| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 798949 | 105 (1.590) | 3 (0.050) +A |
3/486 | 5.0 | 3.4% | coding (364/996 nt) | pgl | 6‑phosphogluconolactonase |
| ? | NC_000913 | = 4422834 | 68 (1.030) | coding (649/651 nt) | ulaD | 3‑keto‑L‑gulonate‑6‑phosphate decarboxylase UlaD | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CAGCCGATGGTGGTCAGCCCGGACAAACGTTATCTCTATGTTGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCATTCCGCCAATATCTCACCGGACAACCGTACGCTGTGGGTTCCGGCATTAAAGCAGGATCGCATTTGCCTGTTTACGGTCAGCGATGATGGTCATCTCGTGGCGCAGGACCCTGCGGAAGTGACCACCGTTGAAGGGGCCGGCCCGCGTCATATGGTATTCCATCCAAACGAACAATATGCGTATTGCGTCAATGAGTTAAACAGCTCAGTGGATGTCTGGGA > NC_000913/798700‑799196 | caggcGATGGTGGTCAGCCCGGACAAACGTTATCGCTATGTTGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGAGCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGGCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGAtgt < 2:397543/247‑1 (MQ=255)cAGCCGATGGTGGTCAGCCCGGACAAACGTTATCTCTATGTTGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGAtgt > 1:566763/1‑251 (MQ=255) aGCCGATGGTGGTCAGCCCGGACAAACGTTATCTCTATGTTGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGAtgtg > 1:53112/1‑251 (MQ=255) gCCGATGGTGGTCAGCCCGGACAAACGTTATCTCTATGTGGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGGAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTgg < 1:93835/251‑1 (MQ=255) aTGGTGGTCAGCCCGGACAAACGATATCTCTATGTTGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCgg > 1:156061/1‑250 (MQ=255) gtggtCAGCCCGGACAAACGTTAACTCTATGTTGGTGTTCTCCCTGAGTTTCGCGGCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAggg < 2:374477/251‑1 (MQ=255) gtCAGCCCGGACAAACGTTATCTCTATGTTGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCt < 1:642180/251‑1 (MQ=255) aGCCCGGACAAACGTTATCTCTATGTTGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTggg > 2:350854/1‑250 (MQ=255) gCCCGGACAAACGTTATCTCTATGTTGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGAc < 1:51549/251‑1 (MQ=255) ggACAAACGTTAGCTCTATGTTGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGtt < 2:241305/251‑1 (MQ=255) gACAAACGTTATCTCTATGTTGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTCTCGTATCGCCACGGACGATGGAGCACTGACCTTTGCCGCCGCGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGCCGTCGCTGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTg > 1:434121/1‑251 (MQ=255) aaCGTTATCTCTATGTTGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCAt > 1:347945/1‑251 (MQ=255) aCGTTATCTCTATGTTGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCAGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGAGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCAtt < 1:283192/251‑1 (MQ=255) tATCTCTATGTTGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCATTCCGc > 2:550134/1‑251 (MQ=255) ctATGTTGGTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCAACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGCTGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCATTCCGCCAat > 1:660007/1‑250 (MQ=255) ggTGTTCGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCATTCCGCCAATATCTCAc < 1:156200/250‑1 (MQ=255) tgtTCGACCTGCGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCACGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCATTCCGcaactatccaacagg > 2:337776/1‑237 (MQ=255) tcgccctgctcggcgcgTCCTTGCGTATCTTGTCGCCCCGGCCGATGGCGTATGGCCCTTCGCCGCAGAGT‑CTGCGCAGCCGGGTAGGCGGACGCATATTGCCACCGAACACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGTAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATCTGGTCGAGGGGCGGGACGGTTGCCTTTCCGCCAATATCTCACCGGAc < 2:367002/237‑1 (MQ=255) cGCCCTGAGTTTCGCGTCCTGTCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGTCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGGCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCATTCCGCCAATATCTCACCGGACaa < 2:69039/251‑1 (MQ=255) cTGAGTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCATTCCGCCAATATCTCACCGGACAACCgg > 2:141827/1‑250 (MQ=255) gtgTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCTCACTGACCTTTGCCGCAGAGC‑CTTCGCTGCCGGGTAGTCCTACGCATATTTCCACCGATCACCATGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGGGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCTTGCCAGTGGGCGTCGTCGAGGTGGTCTAGGGGCTGATCGGTTGCCATTCCGCCAATATCTCACCGGACAACCGt < 2:101826/247‑1 (MQ=255) gTTTCGCGTCCTGGCGTATCGTATCGCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCATTCCGCCAATATCTCACCGGACAACCGTACGc < 1:121369/251‑1 (MQ=255) 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cgtatcgCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCATTCCGCCAATATCTCACCGGACAACCGTACGCTGTGGGTTCCGGCATTaa < 1:350854/250‑1 (MQ=255) gtatcgCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAAAGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCATTCCGCCAATATCTCACCGGACAACCGTACGCTGTGGGTTCCGGCCTTaa > 2:422315/1‑249 (MQ=255) cgcgCCCCGGACGAGGGCGCACTGACCTTTGCCGCTG‑GTGCTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTGACAATGCGGGTAACGTGGGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTTGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCATTCCGCCAATATCTCACCGGACATCCGTACGCTGTTGGTTCCGGCATTAAAGCa < 2:660007/249‑1 (MQ=255) atcgCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGATGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCATTCCGCCAATATCTCACCGGACAACCGTACGCTGTGGGTTCCGGCATTAAAGc > 1:676373/1‑250 (MQ=255) cgCCCCGGACGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCGATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGAGGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCATTCCGCCAATATCTCACCGGACAACCGTACGCTGTGGGTTCCGGCATTAAAGCAgg < 2:652657/251‑1 (MQ=255) cGGAAGATGGCGCACTGACCTTTGCCGCAGAGT‑CTGCGCTGCCGGGTAGTCCGACGCATATTTCCACCTATCACCAGGGGCAGTTTGTCTTTGTAGGTTCTTACAATGCGGGTAACGTGAGCGTAACGCGTCTGGAAGAGGGCCTGCCAGTGGGCGTCGTCGATGTGGTCGAGGGGCTGGACGGTTGCCATTCCGCCAATAGCTCACCGGACAACCGTACGCTGTTGTTTCCGTCATTAAAGCAGGATCGc < 2:107391/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |