| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 256107 | 35 (1.480) | 19 (0.830) | 17/480 | 0.4 | 40.1% | coding (131/459 nt) | gpt | xanthine‑guanine phsophoribosyltransferase |
| ? | NC_000913 | 371382 = | 23 (1.010) | coding (144/867 nt) | mhpC | 2‑hydroxy‑6‑ketonona‑2,4‑dienedioate hydrolase | |||||
ACTGGCGTAGCGAAGGGCGTTATTACCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATCGGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGTTCTGTGGCGTTCACCCTTAAATGGCCGGAGCGCGTCG > NC_000913/371136‑371632 | aCTGGCGTAGCGAAGGGCGTTATTACCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAAAGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGGTCCGGCCCGGGGGCCActg > 2:124925/1‑251 (MQ=255) ggcttgtcGAAGGGCGTTATTACCGTCCAATCCCGTAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCTTCAGAACAGAAAAGTGATTATGCAGGAGAAGATGATTAGTTATCATCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGTCGTTTTCTGAATGTAGAAGTAGCGGTTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCTGACAAGGCGACGAAACTGTTTTCTTGCTGCATGGTTCTGGCCCGGGGGCTActggct < 2:141575/244‑1 (MQ=255) gAAGGGCGTTATTACCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTACGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAATCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGAGAACCCCTTTTAATGACTGCGGACAAGGAGACGAAACAGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGGGCTACTGGCTGGGCGaa > 2:195226/1‑250 (MQ=255) gTTATTACCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAAAACAGAGAAATGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGGTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACACTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCTACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCTGCCCGGGTGCTACGGGCTGGGCGAACTTCAGcc > 2:169977/1‑251 (MQ=255) gccagatctctataatctcgcgcaacctattttcccctcgaacactttttaagccgtagataaacaggctgggacacttcacatgagcgaaaaatacatcgtcacctgggacatgttgcagatccatgcacgtaaactcgcaagccgactgatgccttctgaacaatggaaaggcattattgccgtaagccgtggcggtctggtaccgggtgcTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGc > 1:144147‑M2/214‑251 (MQ=255) cGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCtt > 1:61373/1‑250 (MQ=255) ggATTTGGCTCGTAAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTAt < 2:76947/251‑1 (MQ=255) 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tACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATCGGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGGGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGTTCTGTGGCGTTCACCCTTAAATGGCCGGAGCGCGTCg > 1:211411/1‑251 (MQ=255) | ACTGGCGTAGCGAAGGGCGTTATTACCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATCGGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGTTCTGTGGCGTTCACCCTTAAATGGCCGGAGCGCGTCG > NC_000913/371136‑371632 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |