| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 4,069,379 | IS1 (+) +9 bp | intergenic (‑103/+88) | yihQ ← / ← yihR | sulfoquinovosidase/putative sulfoquinovose mutarotase YihR |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | 52 (0.910) | 46/490 | 0.3 | 92.6% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4069387 | 4 (0.070) | intergenic (‑111/+88) | yihQ/yihR | sulfoquinovosidase/putative sulfoquinovose mutarotase YihR | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTCTTCAATGATTTTGACTGCTAATCAATACAAGTTATTTTCTCTGTCCGTAAATATTAAAAAACAGGCGGTGCGGTTTTCCTGATTCCAGTAATAATAAGTCGATACCTGAATTAAAGGCGTTAGGCGGGCAACTCATAGGTTCAACTGCCAGTCCCTGACGCTGTAATTTTTCACCGCTATAAACCTGCACC > NC_000913/4069140‑4069634 | acgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGCTGAGCTGttt < 1:125314‑M2/12‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |