| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,384,808 | C→T | K305K (AAG→AAA) | yfbK ← | IPR002035/DUF3520 domain‑containing protein YfbK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,384,808 | 0 | C | T | 95.1% | 124.8 / ‑3.5 | 43 | K305K (AAG→AAA) | yfbK | IPR002035/DUF3520 domain‑containing protein YfbK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (26/13); total (28/15) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.27e-01 | |||||||||||
TCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGG‑CTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTTC‑GTC‑GCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGAAGTTCTTTGACCAATAATTTCAACGAAGACTGGATAAGTGGCAAACGTTCATCAGAAATCATTG > NC_000913/2384573‑2385046 | tCTGCGCTTAAGAGAGGGTATCAATGTATATGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTAGCACAATCAATGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGCCGACAGAGTAACACCAGACTCACGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTAAATGCCCACGTTAAAGTCAACGTCAATGG‑CTATTAAAATGCGATTGATGCCGCCATTAATAACACCTTTC‑GCC‑GCctgctg > 2:569904/1‑250 (MQ=255) cTTCAGAGAGGGAATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGG‑CTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTC‑GTC‑GCCTGCTGATAAGcc > 1:141707/1‑251 (MQ=255) tCAGAGAGGGGATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGG‑CTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAACCCCTTTC‑GTC‑GCCTGCTGATAAGcc > 2:73471/1‑249 (MQ=255) tCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGG‑CTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTC‑GTC‑GCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGc > 1:212709/1‑251 (MQ=255) 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2:245334/1‑200 (MQ=255) aaCAGCGGCAATTCCCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACCCCAACCGTCGACAGAGTAACACCAGACGCCCGCGGTTTTGTGACCATGTATTCAATCGATTTTGGATCGACAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGG‑CTAATAAAATGCGATTGATGCCCCCCTAAATAAACCCTTTC‑GTC‑GCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCAt < 1:23295/251‑1 (MQ=255) ttGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGATCGTCAATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGG‑CTAATAAAATGCGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTTC‑GTC‑GCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCAtt > 1:466582/1‑250 (MQ=255) cccgttcagttttccaTTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACTCCAGACTCCCGCTGGTTTTTACCCATTGTTTCAATCGATTTTGGATCTTCAATGCCAACGTTAATGTCTCCTTCAGTGT‑CCTATAAAATGCGATTGATTCCGCCCTTAATAACCCCTTTC‑GTC‑GCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGTCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATGGCGGCATTAAttt < 1:438309/236‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |