| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,238,948 | Δ1 bp :: IS186 (–) +6 bp :: Δ2 bp | coding (337‑342/1521 nt) | mglA ← | D‑galactose/methyl‑galactoside ABC transporter ATP binding subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2238948 = | 0 (0.000) | 53 (0.890) | 48/490 | 0.3 | 100% | coding (342/1521 nt) | mglA | D‑galactose/methyl‑galactoside ABC transporter ATP binding subunit |
| ? | NC_000913 | 2514275 = | NA (NA) | noncoding (3/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2238953 | 0 (0.000) | 59 (1.000) | 58/488 | 0.1 | 100% | coding (337/1521 nt) | mglA | D‑galactose/methyl‑galactoside ABC transporter ATP binding subunit |
| ? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
ATTTAAAAGTCCGGCCACATTCTATCCATGCATTAATGGGGGAAAACGGTGCAGGAAAATCGACATTATTAAAATGCCTGTTTGGTATTTATCAAAAAGACTCCGGCACCATTTTATTCCAGGGTAAAGAGATCGATTTCCATTCTGCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTATTTCGATGGTACACCAGGAGTTAAACCTGGTATTACAACGTTCGGTGATGGATAACATGTGGCTGGGGCGATATcc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2239192‑2238948‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGG > NC_000913/2514275‑2514520 ATTTAAAAGGCCGGCCACATTCTATCCATGCATTAATGGGGGAAAACGGTGCAGGAAAATCGACATTATTAAAATGCCTGTTTGGTATTTATCAAAAAGACTCCGGCACCATTTTATTCCAGGGTAAAGAGATCGATTTCCATTCTGCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTATTTCGATGGTACACCAGGAGTTAAACCTGGTATTACAACGTTCGGTGATGGATAACATGTGGCTGGGGCGATATCCATAA < 1:395235/251‑1 TTAAAAGTCCGGCCACATTCTATCCATGCATTAATGGGGGAAAACGGTGCAGGAAAATCGACATTATTAAAATGCCTGTTTGGTATTTATCAAAAAGACTCCGGCACCATTTTATTCCAGGGTAAAGAGATCGATTTCCATTCTGCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTATTTCGATGGTACACCAGGAGTTAAACCTGGTATTACAACGTTCGGTGATGGATAACATGTGGCTGGGGCGATATCCATAAG < 2:209372/250‑1 AAAGTCCGGCCACATTCTATCCATGCATTAATGGGGGAAAACGGTGCAGGAAAATCGACATTATTAAAATGCCTGTTTGGTATTTATCAAAAAGACTCCGGCACCATTTTATTCCAGGGTAAAGAGATCGATTTCCATTCTGCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTATTTCGATGGTACACCAGGAGTTAAACCTGGTATTACAACGTTCGGTGATGGATAACATGTGGCTGGGGCGATATCCATAAGCGCT > 2:53784/1‑251 GGCCACATTCTATCCATGCATTAATGGGGGAAAACGGTGCAGGAAAATCGACATTATTAAAATGCCTGTTTGGTATTTATCAAAAAGACTCCGGCACCATTTTATTCCAGGGTAAAGAGATCGATTTCCATTCTGCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTATTTCGATGGTACACCAGGAGTTAAACCTGGTATTACAACGTTCGGTGATGGATAACATGTGGCTGGGGCGATATCCATAAGCGCTAACTTA > 2:102081/1‑250 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ACGGTGCAGGAAAAGCGACATTATTAAAATGCCTGTTTGGTATTTATCAAAAAGACTCCGGCACCATTTTATTCCAGGGTAAAGAGATCGATTTCCATTCTTCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTATTTCGATGGTACACCAGTAGTTAAACCGGGTATTACAACGTTCGGTGATGGATAACATGTGGCTGGGGCGATAGCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTTGTATTTCGCCTGATATGATTTAACG < 2:565503/251‑1 GTGCAGGAAAATCGACATTATTAAAATGCCTGTTTGGTATTTATCAAAAAGACTCCGGCACCATTTTATTCCAGGGTAAAGAGATCGATTTCCATTCTGCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTATTTCGATGGTACACCAGGAGTTAAACCTGGTATTACAACGTTCGGTGATGGATAACGTGTGGCTGGGGCGATATCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGC > 1:216447/1‑251 CAGGAAAATCGACATTATTAAAATGCCTGTTTGGTATTTATCAAAAAGACTCCGGCACCATTTTATTCCAGGGTAAAGAGATCGATTTCCATTCTGCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTATTTCGATGGTACACCAGGAGTTAAACCTGGTATTACAACGTTCGGTGATGGATAACATGTGGCTGGGGCGATATCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCG > 1:43138/1‑250 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TCCAGGGTAAAGAGATCGATTTCCATTCTGCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTATTTCGATGGTACACCAGGAGTTAAACCTGGTATTACAACGTTCGGTGATGGATAACATGTGGCTGGGGCGATATCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGAT > 2:155915/1‑250 CAGGGTAAAGAGATCGATTTCCATTCTGCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTATTTCGATGGTACACCAGGAGTTAAACCTGGTATTACAACGTGCGGTGATGGATAACATGTGGCTGGGGCGATATCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTTCCGATGAATTACTCTCACGAGAACTGGTCAGCAATCCTGGCCCAGATTGGTAAGTCCGAAGAGCTGGATACT < 2:280938/251‑1 gAAAGAGATCGATTTCCATTATGCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTAGTTCGATGGTACACCAGGAGTTAAACCTGGTATTACAACGTTCGGGGATGGATAACATGTGGCTGGGGCGATATCCATAGGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCtgc < 2:396923/250‑4 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AGATCGATTTCCATTCTGCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTATTTCGATGGTACACCAGGAGTTAAACCTGGTATTACAACGTTCGGTGATGGATAACAGGTGGCTGGGGCGATATCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTA < 1:492485/251‑1 gagTTCCATTCTGCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTATTTCGATGGTACACCAGGAGTTAAACCTGGTATTACAACGTTCGGTGATGGCTAACATGTGGCTGGGGCGATATCCATAAGCGCTAATTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAATCCCGAAGAACTGAATACTTCGGCACGTAATGCC > 2:403810/4‑251 ATTTCCATTCTGCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTATTTCGATGGTACACCAGGAGTTAAACCTGGTATTACAACGTTCGGTGATGGATAACATGTGGCTGGGGCGATATCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCG > 2:157610/1‑251 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ATGGATAACATGTGGCTGGGGCGATATCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCA < 2:216447/251‑1 TGGATAACATGTGGCTGGGGCGATATCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCAT > 1:155362/1‑251 GATATCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGG > 1:10225/1‑251 ATTTAAAAGTCCGGCCACATTCTATCCATGCATTAATGGGGGAAAACGGTGCAGGAAAATCGACATTATTAAAATGCCTGTTTGGTATTTATCAAAAAGACTCCGGCACCATTTTATTCCAGGGTAAAGAGATCGATTTCCATTCTGCAAAAGAAGCCCTGGAAAATGGTATTTCGATGGTACACCAGGAGTTAAACCTGGTATTACAACGTTCGGTGATGGATAACATGTGGCTGGGGCGATATcc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2239192‑2238948‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGG > NC_000913/2514275‑2514520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |