| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,890,411 | IS1 (–) +9 bp | coding (176‑184/1248 nt) | tnaB → | tryptophan:H(+) symporter TnaB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 43 (1.270) | 41/486 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3890411 = | 0 (0.000) | coding (176/1248 nt) | tnaB | tryptophan:H(+) symporter TnaB | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 24 (0.710) | 24/486 | 0.4 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3890419 | 0 (0.000) | coding (184/1248 nt) | tnaB | tryptophan:H(+) symporter TnaB | |||||
TATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGT > NC_000913/3890164‑3890659 | aacgccattcatggccatatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGtt < 1:118847‑M2/4‑1 (MQ=255) acgccattcatggccatatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGtt > 1:281159‑M2/247‑250 (MQ=255) gccattcatggccatatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGttatt < 1:261929‑M2/7‑1 (MQ=255) cattcatggccatatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAg < 1:305547‑M2/9‑1 (MQ=255) ttcatggccatatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGa > 1:331792‑M2/241‑250 (MQ=255) gTTAGCCACTCGCTTACCCTACATCCGCAATAACAAAAATAGCCTTACTCTAAAGGTGGCATCATGACGGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGTGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGGATGGTTGCTTGACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGGTTTCAATGCTTCATTCCGGTTGATTGTTATTAGggt > 2:334542‑M2/1‑247 (MQ=255) catatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAAttt < 1:346026‑M2/19‑1 (MQ=255) atgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaaccccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatccccTGTTATTAGaagccaatttcacttat > 2:264130‑M2/226‑244 (MQ=255) aCCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttat < 1:7700‑M2/251‑20 (MQ=255) attttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATccc < 1:111078‑M2/29‑1 (MQ=255) attgtctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaactccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATccc < 2:284515‑M2/29‑1 (MQ=255) ttctggtgcgtaccggtttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGt < 1:121479‑M2/31‑1 (MQ=255) ggcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttgtacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccggtacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggagagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttgtcagcagcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGGCGGCTcc < 2:298133‑M2/38‑1 (MQ=255) gcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTAtcccggcggcgccc > 2:113019‑M2/213‑247 (MQ=255) accgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtcgctgaccaggagggaccgctgatagaaacagaacccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCACATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGttt > 1:164287‑M2/209‑251 (MQ=255) aagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGAtt > 2:271296‑M2/189‑251 (MQ=255) ggTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACCGTAATTGGTGGAGGACTGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttt < 2:129611‑M2/251‑59 (MQ=255) aactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATc > 2:102582‑M2/184‑251 (MQ=255) gttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcacccccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAaca < 2:257623‑M2/75‑1 (MQ=255) ccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTg > 1:40947‑M2/173‑251 (MQ=255) gttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAAc < 2:101526‑M2/83‑1 (MQ=255) gcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgccagtagctgaacaggagggaaagctgatagaaacagaagcaactggagcaccccaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaacTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCCTCGGCTCCAGTTTTAAAACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATc > 1:59490‑M2/161‑249 (MQ=255) agtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCg > 1:42969‑M2/159‑251 (MQ=255) gagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGt < 1:152168‑M2/95‑1 (MQ=255) aaaGCACTCTGCAGTTTGGGGTGTTATGGGTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGGTGATCTTGCCGGGGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCAGTGCCTGTTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTGATTAGggtaaggacgcgaacgtatggatagtgttgtatggtcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattgtgagaacga > 2:177859‑M2/1‑164 (MQ=255) gCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTCTGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgac < 2:45972‑M2/249‑89 (MQ=255) gagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGt < 1:181803‑M2/103‑1 (MQ=255) cgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccggcagtagcggaacaggaggtacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaagcattaagttggcagcatcgccGGTTAGTAGAAGCAAATTTAAAGTATCCCGTCTGCTCCAGTTTTAACAGCATCACCGAAGATTTAATCGGTAGCACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTc < 1:30717‑M2/110‑1 (MQ=255) ttGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTCATTGGTGGAGGTATGATTGCTTTACATGTTGCTCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCCTTGCCTGGTTTTCAATGCTTCCTTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcc < 2:163807‑M2/196‑48 (MQ=255) ttGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTTCCTGTATCCTTATCAGTGCCTGGTTTTCAAGGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcc > 1:163807‑M2/1‑149 (MQ=255) gtgtTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTGGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTTTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccacctattttgagaacgacagcgacttccgtcccagcc > 2:233904‑M2/1‑144 (MQ=255) gtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTctct < 1:271296‑M2/117‑1 (MQ=255) gtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTctct < 2:268320‑M2/117‑1 (MQ=255) ccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGGTGCCTTCGTTCTCta < 1:102582‑M2/118‑1 (MQ=255) ggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTatat > 2:97527‑M2/131‑251 (MQ=255) ggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCt > 2:161968‑M2/128‑251 (MQ=255) tataGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTCCCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGAGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtg < 1:35483‑M2/251‑118 (MQ=255) ataGCAGGTCCAGGAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagggttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccggcccagccgtgccaggtg > 2:181224‑M2/1‑133 (MQ=255) taGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGCTCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcccggtgct < 2:247070‑M2/251‑120 (MQ=255) cgttacgcacccccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACGTATGCCt < 1:107966‑M2/135‑1 (MQ=255) tacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccaccatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCtat > 1:92916‑M2/114‑250 (MQ=255) gcaccaccccgtcaggagctgaacaggagggacagctgagagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTGAAATTAGCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCTCCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAACGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTCTATCCTCACGTATGCCCATAtct < 2:232089‑M2/141‑1 (MQ=255) ggtggAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcctccgattttgagaacgacagcgacttccatcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggtt > 1:129611‑M2/1‑115 (MQ=255) gAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGCGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgcc < 2:72918‑M2/251‑141 (MQ=255) ccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAAt < 1:291418‑M2/149‑1 (MQ=255) gCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgc < 1:244894‑M2/251‑152 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCAt < 2:281159‑M2/160‑1 (MQ=255) agctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTGCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCGCTGCGAATGGGGCGAGCATTAGTGAAACGatat < 2:164072‑M2/174‑1 (MQ=255) gTGCCTGGTTTTTCTGGGGAGCCTTTATCCTTATCATTCCCTGGTTTTCAACGCTTCATTCCGGGCTATTGTTATTAGggtcatgactccaacttattgatagcgctttatgttcagatcatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgatt < 1:239409‑M2/250‑173 (MQ=255) gcatgggTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTAGTGTTATTAGggtaatgtctccaacttattgatattgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcctgcccagccgtgccaggtgctgtctcagattcaggtgatgccgctcaattcgctgcttatatcgcttgctgattac > 1:232782‑M2/4‑76 (MQ=255) aacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCGAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCGATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATGAGTGAAACGATATCAATGAAttt < 2:132167‑M2/184‑1 (MQ=255) ggTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgca > 1:307429‑M2/1‑72 (MQ=255) ggggTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgcgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttccct < 2:226028‑M2/251‑189 (MQ=255) gagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTGCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGGTATCAATGAATTTGGTTTATCACGCTa < 2:346772‑M2/198‑1 (MQ=255) gTGCCTTTATCCTTATCATAGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttc < 1:25179‑M2/250‑191 (MQ=255) ttATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgg > 1:45972‑M2/1‑54 (MQ=255) ccTTATCATAGCCAGGCTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTACggtaatgactcaaacttattgatagtgttttctgttaagctaatgcacgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgccagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtctatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattc < 2:158881‑M2/251‑202 (MQ=255) tATCATGGCCTGGTGTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccatcttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagatcgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcat > 2:85497‑M2/1‑47 (MQ=255) ccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCgg < 2:331792‑M2/214‑1 (MQ=255) tCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatac < 1:278796‑M2/250‑206 (MQ=255) aaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCt > 2:26432‑M2/26‑103 (MQ=255) aaatcagtaagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCt < 1:26432‑M2/78‑1 (MQ=255) aagttggcagcatcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTc < 2:42969‑M2/233‑1 (MQ=255) agttggcagcatcaccTGTTATTAGCAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGt > 1:290080‑M2/17‑251 (MQ=255) gcagcctcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCAACAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGcc > 2:289144‑M2/12‑250 (MQ=255) atcaccTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGt > 1:99239‑M2/7‑250 (MQ=255) attgttattAGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtc < 1:262190‑M2/251‑241 (MQ=255) | TATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTGGGGTGTTATGGTTATAGCAGGTACAGTAATTGGTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAACGATATCAATGAATTTGGGTTATCACGCTAATCCACGTATTGTCGGGATCTGCACAGCCATTTTCGTTGCCAGCGTATTGT > NC_000913/3890164‑3890659 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |