| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,827,026 | C→T | A606V (GCG→GTG) | recG → | ATP‑dependent DNA helicase RecG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,827,026 | 0 | C | T | 97.7% | 136.0 / NA | 44 | A606V (GCG→GTG) | recG | ATP‑dependent DNA helicase RecG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (17/26); total (18/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGCTGCTCTACAAAACGCCGCTTTCTAAAACGGCGCAAATTCGCCTGCAAGTGCTGCGCGACAGTAACGACGGTTTTGTGATTGCGCAAAAAGATCTGGAGATTCGCGGCCCTGGCGAATTGTTAGGCACGCGTCAGACGGGTAATGCTGAATTTAAAGTGGCGGATTTACTGCGCGATCAGGCGATGATCCCGGAAGTTCAGCGCCTGGCACGCCATATTCACGAACGTTACCCACAACAGGCAAAAGCCCTGATAGAACGCTGGATGCCGGAGACGG > NC_000913/3826780‑3827271 | acGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGCTGCTCTACAAAACGCCGCTTTCTAAAACGGTGCa > 1:263024/1‑250 (MQ=255) tGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGAGATGGCGTCGTTTAAACAAGGGGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGCTGCTCTACAAAACGCCGCTTTCTAAAACGGTGCAAATTCGCCTg > 1:63504/1‑251 (MQ=255) ggAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGCTGCGCTACAAAACGCCGCTTTCTAAAACGGTGCAAATTCGCCTg < 2:24303/250‑1 (MQ=255) gCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGCTGCTCTACAAAACGCCGCTTTCTAAAACGGTGCAAATTCGCCTGCAAGtgc < 1:256575/250‑1 (MQ=255) 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cGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGCTGCACTACAAAACGCCGCTTTCTAAAACGGTGCAAATTCGCCTGCAAGTGCTGCGCGACAGTAACGACGGTTTTGTGATTGCGCAAAAAGATCTGGAGATTCGCGGCCCGGGCGAATTGTTAGGCAcg < 2:215908/250‑1 (MQ=255) ggCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGCTGCTCTACAAAACGCCGCTTTCTAAAACGGTGCAAATTCGCCTGCAAGTGCTGCGCGACAGTAACGACGGTTTTGTGATTGCGCAAAAAGATCTGGAGATTCGCGGCCCTGGCGAATTGTTAGGCAcgcg > 1:104306/1‑251 (MQ=255) tGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCATCTGCGCGGGCGCGTAGGTCTTGGCGCGGTGGCTTCTCGCTGCGTGCTGCTCTACAAAACGCCGCTTTCTAAAACGGTGCAAATTCGCCTGCAAGTGCTGCGCGGCAGTAACGACGGTTTTGTGATTGCGCAAAAAGATCTGGAGATTCGCGGCCCTGGCGAATTGTTAGGCACGCGTCAg < 2:119324/250‑1 (MQ=255) 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ACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGCTGCTCTACAAAACGCCGCTTTCTAAAACGGCGCAAATTCGCCTGCAAGTGCTGCGCGACAGTAACGACGGTTTTGTGATTGCGCAAAAAGATCTGGAGATTCGCGGCCCTGGCGAATTGTTAGGCACGCGTCAGACGGGTAATGCTGAATTTAAAGTGGCGGATTTACTGCGCGATCAGGCGATGATCCCGGAAGTTCAGCGCCTGGCACGCCATATTCACGAACGTTACCCACAACAGGCAAAAGCCCTGATAGAACGCTGGATGCCGGAGACGG > NC_000913/3826780‑3827271 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |