| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 92,162 | C→T | N250N (AAC→AAT) | ftsI → | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 92,162 | 0 | C | T | 98.7% | 264.3 / NA | 75 | N250N (AAC→AAT) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (47/27); total (47/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATCCGTCCGGCGAAGTGACTGCTCACCTCATCGGCTTTACTAACGTCGATAGTCAAGGGATTGAGGGCGTTGAGAAGAGTTTCGATAAATGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCG‑ATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCAT > NC_000913/91918‑92407 | atccatccGGCGAAGTGACTGCTCACCTCATTGGCTTTACTAACGTCGATAGTCAAGGGATTGAGGGCGTTGAGAAGAGTTTCGATAAATGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCTGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTg > 1:270520/1‑251 (MQ=255) ccatccgGCGAAGTGACTGCTCACCTCATTGGCTTTACTAACGTCGATAGTCAAGGGATTGAGGGCGTTGAGAAGAGTTTCGATAAATGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCTGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTGGc > 1:304079/4‑251 (MQ=255) atccgGCGAAGTGACTGCTCACCTCATTGGCTTTACTAACGTCGATAGTCAAGGGATTGAGGGCGTTGAGAAGAGTTTCGATAAATGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCTGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTGGCCt > 1:6434/2‑251 (MQ=255) tccgGCGAAGTGACTGCTCACCTCATTGGCTTTACTAACGTCGATAGTCAAGGGATTGAGGGCGTTGAGAAGAGTTTCGATAAATGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCTGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTGGCCtt > 1:292145/1‑251 (MQ=255) 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ATCCGTCCGGCGAAGTGACTGCTCACCTCATCGGCTTTACTAACGTCGATAGTCAAGGGATTGAGGGCGTTGAGAAGAGTTTCGATAAATGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCG‑ATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCAT > NC_000913/91918‑92407 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |