New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3052561 | 111 (1.680) | 3 (0.050) | 3/486 | 5.0 | 3.3% | coding (958/1179 nt) | ubiH | 2‑octaprenyl‑6‑methoxyphenol 4‑hydroxylase |
? | NC_000913 | = 4232178 | 66 (1.010) | coding (1056/1350 nt) | lysC | aspartate kinase III | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TTGCATTGTTTATTCCTTAAAACCGCCTTCAACGCGCCACCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTTTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGCGGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACT > NC_000913/3052312‑3052807 | ttGCATTGTTTATTCCTTAAAACCGCCTTCAACGCGCCACCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGGGAATAATTCCATCGGCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTGGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTcc < 1:400031/250‑1 (MQ=255) ttGCATTGTTTATTCCTTAAAACCGCCTTCAACGCGCCACCCAACCGAGGGTGCGCTGAGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATCATTCCATCGTCATCAGCACGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGAGACGCAAATGGTTGATTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTccc > 2:590538/1‑250 (MQ=255) aTTGTTTATTCCTTAAAACCGCCTTCAACGCGCCACCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGCCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGCTAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCgcgcc > 1:665728/1‑250 (MQ=255) gTTTATTCCTTAAACCCGCCTTCAACGCGCCCCCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCt < 2:187570/251‑1 (MQ=255) ttATTCCTTAAAACCGCCTTCAACGCGCCACCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGAGTGCCGCGGGGAATAATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGGCAACCAGCGGTGCCCCACGGTTGGCAAAGAGACGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTAGCGATCACTCTGTCGACGCTGCTGCTAACGGCAGAATACCTCGTCATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCCCCTgc > 2:22923/1‑251 (MQ=255) ttCCTTAAAACCGCCTTCAACGCGCCACCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGcc > 2:508821/1‑251 (MQ=255) aaaaCCGCCTTCAACGCGCCACCCCACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATCATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCt > 1:234662/1‑240 (MQ=255) aaaaCCGCCTTCAACGCGCCACCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTc > 2:30647/1‑251 (MQ=255) aaaaCCGCCTTCAACGCGCCACCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGTCAGCAGCCCGAGGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCGGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCTCTCCt < 2:234662/240‑1 (MQ=255) aaaCCGCCTTCAACGCGCCACCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTc > 2:526796/1‑250 (MQ=255) 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aaCCGCCTTCAACGCGCCACCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAg < 1:156320/251‑1 (MQ=255) cGCCTTCAACGCGCCACCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGGGCAGGGGTGAATAATTCCCTCGTAATCAGCCCGATGTTGGGCACGCCAAACAGCGGTGCCCAACGGTAGGCAACACGATGTACAATGCTGTCCGAGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCAGTATTCCTCCATGTCTTCTCTGCGCTCCTGCGCCTGAGTTAGGGt > 1:637838/1‑251 (MQ=255) gCCTTCAACGCGCCACCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCAAATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCAATCGTCATCAGCCCGATGTTGAGCCCGAAAACAAGCGGTGCCAAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCGACTGTTTGCTTCGGGATCGCTCTGGCGACGATGTTGATACCGGCACAAAACGCCGTAATACCCCATGTCTTCTCGGCGCTCCTGCGCCTGAGAAAGGGtt > 1:631247/1‑251 (MQ=255) 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aaCGCGCCACCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCTCCTGAGTCAGGGTGTCCGCa < 2:324907/251‑1 (MQ=255) aaCGCGCCACCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGc > 1:312890/1‑250 (MQ=255) ccgcCACCCAACCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGa < 2:133864/250‑1 (MQ=255) 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aCCGAGGGTGCGCTGCGCCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACAt > 1:246500/1‑251 (MQ=255) tgcgcCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCg > 1:364101/1‑249 (MQ=255) tgcgcCAGCACATCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCg > 2:507653/1‑249 (MQ=255) ccAGCACATGGAGTGCCGGGGTGAATAAGTCCATCGTCAACAGCCCGATGTTGCGACCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGAGCGCGCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCAGGTCGTCACCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTGCCGCAAGACACATCACATCTCGCAGCCCGAGGTTa < 2:519938/251‑1 (MQ=255) acaTCGCGTGCCGGGGCGAATAATTCCATCGTCATCAGCACGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAACAGATGTCCAAGGCTGTCCGTGACGCCACTGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATCACGGCCCAATCCGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCCAGAATCATCACATCTCGCCTACCGAGGTTAAAccc > 2:586541/1‑251 (MQ=255) caTCGCGTGCCGGGGTGAATAATTCCATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCt > 1:654752/1‑251 (MQ=255) 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ccATCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt > 1:578854/1‑251 (MQ=255) tCGTCATCAGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGCTGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTTTgc > 2:112448/1‑251 (MQ=255) aGCCCGATGTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTTTGCGCCGCAtt < 1:576044/251‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |