| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 366,409 | C→T | intergenic (‑104/+19) | lacZ ← / ← lacI | beta‑galactosidase/DNA‑binding transcriptional repressor LacI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 366,409 | 0 | C | T | 99.3% | 3354.9 / NA | 944 | intergenic (‑104/+19) | lacZ/lacI | beta‑galactosidase/DNA‑binding transcriptional repressor LacI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (451/485); minor base G (0/7); total (451/493) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.59e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 946 total aligned reads displayed.
AGGGCGATCGGTGCGGGCCTCTTCGCTATTACGCCAGCTGGCGAAAGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTT‑GCG‑TATTGGGCGCCA‑GGGTGG‑TTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACA‑GCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCGAAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAA > NC_000913/366162‑366655 | gggCGATCGGTGCGGGCCTCTTCGCTATTACGCCAGCTGGCGAAAGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGCGCCTAATGAGTGAGCTAACTTACAt > 2:117969/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |