| Read alignment evidence... | |||||||||||
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cGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCG‑TATT‑GGGTG‑CCAGGG‑TGGTTTTTCTTTTCACC‑A‑GTGAGACGGG‑CAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCC‑TGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCG‑AAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGCTGTCTTCGGTATCGTCGTATcc < 1:225855/251‑1 (MQ=255) cGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCG‑TATT‑GGGCG‑CCAGGG‑TGGTTTTTCTTTTCACC‑A‑GTGCGACGGG‑CAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCC‑TGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCG‑AAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGCTGTCTTCGGTATCGTCGTATc < 1:17438/250‑1 (MQ=255) cGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCG‑TATT‑GGGCG‑CCAGGG‑TGGTTTTTCTTTTCACC‑A‑GTGAGACGGG‑CAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCC‑TGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCG‑AAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGCTGTCTTCGGTATCGTCGTATcc < 1:93651/251‑1 (MQ=255) ggAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCG‑TATT‑GGGCG‑CCAGGG‑TGGTTTTTCTTTTCACC‑A‑GTGAGACGGG‑CAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCC‑TGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCG‑AAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGCTGTCTTCGGTATCGTCGTATCCCa < 2:99252/251‑1 (MQ=255) aTTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCG‑TATT‑GGGCG‑CCAGGG‑TGGTTTTTCTTTTCACC‑A‑GTGAGACGGG‑CAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCC‑TGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCG‑AAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGCTGTCTTCGGTATCGTCGTATCCCACTACCGAGATATCCGCACCAAc < 2:289752/251‑1 (MQ=255) cGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCG‑TATT‑GGGCG‑CCAGGG‑TGGTTTTTCTTTTCACC‑A‑GTGAGACGGG‑CAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCC‑TGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCG‑AAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGCTGTCTTCGGTATCGTCGTATCCCACTACCGAGATATCCGCACCAACGCGCAGCCCg < 1:336312/251‑1 (MQ=255) 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g‑TATT‑GGGCG‑CCAGGG‑TGGTTTTTCTTTTCACC‑A‑GTGAGACGGG‑CAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCC‑TGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCG‑AAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGCTGTCTTCGGTATCGTCGTATCCCACTACCGAGATATCCGCACCAACGCGCAGCCCGGACTCGGTAATGGCGCGCATTGCGCCCAg < 1:42669/251‑1 (MQ=255) aTT‑GGGCG‑CCAGGG‑TGGTTTTTCTTTTCACC‑A‑GTGAGACGGG‑CAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCC‑TGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCTCGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCG‑AAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGCTGTCTTCGGTATCGTCGTATCCCACTACCGAGATATCCGCACCAACGCGCAGCCCGGACTCGGTAATGGCGCGCATTGCGCCCAgcg < 1:232606/251‑1 (MQ=255) gggCG‑CCAGGG‑TGGTTTTTCTTTTCACC‑A‑GTGAGACGGG‑CAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCC‑TGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCG‑AAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGCTGTCTTCGGTATCGTCGTATCCCACTACCGAGATATCCGCACCAACGCGCAGCCCGGACTCGGTAATGGCGCGCATTGCGCCCAGCGcc < 2:154507/250‑1 (MQ=255) ggCG‑CCAGGG‑TGGTTTTTCTTTTCACC‑A‑GTGAGACGGG‑CAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCC‑TGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCG‑AAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGCTGTCTTCGGTATCGTCGTATCCCACTACCGAGATATCCGCACCAACGCGCAGCCCGGACTCGGTAATGGCGCGCATTGCGCCCAGCGCCAt > 1:149712/1‑251 (MQ=255) ccAGGG‑TGGTTTTTCTTTTCACC‑A‑GTGAGACGGG‑CAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCC‑TGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCG‑AAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAAAATGAGCTGTCTTTGGTATTGGCGTATCCCACCACCCAGATATTCGCACCAACGCGCAGCCCGGACCCGGGAATGGCGCGCCTTTCGCCCCGCGccctccg > 2:72729/1‑245 (MQ=255) ggg‑TGGTTTTTCTTTTCACC‑A‑GTGAGACGGG‑CAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCC‑TGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCG‑AAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGCTGTCTTCGGTATCGTCGTATCCCACTACCGAGATATCCGCACCAACGCGCAGCCCGGACTCGGTAATGGCGCGCATTGCGCCCAGCGCCATCTGATCg < 1:125188/251‑1 (MQ=255) | GGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCG‑TATT‑GGGCG‑CCAGGG‑TGGTTTTTCTTTTCACC‑A‑GTGAGACGGG‑CAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCC‑TGGCCCTGAGAGAGTTGCAGCAAGCGGTCCACGCTGGTTTGCCCCAGCAGGCG‑AAAATCCTGTTTGATGGTGGTTAACGGCGGGATATAACATGAGCTGTCTTCGGTATCGTCGTATCCCACTACCGAGATATCCGCACCAACGCGCAGCCCGGACTCGGTAATGGCGCGCATTGCGCCCAGCGCCATCTGATCG > NC_000913/366279‑366773 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |