| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 803,869 | 0 | G | T | 26.7% | 49.8 / 18.4 | 46 | V123L (GTG→TTG) | ybhJ | putative hydratase YbhJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/30); new base T (12/0); total (16/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.58e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTAT‑CCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCT > NC_000913/803628‑804116 | gtctTCGCATAATACGTCCGGACATATGGTTAAACTTAAACTTATGTTTGATTCATTAGCATCTCACTATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCAGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGTCGGCACTATAACCGGTTCTGACCATGTTTTTGGTTTAGCGGCGTCACAGTGTTCTGTCTGGTATTTTTATGCCttct > 2:290490/2‑248 (MQ=255)ctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGGATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATCGAACGGTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACGCTGCGCCGTCGGCGGCACTATGAACGGTGATGACCGTGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTGTGTGCCTcc < 2:182606/249‑1 (MQ=255) ttCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGGATTTTTTTGCCTccccct > 1:114365/1‑246 (MQ=255) cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTGAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑atat < 2:483220/250‑1 (MQ=255) cATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTTATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATGGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGc < 2:127093/251‑1 (MQ=255) tCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGGTTTTTTTTTCCTCCCC‑ATATTTCgggcctccc > 1:514890/1‑244 (MQ=255) ccGGAAATATGGATAAACTTAAAATTGAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCACAGCGTTTTGGC‑GGAAGTTTTTTGCACCCGC‑ATATTTCGGGca‑tgcc > 1:211653/1‑247 (MQ=255) aaTATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCa < 1:13619/248‑1 (MQ=255) ggATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCTTTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGc < 2:137736/251‑1 (MQ=255) gATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGGATTTTTTTGCCTCCGC‑ACATTTCGGTca‑tacatatatagga > 1:417286/1‑240 (MQ=255) gATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTGGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTca‑tccat < 2:417286/240‑1 (MQ=255) aTTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGGATTTTTTTGTCTCCCC‑GTACTTAGGTCA‑TCCCTTAAAATATGTGTGAGATGATggg > 2:394097/1‑250 (MQ=255) ttGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCTGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAggcgg < 1:351112/250‑1 (MQ=255) ttGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAggcgg < 2:114365/250‑1 (MQ=255) ccACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCg < 1:524177/250‑1 (MQ=255) gATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTTTGCCTCCGC‑ATATTTCGGTCA‑TCCCTCAAAATATGCGGGGGGTGATTGGAGGCGGGGG‑C‑AAAAAGATCCTCGGGtt > 1:439920/1‑250 (MQ=255) atTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGGCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCGGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATGGTCGGCCCATCTTTATGGC‑GGTATTTTTGGGCCTCCGC‑ATAGTTCGTTCA‑TCCATGAAGATATGCGGGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAg < 1:39772/250‑1 (MQ=255) aCCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGAATGGAACGTTTCCCGATGCCGTATGTGATGACCAACTGCCATAACTCACTCTGAGCCGTCGGCGGCACTATTACCGGTGATGACAATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCAAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCACCCGC‑AAATTGAGGTAAATCC‑TTAATAATTGCGTGAGAAGGTTGCAGGCGGCGGAC‑AAAAtatcccacagacagac > 1:68063/1‑234 (MQ=255) tttGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑CTTTTTCGGGCA‑TCCCTCAATATATGCGTGGGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCCCCGGTCAGACAGccc > 1:428997/1‑250 (MQ=255) ggtgGTATTTTCCAGTCCGCAAAAGGGTGCGGTATGAAGCGGTGCCCGCTGCCGTATGTGCGGACCATCTGCCATAACTCCCTGTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTAGTTTGGTGCCTCCGC‑AGATTGCGGTAA‑TCCATCAATATATGAGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAAGGATCCTCGGGTCAGACAggaaca < 2:385336/248‑6 (MQ=255) aTTGTACAGCCCGATAAAGCGTCCGGAATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGGATTTTTTTGTCTCCCCCTTATT‑CGGTCC‑TCCATCAATATATTCGTGAGATGGTGGCAGGGGGCGG‑CCACAAT‑ATCCTCGGGTCAGACACCCCCACCCgctt > 1:440880/1‑248 (MQ=255) gTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTTTGCCTCCCC‑ATATTTCGGTCA‑TCCCTCAATAATTGGGTGGGAGGATGGCAGGGGGGGG‑C‑AAAATGATCCTACGGTCAGACAGCCACACCCGTTACgg > 1:304458/1‑251 (MQ=255) aCAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGt < 1:67243/250‑1 (MQ=255) aaaGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCGGCCGTATGTGCTGACCACCTGCCATAACTCACGCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGAc < 2:439920/251‑1 (MQ=255) cGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTTTTTTTTTGGCTCCGC‑AAATTTAGGGCC‑TCCATCCATATATGCGTGGGATGATGGGAGGGGGGGG‑C‑AAAAAGATCCTCCGGGCAGACAGCCACCCCCCGTACGGGGCATTTGGGACAAAGGccg > 1:472102/1‑249 (MQ=255) gTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTTTTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGGCC‑TCCCTCCATATATTCGTGAGATGATGGCAGGGGGCGG‑C‑AAAAAGATACTCGGGGCAGACAGACACACCCGGTAAGGGGCATTAGGGACAATGGCAGGCGGTGAGGGcggcggggggtggg > 1:63980/1‑243 (MQ=255) gACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAg < 1:394097/250‑1 (MQ=255) aTAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGac < 1:460543/251‑1 (MQ=255) gcCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTTTGGCCCCCC‑CTATTTCGGTCA‑TCCCTCAATATATGCGTGGGGTGGTGGCAGGGGGGGG‑C‑AAAATGATCCCCGGGTCAGACAGCCCCACCCGTTACGGGGGATTAGGGGCAAAGGCAGTCGGGGGGGGGGGCGGGGGGGTTGTAAAACAACGGCTTTATGACACCTGGGGTATCgc > 1:261796/1‑250 (MQ=255) ccGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGAc < 1:320422/251‑1 (MQ=255) gTCGGCGGCACTATTATCGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTa < 1:410962/251‑1 (MQ=255) gcACTATTAACGGTGAGGACCATGTTTTTGGTTTAGCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTAT‑CCGGGc < 2:434889/251‑1 (MQ=255) tATTAACGGCGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTTTGGCTCCCC‑CTATTTCGGGCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGGAGGGGGCGG‑C‑AAAAAGATTCTCGGGGCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGGATTAGGGACAATGGCCGGCGGGGGGGGGGGCGGGGGGGTGGGAAAAAAACTGCTTAATAACAACCGGGGTATCGACTATTCCggggggg > 1:134695/1‑247 (MQ=255) tAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTAT‑CCGGGCGTgatt < 1:11749/250‑4 (MQ=255) ggTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTAT‑CCGGGCGTGGTTGCGGt < 2:211719/251‑1 (MQ=255) atgaCCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATAGGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTGAATGACACCTGGGATATCGACTAT‑CCGGGCGGGGTTGCGGTGCAt < 2:440880/251‑1 (MQ=255) ccATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTaa < 1:267308/204‑1 (MQ=255) aggTTTTTGGTTGATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTAT‑CCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGAcc < 2:514890/249‑1 (MQ=255) gTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTTTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCCTCAATATATGCGGGAGGTGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGGCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGGCGGTGGGGGCGGCGGTGGGGTGGGAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCCACTAT‑CCCGGCGGGGGTGCGGGGCCTCTGACCGGaaaaacc > 1:72460/1‑248 (MQ=255) ttATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGTATATCGACTAT‑CCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTg < 1:502364/250‑1 (MQ=255) tATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTAT‑CCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTgc < 1:118214/250‑1 (MQ=255) cggcggCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTAT‑CCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGcc < 1:164172/250‑1 (MQ=255) gcCCAGCGTTATGGC‑GGTATGTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TACATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGTATATCGACTAT‑CCGGGCGTGGTTGCGGGGCATCTGACCTTAAAACCTGCGCCGTAtgt < 2:472102/251‑1 (MQ=255) gaTTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTAT‑CCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTgg < 2:134695/250‑1 (MQ=255) aTTTTTGTGCCTCCGC‑GTATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAAGGATCCTCGGGTGAGGCAGGCACTCCCGTTACGGTGCAGTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACTCCTGGGATATCGACTAT‑CCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTTACCGGAAAACCTGCGTCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGgc < 1:387691/251‑1 (MQ=255) ttGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGGTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTAT‑CCGGGCGTGGTTGCGGTTCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCt < 1:470901/250‑1 (MQ=255) | CTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGCTAAAGCGTCCGGTATGGAACGTTTCCCGCTGCCGTATGTGCTGACCAACTGCCATAACTCACTCTGCGCCGTCGGCGGCACTATTAACGGTGATGACCATGTTTTTGGTTTATCGGCGGCCCAGCGTTATGGC‑GGTATTTTTGTGCCTCCGC‑ATATTGCGGTCA‑TCCATCAATATATGCGTGAGATGATGGCAGGCGGCGG‑C‑AAAATGATCCTCGGGTCAGACAGCCACACCCGTTACGGTGCATTAGGGACAATGGCAGTCGGTGAGGGCGGCGGTGAGTTGGTAAAACAGCTGCTTAATGACACCTGGGATATCGACTAT‑CCGGGCGTGGTTGCGGTGCATCTGACCGGAAAACCTGCGCCGTATGTGGGGCCACAGGATGTGGCGCT > NC_000913/803628‑804116 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |