| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,060,444 | Δ19,761 bp | yihL–yiiF | 19 genes yihL, yihM, yihN, ompL, yihO, yihP, yihQ, yihR, yihS, yihT, yihU, yihV, csqR, yihX, yihY, dtd, fabY, yiiE, yiiF |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4060444 | 4080204 | 19761 | 51 [0] | [1] 52 | yihL–yiiF | yihL,yihM,yihN,ompL,yihO,yihP,yihQ,yihR,yihS,yihT,yihU,yihV,csqR,yihX,yihY,dtd,fabY,yiiE,yiiF |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4060443 | 0 (0.000) | 50 (1.090) | 49/482 | 0.1 | 99.0% | intergenic (+213/‑4) | bipA/yihL | 50S ribosomal subunit assembly factor BipA/putative DNA‑binding transcriptional regulator YihL |
| ? | NC_000913 | 4080205 = | 1 (0.020) | intergenic (+236/+94) | yiiF/fdhE | protein YiiF/formate dehydrogenase formation protein | |||||
GCGAGGAATGGTAATGGGAAAAAATGATGTCAATCAGATTGCTGACAACGTGCGCGTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAGTCGTATAAATTCAATGTATTGCAGTTTATTGGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATCTTACGCTTGTCATCAGTCTCATGCCCATAACCTTATTGATGTGGTGGTGGGTAAATTGAGGCCAAACCGGCACTGGCGGCATAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTTCGATTTTTGGATCTTTTTCCTGATAGAGAATTTTCAGGTAAGTGT > NC_000913/4079956‑4080453 | cgtcgccgcgccaaccgcgcaccgaaagacgattaatttcgttttttagtcataaaaaacctgccagcgatggcaggtttttttttgcctgtcgtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggtttaagt > 2:126964‑M2/250‑250 (MQ=255) gtcgccgcgccaaccgcgcaccgaaagacgattaatttcgttttttagtcataaaaaacctgccagcgatggcaggtttttttttgcctgtcgtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCt < 1:384921‑M2/3‑1 (MQ=255) gccgcgccaaccgcgcaccgaaagacgattaatttcgttttttagtcataaaaaacctgccagcgatggcaggtttttttttgcctgtcgtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGa < 1:142137‑M2/6‑1 (MQ=255) aaccgcgcaccgaaagacgattaatttcgttttttagtcataaaaaacctgccagcgatggcaggttttttttgcctgtcgtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAAc < 2:125667‑M2/15‑1 (MQ=255) atttcgttttttagtcataaaaaacctgccagcgatggcaggtttttttttgcctgtcgtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttccgtcaatagagagctttgtcacacttatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTgtc > 1:228660‑M2/215‑251 (MQ=255) ttttttagtcataaaaaacctgccagcgatggcaggtttttttttgcctgtcgtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTcac > 1:277403‑M2/209‑250 (MQ=255) tagtcataaaaaacctgccagcgatggcaggtttttttttgcctggcgtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCt < 2:141052‑M2/47‑1 (MQ=255) agtcataaaacacctgtcagcgatggacggtttttttttgcctgccgtgagcgcacaccaatgcgaggatctcccttatcagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgcagttaattgctttcttttttggcgtaagagtaagatgcttcatctggtttaaacaaaaaggattaaGCTTGAGTTGGTAACGCGGATTACGAGAGATGGTGTCGTCAAACCCTAt > 2:288629‑M2/203‑251 (MQ=255) aacctgccagcgatggcaggtttttttttgcctgtcgtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAAt < 1:426219‑M2/59‑1 (MQ=255) cagcgatggcaggtttttttttgcctgtcgtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCg > 1:142377‑M2/186‑251 (MQ=255) ctgtcgtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTc > 1:258562‑M2/162‑250 (MQ=255) cgtgagcgcccaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAgaga < 2:277403‑M2/94‑1 (MQ=255) gtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCag > 2:330753‑M2/157‑247 (MQ=255) gtgagcgcacaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGAt < 2:315150‑M2/95‑1 (MQ=255) gcacaccaatgcgagtatctcccttataaggctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTActct < 2:149922‑M2/101‑1 (MQ=255) acaccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTGAGAGATTACTCTcc > 2:268298‑M2/149‑251 (MQ=255) ccaatgcgagtatctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCAGCCGGAAAACGTCAGAGATTGCTCTCCTTc < 1:352609‑M2/106‑1 (MQ=255) atctcccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAAc < 2:149799‑M2/116‑1 (MQ=255) cccttataagtctgtggttacgtcaatagagagctttgtcacaattatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAgg < 1:284767‑M2/119‑1 (MQ=255) 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2:23496‑M2/60‑1 (MQ=255) tatctgcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATc > 1:23496‑M2/86‑145 (MQ=255) gcaaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCg < 1:330753‑M2/167‑1 (MQ=255) aaagtcatacgccgttaattgctttcttttttggcgtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGAGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGACACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGCCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGt > 2:406725‑M2/79‑251 (MQ=255) 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gtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGc > 2:161310‑M2/44‑185 (MQ=255) gtaagcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGc < 1:161310‑M2/142‑1 (MQ=255) gcgtaagatgcttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTTCGAttttt > 2:417839‑M2/40‑251 (MQ=255) cttcatctggtttaaaccaaaaggattaaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCCTCTGCTACGGCTTCGATTTTTGGAt > 2:3330‑M2/30‑245 (MQ=255) 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aaGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGCCATCTGCTACGGCTTCGATTTTTGGGTCTTTTTCCTGATAGAGAATTTTAAGGTAagtgg > 2:18842‑M2/3‑250 (MQ=255) | GCGAGGAATGGTAATGGGAAAAAATGATGTCAATCAGATTGCTGACAACGTGCGCGTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAGTCGTATAAATTCAATGTATTGCAGTTTATTGGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATCTTACGCTTGTCATCAGTCTCATGCCCATAACCTTATTGATGTGGTGGTGGGTAAATTGAGGCCAAACCGGCACTGGCGGCATAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTTCGATTTTTGGATCTTTTTCCTGATAGAGAATTTTCAGGTAAGTGT > NC_000913/4079956‑4080453 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |