| New junction evidence | |||||||||||
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GGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGT > NC_000913/3720388‑3720883 | ggtacaattggtggcggaatggttgagcggaaggtgattgaagagtcgcttcaggcattgcaggaacgtaagccgcgattattccatggacgtatggctcgtaacggtgcggatgctgtcgggtcagattgtggaggtgcaatgtcagtatttatcagcgtccatggtatgcgtccacgtctggtgttgattggcgcggggcatgtcaaccgggcgatagcccagagtgcggcgctattaggattTGTACt < 2:242749‑M2/6‑1 (MQ=255) 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ccAACGAGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATc < 1:28889/250‑1 (MQ=255) ccAACGAGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATc < 1:15733/250‑1 (MQ=255) ttaggattTGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATcc > 1:5016‑M2/9‑249 (MQ=255) gattTGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTTCAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGtt > 2:258763‑M2/5‑251 (MQ=255) ccTGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGc > 1:10936‑M2/3‑251 (MQ=255) ccTGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCACAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGc > 2:274240‑M2/3‑251 (MQ=255) cTGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCg > 1:85901‑M2/2‑251 (MQ=255) tGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGt > 1:150423/1‑251 (MQ=255) | GGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGT > NC_000913/3720388‑3720883 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |