| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,384,808 | C→T | K305K (AAG→AAA) | yfbK ← | IPR002035/DUF3520 domain‑containing protein YfbK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,384,808 | 0 | C | T | 95.7% | 143.6 / ‑4.0 | 47 | K305K (AAG→AAA) | yfbK | IPR002035/DUF3520 domain‑containing protein YfbK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/2); new base T (24/21); total (24/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.34e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TACTTTCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACC‑AGACTCCCGCTGTTTTTTGACCA‑TTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTT‑C‑GTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGAAGTTCTTTGACCAATAATTTCAACGAAGACTGGATAAGTGGCAAACGTTCATCAGAAATCATTGAACC > NC_000913/2384568‑2385050 | tACTTTCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACC‑AGACTCCCGCTGTTTTTTGACCA‑TTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑GTCGCct > 2:574509/1‑251 (MQ=255) aCTTTCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCACCATCGGCCATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACC‑AGACTCCCGCTGTTTTTTGACCA‑TTGCTTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑GTCGCctg > 1:370567/1‑251 (MQ=255) aCTTTCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCTCCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACC‑AGACTCCCGCTGTTTTTTGACCA‑TTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑GTCGCct < 2:17432/250‑1 (MQ=255) gagGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACC‑AGACTCCCGCTGTTTTTTGACCA‑TTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑GTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTcc > 2:194927/1‑250 (MQ=255) 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ttGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACC‑AGACTCCCGCTGTTTTTTGACCA‑TTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑GTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGc > 1:346458/1‑251 (MQ=255) aaTTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACC‑AGACTCCCGCTGTTTTTTGACCA‑TTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑GTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACt > 1:445116/1‑205 (MQ=255) gCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACC‑AGACTCCCGCTGTTTTTTGACCA‑TTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑GTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGAc > 1:352685/1‑251 (MQ=255) 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cGCTGTTTTTTGACCC‑TGAATTCAACCGTTTTGGGACCGTAAATCCCAACGTTAAAGTCCCCGTCAGTGTTAAATAAAATGCGATGGATGCCGCCCTAAATAACCCTTTT‑C‑GTCGCATGCTGATAACCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTa < 2:94977/251‑1 (MQ=255) gTTTTTTAACCA‑TTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑GTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGAACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTCTGTCTCCCGGCGGTAGCAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTc > 2:43223/1‑251 (MQ=255) gACCA‑TTGATTCAACCGATTTTGGATCGTCAATGCCAGCGTAAAAGTCACCGGCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑GTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATg < 1:326220/250‑1 (MQ=255) 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tGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑GTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCCCGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGa > 2:485036/1‑250 (MQ=255) tGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑GTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGa > 1:433299/1‑250 (MQ=255) cGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑GTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGAAGTTCTTTGACCaataat < 1:529993/251‑1 (MQ=255) 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aaaCCCTTT‑C‑GTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGAAGTTCTTTGACCAATAATTTCAACGAAGACTGGATAAGTGGCAAACGTTCATCAGAAATCATTGAAcc > 2:393306/1‑249 (MQ=255) | TACTTTCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACC‑AGACTCCCGCTGTTTTTTGACCA‑TTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGCTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTT‑C‑GTCGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGAAGTTCTTTGACCAATAATTTCAACGAAGACTGGATAAGTGGCAAACGTTCATCAGAAATCATTGAACC > NC_000913/2384568‑2385050 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |