| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,805,802 | IS1 (+) +9 bp | coding (988‑996/1203 nt) | proV → | glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit ProV |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2805802 = | 1 (0.020) | 89 (1.560) | 80/490 | 0.0 | 98.9% | coding (988/1203 nt) | proV | glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit ProV |
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| * | ? | NC_000913 | = 2805810 | 1 (0.020) | 50 (0.880) | 50/490 | 0.2 | 98.0% | coding (996/1203 nt) | proV | glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit ProV |
| ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
AAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2805566‑2805810‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGC > NC_000913/3583428‑3583671 AAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGGGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGAT < 2:219305/251‑1 cCAATAATTCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGC < 1:351069/249‑1 cCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGGTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCC < 1:372533/250‑1 ATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGGTCTTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGCCCCACGTTCGGCACTGAAATTATGGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAAAGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑CGTGT > 1:213547/1‑251 ATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGT < 1:289404/251‑1 GTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGAT < 2:318360/251‑1 CGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGg > 1:175879/1‑250 GTACCGTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAATCCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTG < 1:134342/251‑1 TCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCTCGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTG‑AGTGTATGATGGTGTTTTT < 2:63074/250‑1 CCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCTCGGGTGATGCTGCCACCTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGGTTTTGAGGT > 1:321216/1‑251 CGTGGCGTTGATAATAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCTGACACCGAATGGCTTAATGCGTAAAACACCTGGCTGCGGCCCGCGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 2:562595/251‑1 TGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGCGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGggcg > 2:460442/1‑247 TTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGg > 2:217135/1‑250 TGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG > 1:327641/1‑251 GATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG < 1:442631/251‑1 TAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGGAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCACCTTACTGATTT‑AGTGTATGCTGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT > 2:424620/1‑251 ATTCAGTGCGACAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAG > 2:486645/1‑225 ATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 1:486645/225‑1 CAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCGTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 1:390988/250‑1 AGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT > 1:220694/1‑251 CGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCC > 1:108955/1‑251 AAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCT > 1:443951/1‑251 ATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTt > 1:395662/1‑250 TATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTAATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGT > 2:164519/1‑251 TGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAAATTATTGCAGGATGAAGATCGCGAATATGGCTACGTTATCGAACGCGGTCATAAGTTTGTCGGCGCAGTCTCCATCGATTCGCTTAAAACCGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGCTTT‑AGTGTATGTTGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC > 1:527071/1‑250 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |