| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,436,956 | 2 bp→TT | coding (202‑203/741 nt) | cysQ → | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,436,956 | 0 | C | T | 100.0% | 53.4 / NA | 18 | P68F (CCC→TTC) | cysQ | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (12/6); total (12/6) | |||||||||||
| * | NC_000913 | 4,436,957 | 0 | C | T | 100.0% | 55.5 / NA | 18 | P68F (CCC→TTC) | cysQ | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (12/6); total (12/6) | |||||||||||
CACCGCTCACAGAGACGAGGTGGAGAAATGTTAGATCAAGTATGCCAGCTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTCCCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGTGGTGTATGCGCCGGTAATGAACGTAATGTACAGCGCGGCAGAAGGCAAAGCGTGGAAAGAAGAGTGCGGTGTG > NC_000913/4436728‑4437168 || cacCGCTCACAGAGACGAGGTGGAGAAATGTTAGATCAAGTATGCCAGCTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGcc > 1:139522/1‑250 (MQ=255) cGCTCACAGAGACGAGGTGGAGAAATGTTAGATCAAGTATGCCAGCTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTg < 1:150254/251‑1 (MQ=255) ttAGATCAAGTATGCCAGCTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCt > 1:41879/1‑251 (MQ=255) ttAGATCAAGTATGCCAGCTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGACGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCt > 1:108996/1‑251 (MQ=255) cAAGTATGCCAGCTTACACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGGCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGTATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGTCTGGTACAGCCGCTTGATgg < 2:18623/251‑1 (MQ=255) tGCCAGCTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGGTGGGACTa > 2:172111/1‑250 (MQ=255) cTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTACGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTTGACCCGCTGGAAGGTAATAAAGAGtt > 2:137170/1‑251 (MQ=255) ttATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGGACTCAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAAtttccc > 2:64503/1‑247 (MQ=255) gCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGGAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGGGATTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGtt > 2:197907/1‑250 (MQ=255) gtcAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGAtttt > 1:84076/1‑251 (MQ=255) cGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCgtggtg > 1:1616/1‑251 (MQ=255) tCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGGTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGTGGTGTATGCGCCGGTAATGAACGGAATGTACAGCGCGGc > 2:132322/1‑249 (MQ=255) cacaCCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGTGGTGTATGCGCCGGTAATGAACGTAATGTACAGCGCGGCa < 2:22975/249‑1 (MQ=255) aTGGACGGTTTCCGTACGCTGACAACGGCTGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGCTGGGCAGTCCGTCAGCCCTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTACTGGCGACTTTCCCGTTAACATTGGGCTCCTTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGTGGTTTCTGCGCCGGGAATGAACGTAATGTACAGCGCGGCAGAAGGCCAAGCggg > 2:143429/1‑249 (MQ=255) tgACGGTTTACGTACGCTGACCCCGGATGTTCCGGGCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGTGGTGTATGCGCCGGTAATGAACGTAATGTACAGCGCGGCAGAAGGCAAAGCGTgg < 2:71366/249‑1 (MQ=255) cgtacgCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGCTGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCCAACCGATTTTAGGCGCGGTGTATGCGCCGGTAATGAACGTAATGTACAGCGCGGGCGAAGGCAAAGGGAGGGAAGAagaggg > 2:201920/1‑249 (MQ=255) gACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGTGGTGTATGCGCCGGTAATGAACGTAATGTACAGCGCGGCAGAAGGCAAAGCGTGGAAAGAAGAGTGCGgtgt < 1:23280/249‑1 (MQ=255) gACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGGTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGTGGTGTATGCGCCGGTAATGAACGTAATGTACAGCGCGGCAGAAGGCAAAGCGTGGAAAGAAGAGTGCGGtgtg < 1:148603/250‑1 (MQ=255) || CACCGCTCACAGAGACGAGGTGGAGAAATGTTAGATCAAGTATGCCAGCTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTCCCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGTGGTGTATGCGCCGGTAATGAACGTAATGTACAGCGCGGCAGAAGGCAAAGCGTGGAAAGAAGAGTGCGGTGTG > NC_000913/4436728‑4437168 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |