| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,827,026 | C→T | A606V (GCG→GTG) | recG → | ATP‑dependent DNA helicase RecG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,827,026 | 0 | C | T | 92.6% | 232.4 / NA | 82 | A606V (GCG→GTG) | recG | ATP‑dependent DNA helicase RecG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (29/46); minor base G (3/3); total (33/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTG‑GGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTC‑TCACTGCGTGCTGCTCT‑ACAAAACGCCGCTTTCTAAAACGGCGCAAATTCGCCTGCAAGTGCTGCGCGACAGTAACGACGGTTTTGTGATTGCGCAAAAAGATCTGGAGATTCGCGGCCCTGGCGAATTGTTAGGCACGCGTCAGACGGGTAATGCTGAATTTAAAGTGGCGGATTTACTGCGCGATCAGGCGATGATCCCGGAAGTTCAGCGCCTGGCACGCCATATTCACGAACGTTACCCACAA‑CAGGCAAAAGCCCTGATAGAACGCTGGATGCCGGAGACGGA > NC_000913/3826783‑3827272 | ggCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTG‑GGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTC‑TCACTGCGTGCTGCTCT‑ACAAAACGCCGCTTTCTAAAACGGTGCAAAtt < 1:17436/251‑1 (MQ=255) 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GGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTG‑GGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGCGGTGGCTTC‑TCACTGCGTGCTGCTCT‑ACAAAACGCCGCTTTCTAAAACGGCGCAAATTCGCCTGCAAGTGCTGCGCGACAGTAACGACGGTTTTGTGATTGCGCAAAAAGATCTGGAGATTCGCGGCCCTGGCGAATTGTTAGGCACGCGTCAGACGGGTAATGCTGAATTTAAAGTGGCGGATTTACTGCGCGATCAGGCGATGATCCCGGAAGTTCAGCGCCTGGCACGCCATATTCACGAACGTTACCCACAA‑CAGGCAAAAGCCCTGATAGAACGCTGGATGCCGGAGACGGA > NC_000913/3826783‑3827272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |