| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,219,128 | G→A | intergenic (‑52/‑366) | aer ← / → patA | aerotaxis receptor/putrescine aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,219,128 | 0 | G | A | 100.0% | 82.6 / NA | 25 | intergenic (‑52/‑366) | aer/patA | aerotaxis receptor/putrescine aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (11/14); total (11/14) | |||||||||||
GACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATGTCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGCGCAGCAATCATCAAATCCATACCCGACAAAAACCGTGCAAAATAACAACAAATGTTAACAGATAGCA > NC_000913/3218905‑3219367 | gACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTAGTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGGCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGGCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAAcc < 1:273696/251‑1 (MQ=255) aCCATGTTGTGCGTCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATAAAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACTTACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTATTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGAtt > 1:71280/1‑250 (MQ=255) tGTAACTCTTGCGAGGTATAGCTGCTTGCCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATCGCTGTGGTGATTGGTAGTGGACATCATTGTGGTTGTGTCCGCCAGCGGTGTATTTTGCTTGTGGACATATTGATGAGAAGACATTTTTGCGTCCTTTGAAGTTTCTATGGTTGTTAACTTCTTTTCTTATTTTATATCTGCCCCGCTGCGTTTATCTTTAACCGATTACTTTGCGTTTGATCGCAAt < 2:269430/249‑1 (MQ=255) ccGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGAATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTa > 1:32415/1‑250 (MQ=255) cTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTg > 1:88715/1‑250 (MQ=255) aaaGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGTTTTaaaa < 1:74286/251‑1 (MQ=255) aaGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCtt > 1:117746/1‑241 (MQ=255) aaGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCtt < 2:117746/241‑1 (MQ=255) gtgtCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTCACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGTTTAAttt > 2:240718/1‑195 (MQ=255) gtgtCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTGCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAAttt < 1:240718/195‑1 (MQ=255) aGCAGGAGTGATATAGCTTTGGAGAGTGGTAGTGTACATCAGAGTGGGAGCGCCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGTAGTCATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCATATTTTATAGCGGCCCCGCTGCGGTTAGCAGTAACCGATTAATTTGATTTAGACCGCACTTTGCGAGTTAATCACAAATCTAATTCCATGATTTAAAAGACGTTCAct < 2:294358/250‑1 (MQ=255) tGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGtt > 1:236591/1‑251 (MQ=255) gAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTa < 1:145701/251‑1 (MQ=255) gTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAattatt < 1:309557/251‑1 (MQ=255) 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aTGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACttt > 2:214030/1‑159 (MQ=255) aTGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACttt < 1:214030/159‑1 (MQ=255) gTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGCGCAGCAATCATCAAATCCATACCCGAc > 1:16382/1‑251 (MQ=255) cAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGCGCAGCAATCATCAAATCCATACCCGACAAAAACCGTGCaa > 1:75481/1‑250 (MQ=255) aGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGCGCAGCAATCATCAAATCCATACCCGACAAAAACCGTGCaaaa < 1:279594/251‑1 (MQ=255) gttgttAACTTCTTGTCAGAGTTTATATCGGCCCCGATGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGAGCAGCAATCATCAAATCCATACCCGACAAAAACCGTGCAAAATAAaaacaa > 2:277013/1‑250 (MQ=255) cAGAGTTTATATCGGCCCCGCCTCGGTTATCTTGAACCGATTAACTTGATTTATATCGCAATTTGCTAATTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTGTCACCCTGTTACGATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCGAAAAGCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGCGCAGCAATCATCAAATCCATCCCCGACAAAAGCCGTGCATAATAACAACTAATGTTTACAGTTAgta < 2:267667/250‑3 (MQ=255) | GACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGCTGGGTGACATACGGATGAGAAGACATGTTCGCGTCCTGTGCAGGTTATATGGTTGTTAACTTCTTGTCAGAGTTTATGTCGGCCCCGCTGCGGTTATCTTTAACCGATTAATTTGATTTAGATCGCAATTTGCGATTTAAACACAAATCTAATTCCTTGATTTAAAATACTTTCACTCTGTTACTATACGAAAACGTTAATTATCTTGCCCAAAAATCAGGCAATTATTGCCCTGAAAACGTGCATTTGCGCAGCAATCATCAAATCCATACCCGACAAAAACCGTGCAAAATAACAACAAATGTTAACAGATAGCA > NC_000913/3218905‑3219367 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |