| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,549,224 | A→G | T375A (ACC→GCC) | yfeW → | penicillin binding protein 4B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,549,224 | 0 | A | G | 98.0% | 153.8 / ‑3.9 | 50 | T375A (ACC→GCC) | yfeW | penicillin binding protein 4B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (26/23); total (27/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.45e-01 | |||||||||||
GGCGTTTCCGGGCACGCAGGTTTGTTTTCCAATACCGGCGATATTGCGGTGTTAATGCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCCAGTCAGTAATGTTACTGGCTGGTCTGAGAGTGCTGACAAACGCAAAACTGCCT > NC_000913/2548978‑2549469 | ggcgTTTCCGGGCACGCAGGTTTGTTTTCCAATACCGGCGATATTGCGGTGTTAATGCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGGGAAGTGCAACTGTTCCATGCGGAAACGGGGAAGGTGTTCAACACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGGGAGTGAATGGTAATGGCACCCTGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAACCCGCAAACCTACGGTCACCCTGGCTGGGCCgg > 2:222498/1‑251 (MQ=255) gCACGCAGGTTTGTTTTCCAATACCGGCGATATTGCGGTGTTAATGCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAAAGGTGAAAATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGGCGCCGACGTTTTGCACGCTGGCAAGACCGCAAACCTACGGTCACCCTGGCTGGGCCGGAACGGCGAccc > 2:326325/1‑250 (MQ=255) cACGCAGGTTTGTTTTCCAATACCGGCGATATTGCGGTGTTAATGCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGGGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGt > 1:52031/1‑251 (MQ=255) aCGCAGGTTTGTTTTCCAATACCGGCGATATTGCGGTGTTAATGCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGtt > 1:280053/1‑251 (MQ=255) tttgtttTCCAATAACGGCGATATTGCGGTGTTAATGCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGAGCTGTCCAGCTGGTCAATGCGGACACGGCGAAGATGTTCACCACCCGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGAAATGCCAACATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCACGCCCGCCAACCTACGGTCACCCCGGCTGGGCCGGAAAGGGGACCCGTATCGacc > 2:229709/1‑249 (MQ=255) ttgtttTCCAATACCGGCGATATTGCGGTGTTAATGCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTTACCGTTATCGAT‑c < 1:131867/250‑1 (MQ=255) ccAATACCGGCGATATTGCGGTGTTAATGCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCGACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAAt < 2:243622/251‑1 (MQ=255) ccAATACCGGCGATATTGCGGTGTTAATGCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTATGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAAt < 2:260812/251‑1 (MQ=255) atattgagctgtcactGCAAACGATGCTGACCGGCGGGGGATATGGTGATGTGCGGCAGTTCAATGCGGAAACGGTGAAGCTGTTAACAACCCGCTCTTAGGAAGCTGCAACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCCTGACGCCGCCGTTTGGCACGCTGGCAAACCAGCAAACCTAAGGTCAAACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCatcttacgcat > 2:173773/16‑242 (MQ=255) ggTGTTAATGCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGt < 1:21359/251‑1 (MQ=255) ggTGTTAATGCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGTGCAGATGTTCAATGCGGAAACGGGGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGGCAACCTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGATTCCGG‑GAATCATATGGCGATTG‑GGATgg > 2:343478/1‑250 (MQ=255) ggTGTTAATGCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGAGCAGATGTTCAAAGCGGAAACGGTGGAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGTAAGATTCCCCCTTTGGACTCGGGTGGCGCGTGAATGGGAATGCCACCATGACGCCAACGATTTGCCCGCAGGCAAGCCTGCAAACCTACGGGCCCACTGGCTTGGCCGGGACAGTGACCGTTTTCGAT‑CCGGGGACTCatacgtagagtgggattg > 2:343488/1‑236 (MQ=255) tAATGCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGTGAAGATGGTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGGAATGCCACCCTGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAAAGGTGACCGGTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGAATG‑TGATGTTAAgg > 2:128991/1‑250 (MQ=255) gCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGCGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACCGCGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAACCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGcaac > 1:336836/1‑250 (MQ=255) cGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCca < 1:155936/251‑1 (MQ=255) gATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGGGCAGCTGGTCAATGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGGACGGTGACCGGTATCGAA‑CCGGGGAAATATAAGACGATTGGTGAT‑TTAAGGAAAAAGCcac > 2:243346/1‑251 (MQ=255) aTGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCCAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCcac > 2:17841/1‑250 (MQ=255) gggggCTATGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGc > 2:15355/1‑251 (MQ=255) ggggCTAGGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCGGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGTCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGcc < 1:155692/251‑1 (MQ=255) ggCTATGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGTGCAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGAAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGATGCCg > 1:353801/1‑250 (MQ=255) gATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGGGAAGATTTTCACCACCAGCTCTAAGGCAGATGCCACTTTTGGCCGGTCCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCCTGACGCCGCCGTGTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGGCAAACTGGCGGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCTGTGAATCATAGGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCaaaa < 2:62004/251‑1 (MQ=255) ttCAATGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAatat > 2:198125/1‑251 (MQ=255) cAATGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCTCTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAACCCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGt < 1:331781/251‑1 (MQ=255) aaTGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGtt > 1:75757/1‑251 (MQ=255) cGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCgg < 1:54328/162‑1 (MQ=255) cGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCgg > 2:54328/1‑162 (MQ=255) gTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCg > 1:49706/1‑250 (MQ=255) caccacCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGAGCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGAtt < 1:152853/250‑1 (MQ=255) caccaaCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGAttt > 2:23614/1‑250 (MQ=255) ctctAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATg > 2:62346/1‑251 (MQ=255) ctctAAGGAAGATGACACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATg > 1:261723/1‑251 (MQ=255) ccACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGAt < 2:373081/251‑1 (MQ=255) tgggcgtCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCGGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACGGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTGGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGgt < 2:191111/244‑1 (MQ=255) cgcGGCTGGCGCGTGGATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGTAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGGTTG‑TGATGTTAAGCAACTAGCCACATTCGCCTGTTTCCTATCCGCAAAAGAATCCGAATATGTTCGAAAGCTGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATgc < 1:240496/249‑1 (MQ=255) cgcGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATgc < 1:353822/249‑1 (MQ=255) cTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATgc > 2:62863/1‑251 (MQ=255) cGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTCCGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATgc < 1:120372/249‑1 (MQ=255) ggCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATgcggc < 1:116256/251‑1 (MQ=255) gAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTAGGCGGCGTTAAAGCAGa < 2:134657/251‑1 (MQ=255) aaaaggTAATGCCACCAGGCCGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAACCCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGa < 2:75757/247‑1 (MQ=255) cGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCCAGTCAGTAATg < 2:52031/251‑1 (MQ=255) tGGCACGCTGGCAAGCCCGCCCCCCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCCAGTCAGTAATGTTAc > 1:136350/1‑251 (MQ=255) cGCTGGCAAGCCCGCAATCCTACGGTCACGCTGGCTGGGCCGGAACGGTGGCCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTCATAAAAAGGCCAGTCAGTAATGTTActggcg < 1:343488/251‑2 (MQ=255) cGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCCAGTCAGTAATGTTActggct < 1:343478/251‑1 (MQ=255) aaaCCTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGATGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCCAGTCAGTAATGTTACTGGCTGGTCTGAGAGTGCTg > 1:225207/1‑251 (MQ=255) ccTACGGTCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCCAGTCAGTAATGTTACTGGCTGGTCTGAGAGTGCTGAc > 2:36915/1‑250 (MQ=255) tCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCCAGTCAGTAATGTTACTGGCTGGTCTGAGAGTGCTGACAAAc < 2:293733/247‑1 (MQ=255) tCACACTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCCAGTCAGTAATGTTACTGGCTGGTCTGAGAGTGCTGACAAAc > 1:293733/1‑247 (MQ=255) acTGGCTGGGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCCAGTCAGTAATGTTACTGGCTGGTCTGAGAGTGCTGACAAACGCAAAACt < 1:17841/251‑1 (MQ=255) gctggGCCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCCAGTCAGTAATGTTACTGGCTGGTCTGAGAGTGCTGACAAACGCAAAACTGCCt > 2:294951/1‑251 (MQ=255) | GGCGTTTCCGGGCACGCAGGTTTGTTTTCCAATACCGGCGATATTGCGGTGTTAATGCAAACGATGCTGAACGGCGGGGGCTATGGTGATGTGCAGCTGTTCAATGCGGAAACGGTGAAGATGTTCACCACCAGCTCTAAGGAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGAT‑CCGGTGAATCATATGACGATTG‑TGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCCAGTCAGTAATGTTACTGGCTGGTCTGAGAGTGCTGACAAACGCAAAACTGCCT > NC_000913/2548978‑2549469 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |