| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,938,983 | IS2 (–) +5 bp | coding (757‑761/993 nt) | rbsR → | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3938983 = | 0 (0.000) | 48 (1.380) | 44/490 | 0.1 | 100% | coding (757/993 nt) | rbsR | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3938987 | 0 (0.000) | 29 (0.830) | 26/490 | 0.4 | 100% | coding (761/993 nt) | rbsR | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
| ? | NC_000913 | = 4499511 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
AATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAACCACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTCATCCATCGGATAACCCAGCCGACCCTTCAGCAACAACGATTACAACTTACTCCGATTCTGATGGAACGCGGTTCGGCTTAGATTTACGCTGTCT > NC_000913/3938735‑3939232 | attgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatagtggttgtctggagattcagggggccagtctaGtt > 2:15522‑M1/249‑251 (MQ=255) atgATAGATAAAGGGAATAACCGTATCGAATGTATTACCGGCCCGATGGATAAAACTCCGGCGCGCGTGCGGTTGGAAGGTTATAGGGAGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAAAATTCCTGATGGCTATGAAGTAACTGGTGATTGTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGTCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTATTTTCCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtg < 1:214735‑M1/249‑3 (MQ=255) agaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTtat < 1:235822‑M1/16‑1 (MQ=255) gaactgtctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccattctaGTTTACCAGGCGTTATATCAgg < 2:298589‑M1/22‑1 (MQ=255) actggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggacctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaaatagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGc < 1:221201‑M1/23‑1 (MQ=255) actggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccgggtcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacggatttaagtgatagtttttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCCTTATATCAGGCa > 2:352480‑M1/228‑251 (MQ=255) tggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaacaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGtt < 2:138418‑M1/29‑1 (MQ=255) cGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggatttgcccctatatttccagacatc < 2:342399‑M1/250‑29 (MQ=255) ccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagacgatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCa > 2:361876‑M1/211‑251 (MQ=255) aTTACCGGCCCGCTTGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGGTGGAAGGGTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGGCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatc < 2:78960‑M1/250‑36 (MQ=255) 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cgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACg > 2:241500‑M1/185‑251 (MQ=255) catccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGata > 2:216824‑M1/182‑251 (MQ=255) catccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGata > 1:347903‑M1/182‑251 (MQ=255) 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aagctctgctgaacaattgcgatcttgtcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGGTCCGCAGGATAGCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAg > 1:213429‑M1/169‑251 (MQ=255) gTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcactt < 2:196323‑M1/208‑40 (MQ=255) ctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATTACGATATCGAACTg > 2:170347‑M1/164‑241 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |