| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,040,126 | G→T | L277L (CTG→CTT) | appB → | cytochrome bd‑II subunit 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,040,126 | 0 | G | T | 98.1% | 175.6 / ‑6.2 | 52 | L277L (CTG→CTT) | appB | cytochrome bd‑II subunit 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (19/32); total (19/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
ATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTACTTCCAGTCAGCTGACGCTGAGCATTATGTTGGTAATCGTGCTGATATTTTTGCCCATTGTGTTGCTCTACACTCTCTGGAGCTA > NC_000913/1039881‑1040368 | aTTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGGTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGt > 1:303650/1‑251 (MQ=255) gCGTTCACAGCTGGCGACCGAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCGTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGc < 2:94491/249‑1 (MQ=255) cGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTTTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGGTGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTTTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGAt > 1:297742/1‑251 (MQ=255) ggCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCGGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTc < 2:375801/251‑1 (MQ=255) gACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGcc < 2:303650/251‑1 (MQ=255) aatcgcgCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTTCTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGGCTGGATGAATAAGT‑TGGTCGATTCGTCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGAGGCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCggg < 1:368318/248‑1 (MQ=255) aCGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGtt < 1:131114/251‑1 (MQ=255) gcgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTgg < 2:201866/251‑1 (MQ=255) gcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGAAGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGGAACTGGGGGCAGTGCTACCTGGGGCCTGGGTGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTTTGGATCTTCCCGCTGCTGGGTTTTTTCTGCCCCTTGCTTACGGGGATGGGGGTTTATCG‑TGGTCGCCCGGGGTgggg > 2:242361/1‑251 (MQ=255) cACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTTTACTGCTCGCCCCGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGGGCTACCTGGTGCCTGGCTGAATAATT‑TTTTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTTCTTTCGGGGATGGCGATTTTTCGGTGG‑CGCCCGGGGTGGGGAttt > 2:151404/1‑251 (MQ=255) tGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCCGGATGCTAACGGGCCTTCCAATCCGGTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGGTTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGc > 1:86120/1‑250 (MQ=255) gCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGAt < 2:198941/250‑1 (MQ=255) tGCTGTCGGGTTACTGGTTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCGATCCGTTAATGAAGCTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGCTGAATAATTGTTG‑CGAGTCGCCCGTTTGGTGGATCTTCCCGCTGCTGTGATTGTTCTGCCCATTGTTGACGGGGATGGCTATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAAtt < 1:214882/250‑1 (MQ=255) aCTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTc < 2:86120/251‑1 (MQ=255) tGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCAc > 1:277019/1‑251 (MQ=255) ggCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCa < 1:286645/249‑1 (MQ=255) tGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGt > 2:309928/1‑251 (MQ=255) ggCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTccc > 2:80965/1‑251 (MQ=255) gCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTcccc > 2:19697/1‑251 (MQ=255) cGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGc > 1:156340/1‑186 (MQ=255) cGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGc < 2:156340/186‑1 (MQ=255) gCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTc < 2:71968/251‑1 (MQ=255) aaCGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGGCAAGCGTGAGTcc < 1:309928/251‑1 (MQ=255) aCGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCg > 2:80409/1‑251 (MQ=255) ccTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGAtctc < 2:83150/251‑1 (MQ=255) ccAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAg < 1:80965/250‑1 (MQ=255) ccAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGc < 2:307534/251‑1 (MQ=255) gTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGGCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACgg > 2:219299/1‑250 (MQ=255) aCTGGTAGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCACGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTACTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGATGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCACGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGAc > 1:252215/1‑250 (MQ=255) ggtggCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTa < 2:99779/251‑1 (MQ=255) gCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTACTTc < 1:165859/251‑1 (MQ=255) gCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCAGCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTACTTCCAGt < 2:182856/250‑1 (MQ=255) aCCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTACTTCCAGTCAg < 1:168117/250‑1 (MQ=255) cTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTACTTCCAGTCAGCTGACGCTg > 1:334083/1‑250 (MQ=255) ggATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTACTTCCAGTCAGCTGACGCTGAGc < 1:140263/251‑1 (MQ=255) aTGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTACTTCCAGTCAGCTGACGCTGAGCAt < 1:30924/251‑1 (MQ=255) tGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGCGGCTCTTCCCGCTGCTGGGCTTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTCTCG‑TGGTCGCCCGGGCTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGCTTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGAGAGTCCGATCTCCAGCCTGAAGTTGAGGGACAGTACTTCCAGTCAGCTGACGCTGAGCAtt > 2:26551/1‑251 (MQ=255) tt‑ttGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTACTTCCAGTCAGCTGACGCTGAGCATTATGTTgg > 2:345948/1‑251 (MQ=255) ttGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCATACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTGCTTCCAGTCAGCTGACGCTGAGCATTATGTTGGt < 1:173502/250‑1 (MQ=255) ttGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGAGTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTACTTCCAGTCAGCTGACGCTGAGCATTATGTTGGt < 2:20379/250‑1 (MQ=255) aGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGATTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTAGTTCCAGTCAGCTGACGCTGAGCATTATGTTGGGAATCGTg < 1:128569/251‑1 (MQ=255) 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gctgGGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTACTTCCAGTCAGCTGACGCTGAGCATTATGTTGGTAATCGTGCTGATATTTTTGCCCATTGTGTTGctct < 1:345948/251‑1 (MQ=255) ccATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTACTTCCAGTCAGCTGACGCTGAGCATTATGTTGGTAATCGTGCTGATATTTTTGCCCATTGTGTTGCTCTACACTCTCTGGAGcta < 1:81767/251‑1 (MQ=255) | ATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATT‑TTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTGGGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCG‑TGGTCGCCCGGGTTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCACGCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTACTTCCAGTCAGCTGACGCTGAGCATTATGTTGGTAATCGTGCTGATATTTTTGCCCATTGTGTTGCTCTACACTCTCTGGAGCTA > NC_000913/1039881‑1040368 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |