| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,279,276 | C→G | F121L (TTC→TTG) | kbaZ → | putative tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 1 chaperone |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,279,276 | 0 | C | G | 95.6% | 239.6 / NA | 68 | F121L (TTC→TTG) | kbaZ | putative tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 1 chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (36/29); minor base T (2/1); total (38/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
AACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAAT‑CAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCC‑GCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGATTCAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGC > NC_000913/3279036‑3279521 | aacacggtgccTGATTGAAGCAACC‑CCAATACAGGTAGACCATTTGGGCGGTTATCCCGAAATGCCGCCC‑GCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGATTGAAAAAAATcc < 1:534237/241‑1 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cTGCAGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAAATGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGACCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACAATTTGGCGAAGCAGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAATGCCGGGACCTGGCGgcgcgc > 1:540448/1‑250 (MQ=255) tCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTa > 1:565517/1‑250 (MQ=255) cAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAGCTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAg < 2:349249/251‑1 (MQ=255) atgCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGATTGAAAAAAATCCACCTGGGTTGCAGCAAGTCCTGTCAGGACGATACGATTCCCTTACCTGCTGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAGGTGGCGGCAGAAACCTGGCTTGAACACTTTGCAGGAACCGAACTGGAGGATGTCAATGGTCCAGCATTGCCGGTTCCTGGCGGCACGCTTTAAACATTaatggcactg > 2:154768/3‑243 (MQ=255) aaTGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAAAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGGATGTCCTTGGTACCGGAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTggaggg > 1:119981/1‑247 (MQ=255) gatgatTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGGATGTCCTTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTccacac > 2:436872/1‑246 (MQ=255) ttgattAAAAGATACGTTGCGGCCGGATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGGGAAGCCGATCTGGAGTATGTCCTTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCCTGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGGCCCCACGCCgg > 1:224338/1‑250 (MQ=255) cTACGTTGCGGCAGGATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTTGCGAAGCCGATCTGGGGTATGTCAATGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCggggggcgcccccg > 2:247852/1‑239 (MQ=255) aCGTTGCGGCAGGATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCcgcg < 2:565517/249‑1 (MQ=255) cGGCAGGATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGGACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGGCCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGGGACCACGCCGGAGGCCGCCCGCCCCACGCtt > 2:67438/1‑250 (MQ=255) ggCAGGATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTgg > 1:466779/1‑251 (MQ=255) gCAGGATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGa < 1:272813/251‑1 (MQ=255) gCAGGATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGGATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCCCGCCACGccgg > 2:239026/1‑247 (MQ=255) cAGGATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGa > 1:167493/1‑250 (MQ=255) cAGGATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCCCCCCGCTGGa > 2:415399/1‑250 (MQ=255) ggATTGAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGc > 1:473074/1‑251 (MQ=255) | AACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAAT‑CAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCC‑GCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGATTCAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGC > NC_000913/3279036‑3279521 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |