New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1772077 = | 41 (0.790) | 3 (0.060) | 3/488 | 4.1 | 5.4% | coding (1007/1215 nt) | ydiM | putative exporter YdiM |
? | NC_000913 | 3403856 = | 65 (1.250) | coding (373/975 nt) | yhdH | acrylyl‑CoA reductase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCGCTGCCATCGGTTTTTTACTGGCACTGTTTATCGGCTTACGCAGCCGCAAAAAAACGCGGCATCACTCGCTAAAGGAAAATGTCGCTCCGGGTGGGTAATGCAATATTCTTTTCAGGTCATGCAAGATCTTACGGATA > NC_000913/1771828‑1772324 | acacCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATCATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAACGCTAc > 2:290775/1‑250 (MQ=255) acacCGTGGGTCCGCTGATTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTCTTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAACCTAc > 2:484521/1‑250 (MQ=255) ccGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTTATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTGACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTTACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAggg < 1:521143/251‑1 (MQ=255) gctTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCTTTCTCCCAACAACATTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACAGTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTGGTCATTGGTGTTGCCTCTGCTGGAGGTGGTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAATCTACAGGGATCGATGACAGt < 2:446539/250‑1 (MQ=255) tttGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCg > 1:73400/1‑251 (MQ=255) ttGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTGTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAAGTGGCGTGGCGTTAATGGCTTAACGTTTGGCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCg < 1:491091/250‑1 (MQ=255) cGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGtt > 1:12264/1‑251 (MQ=255) gTTCGCCCAACAACATTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGc > 1:326052/1‑251 (MQ=255) gTTCGCCCAACAACATTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTGCCCTTTCGCTAAAGGGAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGc < 1:488788/251‑1 (MQ=255) acaacaGTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTTCGGGCAGGATTGCGACCTTTGCTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTc < 2:394932/251‑1 (MQ=255) aTTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGTGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCaaa < 1:269502/251‑1 (MQ=255) gATGCTGTACACCTATATATGCTTTCTTGCTCTGTTTACCACCTGCCTGCCTACAACATTTTCTGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGTCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTACATTACGATAAAGGTCAAGCTACAGGTGTCTCTTACAGTGCGGGCCGAATTGCGACCTTAACTATTCCGTTGCTTACGTCTCTTCTGTCCCAAAGAAGt > 2:241951/1‑250 (MQ=255) gCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTg < 2:75690/251‑1 (MQ=255) tATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTAtg < 2:12264/250‑1 (MQ=255) aTCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTAtgt < 1:391706/250‑1 (MQ=255) cATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGAGTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGtt < 2:116514/250‑1 (MQ=255) aTTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCg < 2:73400/251‑1 (MQ=255) tttACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCg < 2:326052/250‑1 (MQ=255) gTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGat < 1:168849/219‑1 (MQ=255) gTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGat > 2:168849/1‑219 (MQ=255) ctgcctgcATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCGCTg > 2:529316/1‑245 (MQ=255) ctgcctgcATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCGCTg < 1:529316/245‑1 (MQ=255) cctgcATCCCACAGTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAAGGTGCCGGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAATGTAAAGCTACAGGGATCTATGACATTGCGGGCGGTATTTGGATCTTTACTAGTCCGTTGAGTACGGCGCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGt < 1:258882/224‑1 (MQ=255) cctgcAACCCACATTTTGTGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTCTACATCTGCTGGAGGTGTTGTGCCAATTGGCCTGAAGTTCATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGCAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTCTTGCGACCTTTACTATTCCGTTGCTTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGCTCTTATGTGGt > 2:258882/1‑224 (MQ=255) ctgcATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCGCTGCCATCGGttt > 1:90115/1‑251 (MQ=255) 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tttGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTTTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGGGGTTCGATACCGCCATCGCTGCCATCGGTTTTTTACTGGCCCTGGTTATCGGCTTACGCAGCCGCa < 2:439638/250‑1 (MQ=255) ttttACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCGCTGCCATCGGTTTTTTACTGGCACTGTTTATCGGCTTCCGCAGCCGCAAACAAACGCGGc > 2:168577/1‑251 (MQ=255) ctgctgGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCGCTGCCATCGGTTTTTTACTGGCACTGTTTATCTGCTTACGCAGCCGCAAAAAAACGCGGCATCACt < 1:290775/249‑1 (MQ=255) gctgGAGGAGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCGCTGCCATCGGTTTTTTACTGGCACTGTTTATCGGCTTACGCAGCAGCAAAAAAACGCGGCCTAACTCGCt > 2:173133/1‑251 (MQ=255) tgtgCAAATTGGCCTGACGTTAAGGGCTTAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGGGGTTCGATACCGCCATCGCTGCCATCGGTTTTTTTCTGGCACTGTTTATCGGCTTACGCAGCCGCAAAAAAACGCGGCATCACTCGCTAAAGGAAAAt < 1:484521/250‑1 (MQ=255) ggCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCGCTGCCATCGGTTTTTTACTGGCACTGTTTATCGGCTTACGCAGCCGCAAAAAAACGCGGCATCACTCGCTAAAGGAAAATGTCGCTCCGGGTGGGTAATGCAat > 1:415256/1‑250 (MQ=255) gAACGTTTCCCTTAACCTAAAGGTAAACCTACAGGGATTTATTACAGAACGGGCCGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTCCGGCTCCTCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCGCTGCCATCGGTTTTTTACTGGCCCTGTTTATCGGCTTACGCCGCCGCAAAACAACGCGGCCTCCCCCGCTAAAGGAACATGTTGCTCCGGGTGGGTAATGCCATATTCt > 2:340018/1‑251 (MQ=255) aaCGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCCGCATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGATCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCGCTGCCATCGGTTTTTTACTGGCACTGTTTATCGGCTTACGCAGCCGCAAACAAACGCGGCATAACTCGCTCAAGGCAAATGTCGCTCCGGGCGGGTAATGCAATATTCtt > 2:323937/1‑251 (MQ=255) aCGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATAcc < 2:209702/122‑1 (MQ=255) aCGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATAcc > 1:209702/1‑122 (MQ=255) aaaGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCGCTGCCATCGGTTTTTTACTGGCACTGTTTATCGGCTTACGCAGCCGCAAAAAAACGCGGCATCACTCGCTAAAGGAAAATGTCGCTCCGGGTGGGTAATGCAATATTCTTTTCAGGTCATGCAAGATCTTACg > 1:42147/1‑251 (MQ=255) gCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCGCTGCCATCGGTTTTTTACTGGCACTGTTTATCGGCTTACGCAGCCGCAAAAAAACGCGGCATCACTCGCTAAAGGAAAATGTCGCTCCGGGTGGGTAATGCAATATTCTTTTCAGGTCATGCAAGATCTTACGGat < 2:90115/251‑1 (MQ=255) tACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCGCTGCCATCGGTTTTTTACTGGCACTGTTTATCGGCTTACGCAGCCGCAAAAAAACGCGGCATCACTCGCTAAAGGAAAATGTCGCTCCGGGTGGGTAATGCAATATTCTTTTCAGGTCATGCAAGATCTTACGGata > 2:412412/1‑250 (MQ=255) | ACACCGTGGGTTCGCTGCTTTGTGTATTTATTACCGCTCCACTCATTCGTAATACCGTTCGCCCAACAACATTACTGATGCTGTACACCTTTATCTCATTTATTGCTCTGTTTACCGTCTGCCTGCATCCCACATTTTATGTGGTGATAATATTTGCTTTTGTCATTGGTTTTACCTCTGCTGGAGGTGTTGTGCAAATTGGCCTGACGTTAATGGCTGAACGTTTCCCTTACGCTAAAGGTAAAGCTACAGGGATCTATTACAGTGCGGGCAGTATTGCGACCTTTACTATTCCGTTGATTACGGCTCATCTGTCCCAAAGAAGTATTGCCGATATTATGTGGTTCGATACCGCCATCGCTGCCATCGGTTTTTTACTGGCACTGTTTATCGGCTTACGCAGCCGCAAAAAAACGCGGCATCACTCGCTAAAGGAAAATGTCGCTCCGGGTGGGTAATGCAATATTCTTTTCAGGTCATGCAAGATCTTACGGATA > NC_000913/1771828‑1772324 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |