| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 469,271 | G→A | G134E (GGG→GAG) | mdlA → | ABC transporter family protein MdlA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 469,271 | 0 | G | A | 96.7% | 169.9 / NA | 62 | G134E (GGG→GAG) | mdlA | ABC transporter family protein MdlA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base A (20/38); total (22/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACCGGGCAGATCCTGATG‑TGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGGGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGAT > NC_000913/469027‑469521 | gccGGGCAGACTCTGATGGTGG‑TCGCCACCATGGCGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTAGTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACGGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGTCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGCGAAGAGGTg < 2:273298/248‑1 (MQ=255)acCGGGCAGATCCTGATG‑TGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTCCCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGc < 1:297388/250‑1 (MQ=255) gtgccTGTTG‑TGGATCGCCACCATGGTGCTGTTTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGTCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGcggg < 2:218101/248‑4 (MQ=255) gATCCTGATG‑TGGATCGCCACCATGGTGCTGATTTCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCGGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGGCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCtgg < 2:429028/251‑1 (MQ=255) tCCTGATG‑TGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTTGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCtggt < 2:500179/250‑1 (MQ=255) ccTGATG‑TGGATCGCCACCAGGGTGCTTGTTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAATAGGGGCGGACGCtggtgg < 2:72507/251‑1 (MQ=255) ccaTGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGc < 1:147342/251‑1 (MQ=255) aTGGTGCTGATTGCGGGTGGGGTTTATCTCCTTCGTTTCGTCTGGCGGGTATTGCTGTTGGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGAGTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTTCCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGTTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTg < 2:549155/251‑1 (MQ=255) aTGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTg < 1:105841/251‑1 (MQ=255) ggTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGGGCGACCAATGGCGTCGATCGCG‑GCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGGTGGCGCTGGTGGATTCACTGGTGTTggggtggg > 1:328780/1‑246 (MQ=255) cGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGGTTCACTGGTGGTGGGGTGCGCTGGGTTgtttt > 1:298695/1‑247 (MQ=255) tgtgGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTatg < 2:12581/250‑1 (MQ=255) aTCTCCTGCGTTACGTCTTGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGGGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGGTGTTTACg > 1:362658/1‑251 (MQ=255) ccTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGGTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGTCCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTTATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGc < 1:491896/248‑1 (MQ=255) gCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGGGCTGACGCTGGTGGATTCCCTGGGGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAAtt > 1:500734/1‑250 (MQ=255) cTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGGGCTGACGCTGGGGGATTCACTGGGGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAACTGGccgg > 1:222191/1‑248 (MQ=255) gCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGAG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGGGGGGATGACGGTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGAGTTGATTATGATGTCTACGGAAATTAGCTGGCAGt > 1:265305/1‑248 (MQ=255) cGGGTATTGCTTTTTGGTGCGTCTTTTCAACGGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGAc < 2:500734/251‑1 (MQ=255) ggTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTTTTTGCCGCCGGGGGAGAGGTGCTGACGCTGGGGGAATCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTAAGATGTCTACGCACATTAGATGGCAggttaact > 1:184964/1‑244 (MQ=255) gTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCtt < 1:350094/251‑1 (MQ=255) tATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGGCAGCTAAGCCGGCAGCATCCCGAGTTTTTCCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATg < 1:454818/249‑1 (MQ=255) caaccggttGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGGCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGGTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGt < 2:231921/243‑1 (MQ=255) ttGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGGGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGCTGCCAGTGCTGGCGATc > 1:264047/1‑251 (MQ=255) gAACTGCGTGAAGATTATTGCCGGCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCa < 1:45619/250‑1 (MQ=255) cTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGGAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGCTGCCAGTGGTGGCGATCATGAt > 1:14872/1‑251 (MQ=255) gAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAgcg < 1:14595/251‑1 (MQ=255) gAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGAG‑TCTGGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGGGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGTGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTCGCTAGCCGTTGCCCTTATTTTCCCTGTTGCCGATTCCAGTTATGTCGCTCATGATTaatgg > 2:453621/1‑248 (MQ=255) tattaCCGTCAGCTAAGCCGGCATCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGCTCGACCAAGGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGATAAGAGGTGCTGTCGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATTATTAAGCGCAACg < 2:265305/250‑1 (MQ=255) tattaCCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACg < 1:304393/250‑1 (MQ=255) tattaCCGTCAGCTAAACCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGTTTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACgg > 1:411779/1‑251 (MQ=255) attaCCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGAGCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGc < 1:124229/251‑1 (MQ=255) aCCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATACTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCTATCGGG‑TAGGGTTTGCCGCCGGGGAAGGGGTGCTGACGATGGTGGATTCACGGGTGATGGGCGGGGCTGGGTTGGTTATGCTGTCTACGCAAATTAGCTGGCCGGTGGCCTTCTTTTCCCTGTTGCCGGTGCCAGTGGTGGCGATCATGATTAAGCGCCACGGCg > 2:71313/1‑249 (MQ=255) ccGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATg < 1:147095/251‑1 (MQ=255) cGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGGGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGc > 1:152451/1‑251 (MQ=255) ccacgtAAGCCGCGAGCGTCCTTAGATTTACCATCGTCAGCGCACCGGTGACCTCACGGCTCGTGCGGTCCATGACGGCGAGCGCG‑GCGTGGTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGGCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTTCCGATGACAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCta < 2:429749/246‑2 (MQ=255) cAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCttt < 1:28272/251‑1 (MQ=255) cTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGCAGAGGGGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGc > 1:102947/1‑250 (MQ=255) tgcatcagccTGCGTTTTCCCTGCTTCATTGCACCGGCTACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACTTCGGTCGCG‑TCGTGTTTGCTGCTGGAGAGGAGGTGCTGACTCTGGTGGATTCACGTGTGATGGGCTGCGCTGTGTTTATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTTGCAGTTGACCGTATTTTCCCTGTTGCCGAGGCCAGTGATTGCGAGCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACg < 2:487750/242‑1 (MQ=255) gacagcaTCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGCTCGCG‑ACCTGGTTGCCGCCGGTGAAGAGGGGCTGACGCTGGTGGATTCCCTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGGCTACGCACATTAGCTGGGAGTTGTCCTTATTTTTCCTTTTTCCGGTGCACGGGGTGGCGATCTTGCTTTAGCTCAACGGGGAAGCTTTgatttgacgc > 2:380373/3‑242 (MQ=255) gAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTg < 1:71313/249‑1 (MQ=255) gAGTTTTACCTGCGACATCGCCCTGGTGACCGCATGGCTCTGGCGACCAATGACGGTGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGCCGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTTCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATGAGCTGGCAGTTGACCTGATGTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTg < 2:509235/249‑1 (MQ=255) gAGTGTTACCTGCTTCATCGCACCGGTGATCTCATTGTGCGTTGGTACAATTACGTCGATCGCGGTGGT‑TTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGTTTTTCTGGTTGTGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTGCCCTGGTGCTGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGTAATGGCGATGCGTTGCATGAACGCtgcaagcgtg < 2:545980/250‑10 (MQ=255) tttACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGcaca < 1:142605/250‑1 (MQ=255) aCCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAggc < 1:442340/250‑1 (MQ=255) ccTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGGGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAggcgg > 1:66855/1‑251 (MQ=255) gCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGt < 2:222191/251‑1 (MQ=255) cACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTc < 1:350987/251‑1 (MQ=255) ggTGTCCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGTGATGCTTTGCATGAACGCTTTaa < 2:309460/221‑1 (MQ=255) ggTGACCTCATGGCTCTGGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGATTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTaa < 2:54517/251‑1 (MQ=255) ggTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGGGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTaa > 1:309460/1‑221 (MQ=255) aCCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTGTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGAc < 1:453621/251‑1 (MQ=255) aCCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGATTTCAAGTCTTAATGACCGCACCCAAGCAAGccc > 2:466537/1‑250 (MQ=255) ccAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTc < 1:150959/251‑1 (MQ=255) aattacgttgttCGCG‑TCGTGTGGGCCGACGGAGAAGTGTCGCTGGCGAGGGTGGATGCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTCCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATTGCGATTATGATTAAGCTCATCGGTGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGTCGGCGTTTATCAGTCTTAATGACTGCTCCCAGGAAAGCCTCAc < 2:469305/240‑1 (MQ=255) gACGTCGATCGCG‑TCGGGTTTTCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATTGGTTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTTTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCTCCCAGGAAAGCCTCACCa < 2:14872/250‑1 (MQ=255) aCGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGt < 1:368455/251‑1 (MQ=255) gATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCg > 1:496045/1‑251 (MQ=255) gATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCg > 1:353667/1‑251 (MQ=255) tttGCCGCCGGGGAAGAGGTGCTAACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGATGCGCTGTGTGGATTATGATGTCTAAGCACATTCGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATAACAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACAGCGATGCTTAGCATGAACGCTTTACGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTATTAATGCCCGCACACAAGAAAGCCTCACCAGTCTCCGCATGATCACAGc > 2:497244/1‑251 (MQ=255) tGCCGCCGGATAAGTGGTGTTGACGCTGTTTTATTCGCTGGTGTTGGGGTGCGCGGTGTTGATTATGTTGGCTACGCAAATTATCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTTACTATGCCAGTGATGGTGATCCTGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTACGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCGTAATGACCGCTCTCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATTAAAGcc < 2:184964/250‑1 (MQ=255) cgGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTa > 2:244989/1‑197 (MQ=255) cgGAGAAGAGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTa < 1:244989/197‑1 (MQ=255) gggTGCTGTCGCTGGTGGATTCACTGGTGAGGGGCTGCGCTGTGTTGTGTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGAt < 2:298695/251‑1 (MQ=255) | ACCGGGCAGATCCTGATG‑TGGATCGCCACCATGGTGCTGATTGCCGTTGTGGTTTATCTCCTGCGTTACGTCTGGCGGGTATTGCTGTTTGGTGCGTCTTATCAACTGGCTGTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGCG‑TCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGGGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGATCATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGAT > NC_000913/469027‑469521 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |