| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,452,701 | IS150 (+) +3 bp | coding (131‑133/1026 nt) | ytfT → | galactofuranose ABC transporter putative membrane subunit YtfT |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | 96 (1.700) | 76/486 | 0.0 | 99.0% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4452703 | 1 (0.020) | coding (133/1026 nt) | ytfT | galactofuranose ABC transporter putative membrane subunit YtfT | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3722075 | NA (NA) | 64 (1.130) | 52/488 | 0.2 | 98.5% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4452701 = | 1 (0.020) | coding (131/1026 nt) | ytfT | galactofuranose ABC transporter putative membrane subunit YtfT | |||||
ATGTCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAa‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3721828‑3722075‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC‑GGAGCCACAACGGCTGCGA‑TGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCTGGCG > NC_000913/4452701‑4452933 atgaCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCTGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATAGCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGG < 1:365845/247‑1agGTCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACTGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGGGCTATATGCCGCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTAAGTACAAGG < 1:479708/249‑1ATGTCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATTCTGTTGTGGAGTGTTTTGTTGGAACCTTAAAGACGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATAGAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATGAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCTGACCTATATGCCTCGTGTTTAACGGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGG < 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1:51046/251‑1ATGTCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGG < 1:400011/251‑1ATGTCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGGTTCTTTGGAACCTTAAAGGCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGG < 2:444007/251‑1ATGTCCAGAAAAGGCAATTGGCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGG < 1:155718/251‑1 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TGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGC > 1:523225/1‑251 TCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGT > 1:408394/1‑251 GGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGCCATATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACACGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTt > 2:169255/1‑250 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GTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC‑GGAGGCACAACGGCTGCGG‑TGACGGT > 1:548334/1‑251 CTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGCGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC‑GGGGCCAACACCGCTGGGA‑TGACGGgcc > 1:31725/1‑248 GACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGGGGTGGCTATCGCC‑CGAGCCACAAAGGCTGCGC‑GGACGGGCGCG > 1:576994/1‑251 TCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC‑GGAGCCACAACGGCCGCGA‑TGgagggcgcgggg > 1:373602/1‑239 CGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC‑GGAGCCACAACGGCTGCGA‑TGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCG < 2:124878/250‑1 AATCAGACCTATATGCCTCGGGTTTAACTGTCCAACTTTTGGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTGTGGTCGGTAGCCCAATAGACATTCTTACCCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAGCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC‑GGAGCCACAACGGCTGCGA‑TGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTG < 2:56307/251‑1 ACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATTGGTATCGCC‑GGAGCCACAACGGCTGCGG‑TGGCGGGTGCGGGGTTCAGGCTGCCGGTTGGTTTtt > 2:107535/1‑249 CTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCCCCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATAGCTATCGCCCGGACCCACA‑CGCCTGCGACTG‑CGGGCGCGGGAGTCATCCCGCCGGTTGTTTTGTTt > 2:264178/1‑250 ATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGGGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCGCCGTAGGGGCGGTGATGGTTATCGCC‑GGAGCCACAACGGCTTCGA‑TGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGC < 1:271007/250‑1 GCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTTTCGCC‑GGAGCCCAAACGGCTGCGG‑TGGCGGGCGCGGGGTTCAGCCTTCCGGATGTTTTGTTAAGCGgc > 1:365450/1‑249 TAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC‑GGAGCCACAACGGCCGCGA‑TGACGGGCGCGGGGTTCCGCCTGCCGATTGTTTTTTTAAGCGCCCTGGGCACCc > 1:521534/1‑250 ACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGGGATGGGTATCGCC‑GGGGGCACAACGGCCGCGA‑TGGCGGGCGGGGGGGTCAGCCCGCCGGTTTTTTTttttaacgccccggggcccggg > 2:487391/1‑229 CTTTTTGGGGTCAGTACAAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC‑GGAGCCACAACGGCTGCGG‑TGGCGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGGTTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGGACCGGCATCCCGGCG > 1:199563/1‑251 ATGTCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAa‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3721828‑3722075‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC‑GGAGCCACAACGGCTGCGA‑TGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGATTGTTTTGTTAAGCGCCCTGGGCACCGGCATCCTGGCG > NC_000913/4452701‑4452933 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |