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gATTGGCGGGGCGGTGGTG‑G‑GC‑TGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCG‑CCAACAGCAGCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCg < 2:224454/251‑1 (MQ=255) ggggcggTGGTG‑G‑GC‑TGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCG‑CCAACAGCAGCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCCCCCCC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGCTTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGCCAGCCGCATccc > 1:34050/1‑250 (MQ=255) ggggcggTGGTG‑G‑GC‑TGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCG‑CCAACAGCAGCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATccc > 1:262023/1‑250 (MQ=255) gggcggTGGTG‑G‑GC‑TGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCG‑CCAGCAGCAGCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCTCTCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCAt < 1:18123/251‑1 (MQ=255) ggcggTGGTG‑G‑GC‑TGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCG‑CCAGCAGCAGCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCAtt < 1:168313/251‑1 (MQ=255) ggtggtG‑G‑GC‑TGGATCCTGGCGTACGCCAACTATTCCG‑CCAACAGCAGCTTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAAc < 2:235806/251‑1 (MQ=255) 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ggATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCG‑CCAGCAGCAGCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCaa < 1:174584/249‑1 (MQ=255) gATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCG‑CCAGCAGCAGCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCCatat > 1:243555/1‑251 (MQ=255) tCCTGGCGTACGTCAACTATTCCG‑CCAGCAGCAGCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATgg > 2:134847/1‑251 (MQ=255) ggCGTACGTCAACTATTCCG‑CCAGCAGCAGCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAAt < 1:268629/251‑1 (MQ=255) cGTACGTCAACTATTCCG‑CCAACAGCAGCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTATAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATc > 2:215523/1‑250 (MQ=255) aCGTCAACTATTCCG‑CCAGCAGCAGCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATCACt < 2:288981/250‑1 (MQ=255) aaCTATTCCG‑CCAGCAGCAGCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATCACTAACCCg < 1:115742/251‑1 (MQ=255) cTATTCCG‑CCAACAGCAGCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATCACTAACCCGAt > 2:56505/1‑251 (MQ=255) cagcagcagCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATCACTAACCCGATACTCACCgg > 2:245990/1‑251 (MQ=255) | CGTCACCCCGGCGGAGCACATCGCGCTCATTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTG‑G‑GC‑TGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCG‑CCAGCAGCAGCGTGCAGCCGG‑TTGAGGTGCTCACCACC‑ATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGC‑TCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATCACTAACCCGATACTCACCGG > NC_000913/286324‑286817 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |