| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,452,701 | IS150 (+) +3 bp | coding (131‑133/1026 nt) | ytfT → | galactofuranose ABC transporter putative membrane subunit YtfT |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | 39 (1.130) | 32/486 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
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| * | ? | NC_000913 | = 3722075 | NA (NA) | 35 (1.010) | 27/488 | 0.4 | 100% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4452701 = | 0 (0.000) | coding (131/1026 nt) | ytfT | galactofuranose ABC transporter putative membrane subunit YtfT | |||||
GTGGGCTATGCCGATCGGGTGATTATCATGCGCGATCGCAAACAGGTGGCGGAGATCCCGCTGGCAGAGCTTTCCGTTCCGGCGATCATGAACGCCATTGCGGCGTAAGGAGAACAGTGTGATGCCTCAATCTCTTCCGGACACCACTACGCCAAAAAGGCGCTTTCGCTGGCCGACGGGGATGCCGCAGCTGGTAGCACTATTGCTGGTGCTGCTGGTCGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCTGGCGGGATTGTGGAACGGCATA > NC_000913/4452453‑4452951 | atgtccagaaaaggcaattgtctggataatgctgtggtggagtgtttctttggaaccttaaagtcggagtgtttttatcttgatgagttcagtaatataagcgaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaAgg < 1:147133‑M2/3‑1 (MQ=255)atgtccagaaaaggcaattgtctggataatgctgtggtggagtgtttctttggaaccttaaagtcggagtgtttttatcttgatgagttcagtaatataagcgaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaAgg < 2:205237‑M2/3‑1 (MQ=255)atgtccagaaaaggcaattgtctggataatgctgtggtggagtgtttctttggaaccttaaagtcggagtgtttttatcttgatgagttcagtaatataagcgaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaAgg < 1:163723‑M2/3‑1 (MQ=255)atgtccagaaaaggcaattgtctggataatgctgtggtggagtgtttctttggaaccttaaagtcggagtgtttttatcttgatgagttcagtaatataagcgaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaAgg < 2:84507‑M2/3‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |