| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,380,367 | C→T | D51N (GAC→AAC) | frdB ← | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,380,367 | 0 | C | T | 96.0% | 236.9 / NA | 76 | D51N (GAC→AAC) | frdB | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base T (39/33); minor base G (0/3); total (40/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.06e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 | |||||||||||
TACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCAGTTTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCA > NC_000913/4380124‑4380613 | tACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCAGTTTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTTCGGTGcc > 1:457066/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |