| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,105,376 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (+83/‑34) | csgC → / → ymdA | curlin chaperone/uncharacterized protein YmdA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | 24 (0.710) | 23/484 | 0.5 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1105376 = | 0 (0.000) | intergenic (+83/‑38) | csgC/ymdA | curlin chaperone/uncharacterized protein YmdA | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1105380 | 0 (0.000) | 31 (0.920) | 30/486 | 0.2 | 100% | intergenic (+87/‑34) | csgC/ymdA | curlin chaperone/uncharacterized protein YmdA |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
AGCAAGAAAAGACCCTTTCATTGCCTGCTAATCAACCCATTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATATTTCCCCGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTGATCCATTTTTATGGCCAAATTGTGGAACCGGCATGTGACGTCAGCACCCAGTCATCACCCGTAGAAATGAACTGCCCACAGAATGGTTCTATTCCGGGCAAAACCTACTCCAGCAAAG > NC_000913/1105130‑1105621 | aGCAAGAAAAGACCCTTTCATTGCCTGCTAATCACCCCATTGCTTTGACGAAGTTGCGTTTAAATAGTTCCCCGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGCTGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGACCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGTAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCt > 2:221803/1‑251 (MQ=255) gcttacgtcagggaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatcccctgttcaaagctctgctgaacaatttcgatcttttcctgtgtggtacgtcgtctgcgttgcgccggccgtaagacgtcaatgatctgttctccaaggactagtcgaaaaactagtattaagactatcacttagttaattggtattggttgtctggagattcagggtgccagtctaACCCTc < 1:170332‑M2/6‑1 (MQ=255) gcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttagttaagtgatattggttgtctggatattcagtgggccagtctaACCCTc < 2:121065‑M2/6‑1 (MQ=255) aaaGACCCTTTCATTGCCTGCTAATCAACCCATTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATATTTCCCCGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggattt < 1:161429‑M1/251‑8 (MQ=255) ttCATTGCCTGCTAATCAACCCCTTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATATTTCCCCGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATGTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAAGTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCGtggatttgcccctat < 2:203227‑M1/250‑16 (MQ=255) tCATTGCCTGCTAATCAACCCATTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATCTTTCCCCGGACGATCCGGTGCAAATAGTTGTAACTGTTTCTGATGGCCAGACACTTCATTTATCACAAGAATGGCGGCCATCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGATTCTGAAGAGAATGGTCTGCTGCGATTCAGCCAACCTGAAAGTCTGGATAACATAACCCTtggatttgacactatat > 1:350234‑M1/1‑234 (MQ=255) actggctggatgctacaccaggttgccgggcaacgagggagaccgtcatccgcggttcaaagcgctgctgaacaattgcgatcttatcctgtgtggtacgccgtctgcgtgactccggacctaagacatcaataatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcgcttagttaagtgatattggtagtctggagattcagggggccagtctaATCCTGAGGGATGACTAATCATTg < 2:321473‑M2/24‑1 (MQ=255) ggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAgg > 1:145734‑M2/225‑251 (MQ=255) cAACCCATTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATATTTCCCCGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgtt > 1:9832‑M1/1‑219 (MQ=255) acaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAAt < 2:145734‑M2/36‑1 (MQ=255) accatgttgccgggcaacgagggagacagtcatccccggttaaaagctctgatgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtccgcagtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGActaact > 2:234724‑M2/212‑249 (MQ=255) catgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCAGTGAGGAAATGGAAGAAATGt < 1:266670‑M2/42‑1 (MQ=255) atgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtcgggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGtt < 1:50005‑M2/43‑1 (MQ=255) gttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatatgggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTc < 1:145584‑M2/44‑1 (MQ=255) tgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGAc > 1:228189‑M2/205‑219 (MQ=255) tgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcagctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagggatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGAc < 2:228189‑M2/15‑1 (MQ=255) gACGAAGTTGAGTTTAAATATTTGCCCGGGCGAACGGGTCAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTGCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCGTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTTGAGAGAATGGTCTGCTGCGTATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATATCACAACCCTtggagttgcccctatattgccagacgtctgttatcacttaacccat < 2:182525‑M1/251‑47 (MQ=255) caacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGTATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGTCCttttt < 1:117752‑M2/54‑1 (MQ=255) gggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTGTTTAAAct < 2:332548‑M2/60‑1 (MQ=255) accgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgttgctccgtccctaagacatcaatcatcggttctccaatgactagtctaaaaactagtatgaagagtatcacttatttaagtgatagtgtttgtctgtagatgcagggggccagtctaTCCCTCAATGATGACTAATCATTGAGGTAATAGAATAAATGTTCAGACCTTGGTTAAACTCTCtt < 2:325909‑M2/65‑1 (MQ=255) ccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCgg < 1:108421‑M2/73‑1 (MQ=255) tcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAgttt < 1:181322‑M2/79‑1 (MQ=255) aagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGTCCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAgtttgttt < 1:29624‑M2/83‑1 (MQ=255) aaaTAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgata > 1:166659‑M1/1‑164 (MQ=255) aattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGc > 1:330946‑M2/155‑251 (MQ=255) gcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCAtt > 2:94448‑M2/151‑251 (MQ=255) gTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatg > 2:75063‑M1/1‑150 (MQ=255) tgtggtacgccgtctgcgtatctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactcgtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGt > 2:57541‑M2/137‑251 (MQ=255) cACTTCATTTATCACAACAATGTCCGCCCTCGTCAGAAAAGTCTTAAATTGTTGAAATAGCGAGCATAAGATGAATCTGGAGTGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatcggttatcacgtaacccagtgcaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcggtaacccagcgcacgatgcggatgccgttcgtg < 2:226205‑M1/250‑117 (MQ=255) acaacaATGGACGCCCTCTTCAGCCAAGTCTTAATTTGTTGTAATATCGAGCATTAGCTGAATCTGGAGAGTATGGTCTGCTGCGAATCAGGCAACCTGCAAGTATGGATAACACCACCCTtggatttgcccctatatttcccgaaatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagagataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacg > 2:305537‑M1/1‑121 (MQ=255) cAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGACTGGTCTGCTGCGAATCAGCCACCCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggctttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgttgcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgct > 1:228200‑M1/1‑101 (MQ=255) gAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGCAGAGAAAGGTCTGCTGCAAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatatgcccctatatttcccgacatctgttctcacttaacccattacaaccccgctgccgcagatactcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgacattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgc > 1:220444‑M1/1‑99 (MQ=255) aTTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgt > 2:126088‑M1/1‑88 (MQ=255) tgttgAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtct < 1:128667‑M1/250‑166 (MQ=255) gactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTTGTTTTTCCGTTTATTTCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTTATCCATTTTTATGGCCAAATTGTGGAACCGGCATGTGACGTCa < 1:222921‑M2/171‑1 (MQ=255) gAAATATCGAGCATAAGATGAATCTTGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAAACCTaggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcgaggttctttgatgccgttaaccagactggttt > 2:306815‑M1/1‑81 (MQ=255) agtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTGATCCATTTTTATGGCCAAATTGTGGAACCGGCATGTGACGTCAGCa < 1:338970‑M2/174‑1 (MQ=255) aaTATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggattggcccctgtagttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagagattcccttggcgagcgataacccagcgtagtatgcggatgccagtcgttatgatgctcgaacgcctgggcaaggtgctttgctgccgttaacccgtctggtttgg < 1:143678‑M1/251‑173 (MQ=255) atCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggc > 1:312522‑M1/1‑76 (MQ=255) cGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccagtacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggttgccattcgttataatgctcgaacgcctcggcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatg < 1:223063‑M1/251‑178 (MQ=255) ggAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCCgggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgatcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttagcccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgc < 1:305537‑M1/251‑196 (MQ=255) gagagaATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgct > 1:69466‑M1/1‑55 (MQ=255) agagaATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctt < 2:343037‑M1/251‑198 (MQ=255) acttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGTAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTGATCCATTTTTATGGCCAAATTGTGGAACCGGCATGTGACGTCAGCGCGCAGTCATCACCCGTAGAAATGAACTGc < 1:116258‑M2/203‑1 (MQ=255) agaATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgc < 2:153231‑M1/175‑124 (MQ=255) agaATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgc > 1:153231‑M1/1‑52 (MQ=255) aTGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcg < 2:339445‑M1/251‑203 (MQ=255) gctgcGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttca < 1:133167‑M1/250‑209 (MQ=255) tCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctct > 1:319864‑M1/1‑34 (MQ=255) cAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataattctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatgctgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgct < 1:133988‑M1/251‑223 (MQ=255) cagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTGATCCATTTTTATGGCCAAATTGTGGAACCGGCATGTGACGTCAGCACCCAGTCATCACCCGTAGAAATGAACTGCCCACAGAATGGTTCTATTCCGGGCAAATCCTa < 2:111681‑M2/235‑1 (MQ=255) gTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttac < 2:166659‑M1/251‑233 (MQ=255) tATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatcctgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttact > 1:176651‑M1/1‑18 (MQ=255) aTGGATAACACAACCCTtggatttgccactatatttccagacatatgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactc > 2:46508‑M1/1‑17 (MQ=255) aaCACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctgttttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccgga < 1:342404‑M1/251‑241 (MQ=255) acacAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggagagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttcttagctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggac < 1:221803‑M1/251‑242 (MQ=255) | AGCAAGAAAAGACCCTTTCATTGCCTGCTAATCAACCCATTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATATTTCCCCGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTGATCCATTTTTATGGCCAAATTGTGGAACCGGCATGTGACGTCAGCACCCAGTCATCACCCGTAGAAATGAACTGCCCACAGAATGGTTCTATTCCGGGCAAAACCTACTCCAGCAAAG > NC_000913/1105130‑1105621 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |