| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 71,912 | T→G | L188V (TTG→GTG) | yabI → | DedA family protein YabI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 71,912 | 0 | T | G | 93.8% | 37.2 / ‑5.8 | 16 | L188V (TTG→GTG) | yabI | DedA family protein YabI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (3/12); total (4/12) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
ATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGTGAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCT > NC_000913/71667‑72150 | aTCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGCTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCAAAATTCATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCACCGTTTTACTTCCTGCCTGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCAGCCGGAATGCCGAGCGGCGAGTTTAAATGGGTGCTGCTGGCGGCGGCGGGGTTTTtgggg > 2:130619/1‑248 (MQ=255) 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ATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGTGAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCT > NC_000913/71667‑72150 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |