑GA‑ACCCGCTGGGGACGCTGCTG‑A‑ACCAACATGTTCGCGGAAACGTCATGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAAACTATAAGCCGGTTTAcatcat > 1:468960/1‑251 (MQ=255) tCCTGGCTACTGACCGCCGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGGCATTA‑TCGGCCTGTTTGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GGGGCGCCGGGGGTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAACG‑AAAAAAACGGGGAA‑AA‑TCCCGCTGGGGACGCTGCTG‑A‑CCAAACCAGTTTGCGTAACCGTCCTGGG‑TACGTTCATTTTGCT‑GGCAACCTTTACGCTGTTTTTcatcattac > 1:386861/1‑248 (MQ=255) ggCTACGGGCCGACGAGCAGTTTATGGGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCAGTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTc < 2:92781/251‑1 (MQ=255) aCTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCAGTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTCTAc < 1:273103/250‑1 (MQ=255) aCTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGGCATTA‑TCGGGCTGGTTGTTTGCGTGGCGCTGCAT‑GAGGCGCCGGTGGTTG‑GG‑AAAGGCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGGGAA‑GA‑TCCCGCCGGGTAAGCCGCTG‑A‑CCAAAAATGTTTGCGGAACCGGACTGGG‑GAAGTTTATTATGCT‑GGCAACCTATACGCGGTTTTTCATCATGACGGGCTaat > 1:80968/1‑249 (MQ=255) gACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAG‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTCTActct < 2:434384/250‑1 (MQ=255) gACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGGGATTA‑TCAGCCCGTATGTTTGCGTGGCGCTGCCT‑GCGGCGCCGGGGGTTG‑AG‑AAAGGCGC‑TCAAGCG‑AAAAAACAGGGGAA‑GA‑TCCCGCTGGGGACGCTCCTG‑A‑CCAAACAAGTTTGCGCAACCGGACTGGG‑GAAGGTCCTTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTTCATCCTGACGGTCTCctctt > 1:47546/1‑250 (MQ=255) aCCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTCTACTCTAt < 1:87392/251‑1 (MQ=255) ccGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACAGGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTCTACTCTATg < 1:307387/251‑1 (MQ=255) cgacgaGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCT‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCAt < 1:298731/201‑1 (MQ=255) gaGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTCTACTCTATGACCtt < 1:181424/251‑1 (MQ=255) gaGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGGCATTA‑TCGGGCTGTATGGTTGCGGGTCGGTGCAT‑GAGTCGCCGGGGTTTT‑GG‑GAAGGCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAAGTGAA‑GG‑TCCCGCTGGGGACGCGGCGG‑G‑CCAAAAATGTTTGCGTAAACGGACTGGG‑GAGGTTCATTATTCT‑GGGAACCTATACGCTGGTTTTCATCCTGCCGGTCTACTCTATGACCtt > 1:429830/1‑251 (MQ=255) gaGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGGCATTA‑TCGGCCTGGTTGGTCGCGTGGCGCTGCAT‑GAGTTGCCGGTGGTTG‑AG‑AAAGGCGCCTAAA‑CG‑AAAAAAAAGGGGAA‑GA‑TCCCCCTGGGGACGCCGCTG‑A‑CCAAAAATGTTCTCGTAACCCTACTGGG‑TACGGTCATTATGCT‑TGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTCTACTCTATGACCtt > 1:73457/1‑251 (MQ=255) tATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGGCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGGGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGGGTTTG‑AGGAAAG‑CGC‑TAAAACGGAAAAAAC‑GGGGGA‑GA‑TCCCGCTGGGGAAGCCGCTG‑A‑CCCAACATGTTTGCGTAACCCGACTTGG‑GACGTTCATTATGCTTGGCA‑CCTATACGCTGGTTTACCTCCTGACCGTCTTCTTTTTGACCTTTAGGAccc > 1:257854/1‑250 (MQ=255) gAGCGGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTTTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCTTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACTGTCTACTCTATGACCTTTAGGAccgccg < 2:47546/251‑1 (MQ=255) cGTGGGCCATTTATCTTCTCGGCGGGGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTGTCGTGTCGCTGCAT‑GAGGCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCTTAACCGTACTGGG‑TACATTCATTATGCT‑GGCAACCTATACTCTGTTTTACATCATGACGGTCTACTCTATGACCTTTAGTACCGACTGCGCGCCAGTTgg < 2:329120/251‑1 (MQ=255) aTTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGGGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAAAAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGGACGCTGCTG‑A‑CCAAAAATGTTCGCGTAAACGTACTGGG‑TACGGTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTCTACTCTATGACCTTTAGTACCGCCGCCGCGCCAGTTGGGCTTGGcc > 1:126549/1‑251 (MQ=255) ttATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTCTACTCTATGACCTTTAGTACCGCCGCCGCGCCAGTTGGGCTTGGCCt < 1:255413/250‑1 (MQ=255) gCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGCCGCCGCAT‑GAGGAGCCGGTGTTGG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑CCCCGCTGGGTACGCTGTGG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGCTTTTTGACATCATGACGTTCTACTCTATGACCTTTAGTACCGCCGCCGCGCCAGTTGGGCTTGGCCTGCCGCGTAACGAAgtgt < 2:182224/251‑1 (MQ=255) cTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGAGTCGCTGCAT‑GAGTCGTCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCAC‑TACAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑ACAAACATGTTCGCGAAACCGTCCTGGG‑TACGTTCTTTATGCT‑GGCCACCTCTAAGCTGTTTTATTTCCTGACGGTCTACTCTATTACCTTTAGTACCGCCGCCGCGCCCGTTGGGCTTGGCCTGCCGCGTAACGGAGtgtt > 1:461555/1‑251 (MQ=255) ggTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTCTACTCTATGACCTTTAGTACCGCCGCCGCGCCAGTTGGGCTTGGCCTGCCGCGTAACGAAGtgtt < 1:193340/249‑1 (MQ=255) ggTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTCTACTCTATGACCTTTAGTACCGCCGCCGCGCCAGTTGGGCTTGGCCTGCCGCGTAACGAAGtgtt < 1:214487/249‑1 (MQ=255) | GCTGCTGGCGCTGGCTCGATTTGGTCAGGGTCTGGGCTTAGGCGGTGAATGGGGCGGCGCGGCGCTGCTGGCGACTGAAAACGCCCCACCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTA‑TCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCGCTGCAT‑GAGTCGCCGGTGTTTG‑AG‑AAAGTCGC‑TAAAGCG‑AAAAAACAGGTGAA‑GA‑TCCCGCTGGGTACGCTGCTG‑A‑CCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGG‑TACGTTCATTATGCT‑GGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTCTACTCTATGACCTTTAGTACCGCCGCCGCGCCAGTTGGGCTTGGCCTGCCGCGTAACGAAGTGTT > NC_000913/3675163‑3675657 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |