| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,969,982 | C→T | A335T (GCG→ACG) | tap ← | methyl‑accepting chemotaxis protein Tap |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,969,982 | 0 | C | T | 94.5% | 165.3 / NA | 57 | A335T (GCG→ACG) | tap | methyl‑accepting chemotaxis protein Tap |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); major base T (32/20); minor base G (1/2); total (34/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAGCCCTTTGATCTCTTTTGCTGCCTGCGCGCTACGGCTGGCAAGATTGCGCACTTCACCTGCCACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGCCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGTTTGTGCCAGCGATGCCGCCTGCTGTTCGGTACGACTTGAGAGATCGTTATTGCCTGCGACAATCTCCGCGATACCAATGTGCATCTCCTGGCTTCCCTTA‑CGCACATCACTTACCGTCCCACGCAAAGCCTGCTGCATGGT > NC_000913/1969737‑1970225 | cAGCCCTTTGATCTCTTTTGCTGCCTGCGCGCTACGGCTGGCAAGATTGCGCACTTCACCTGCCACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTgcc > 2:80373/1‑250 (MQ=255) aTCTCTTTTGCTGCCTGCGCGCTACGGCTGGCAAGATTGCGCACTTCACCTGCCACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTcgc > 1:382175/1‑251 (MQ=255) tctTTTGCTGCCTGCGCGCTACGGCTGGCAAGATTGCGCACTTCACCTGACACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGc > 1:121571/1‑251 (MQ=255) ttGCTGCCTGCGCGCTACGGCTGGCAAGATTGCGCACTTCACCTGCCACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCAttt > 1:14103/1‑251 (MQ=255) ggCTGGCAAGATTGCGCACTTCACCCGCCACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGAATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCCTG‑GTACTGACCTAAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCTTTTTTTGCCAGTTCAGACGcc > 2:265031/1‑251 (MQ=255) gCTGGCAAGCTTGCGCCCTTCCCCTGCCACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCt < 1:149103/251‑1 (MQ=255) tGGCAAGATTGCGCACTTCACCTGCCACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATCTTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGACGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGGTCCGCCGCCTgg > 2:117442/1‑250 (MQ=255) ggCAAGATTGCGCACTTCACCTGCCACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTc > 1:183013/1‑251 (MQ=255) gCAAGATTGCGCACTTCACCTGCCACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCg > 1:324544/1‑251 (MQ=255) cAAGATTGCGCACTTCACCTGCCACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGGCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGCCGCCTGTCgg > 2:240143/1‑250 (MQ=255) aaaattggctcattcccccTGCCACTCCCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGt < 1:488239/234‑1 (MQ=255) cccccctcccccTGCCACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTAt < 1:76173/241‑1 (MQ=255) ccTGCCACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCACGTCTGCGCCGTTGTTGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGCAGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTg > 2:508261/1‑251 (MQ=255) cTGCCACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGc > 2:476410/1‑251 (MQ=255) ccACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCt > 1:176707/1‑251 (MQ=255) cACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCtt > 1:454998/1‑250 (MQ=255) 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ccccGCCCCTGC‑CTCCCGGCGCGAGCCGCTTCAACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑GTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTaa < 2:298476/248‑1 (MQ=255) ccACCCCCTTGCTCTCC‑GGGCCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTaa < 2:176707/251‑1 (MQ=255) cccTGCCCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTc < 1:240105/251‑1 (MQ=255) 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cgAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCATTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTTATTGCTCCATATTGGCGTCCGt > 2:254052/1‑251 (MQ=255) cgAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGACAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGCTAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCATTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGt > 2:36101/1‑251 (MQ=255) aggcgatgccACCGCCGCATTCAGGGCCAGTATAGTGGTCTGGAAAGCATTTCCGTAGATAACGTGGTTAATGTAGC‑AATTGTGTTGCGAGCAGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTAATTACTTGAACCGCTCCCGGCTTCGCCGTTGTCGTGGCATGGTGTGACAGGTCCTACTCCTGACGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCGACCGTGGCGGTTAATTTCTCCATACTGGCTGCCGttt < 2:206884/243‑1 (MQ=255) cGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGTTtgtg > 1:8495/1‑251 (MQ=255) cACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTACTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCGGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTTCCCCCTACTGGAGGGCGttttagccaacc > 2:509576/1‑242 (MQ=255) aTTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGTTTGTGCCAGCGATGCCGCct < 1:489240/251‑1 (MQ=255) ttCTGGAAAGCAAGTCCTTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTTGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGATCACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCAtttttt < 2:366083/134‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGGTTGTGCCAACGATGCCGCCTGCTGTTCGGTCCGACTTgg > 1:535194/1‑250 (MQ=255) gTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGAGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCAtttttt > 1:366083/1‑135 (MQ=255) tGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGACGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGTTTTTGCCCGCGATGCCCCCTACTGTTccgttcggctttgg > 1:61411/1‑236 (MQ=255) gATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGTTTTTGCCAGCGATGCCCCCTGCTGTTCGGTACGACTTGAGAGATCGTTTTTGCCTGCgc > 1:503356/1‑250 (MQ=255) gATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGGTTTTGCCAGCGATTCCGCCTGCTTTTTGGGACGGCCTGTGAGATCGTTTTTGCCTGCgg > 1:194098/1‑250 (MQ=255) atctcttaTAATTTCGACAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCTATCTCCGGCATGGGGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAATACCGCCCGTCTGCGCCGGTGTCGCGGTATGTTTTGCCAGGTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGGTTTGCCCTACCTTGGCGGGTAATTGCTCAATACGGGCGTCCGTTTGTGCCAGCGATGCCGCCTGCTGTTCGGTACTACTTGAGAGAGCGTTATTGCCTGAGACa < 2:410329/243‑1 (MQ=255) ccgctgataatggtgtacagt‑tttaGCGAGATGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATGTGTA‑TGTCCTGAACACCGCCTGGCTGCGCCGGTGTCGCGGGCTTTTTTGCCAGTTCCGATGCCTGTTGTGCGTTATCGGTGTTTTGCCCTCCCGTTGCGGTTAATTGCTCCATACTGGTGTCCGTTTGTGCCCGCGATGCCCCCTGCTGATCTGTACGACGTGTGAGATCGTTATTGCCTGGGACaac < 2:196066/231‑2 (MQ=255) cTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGCTAATTGCTCCCTACTTGCGGCCGTTTGGGCCAGCGGTGCCGCCTGCGGTTATGTACGACCTTAGAGCTCGTTTTTGccgtccgcaatctc > 2:495184/1‑239 (MQ=255) gATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGCGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTTCTCCATACTGGCGGCCGTTTGTGCCAGCGATGCCGCCTGCTGTTCGGGACGACTTGAGGGATCGTTATTGCCTGCGCCAATCTccc > 1:362206/1‑250 (MQ=255) gATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGTTTGTGCCAGCGATGCCGCCTGCTGTTCGGTACGACTTGAGAGATCGTTATTGCCTGCGACAATCTcc < 1:29427/250‑1 (MQ=255) aaaTGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGTTTGTGCCAGCGATGCCGCCTGCTGTTCGGTACGACTTGAGAGATCGTTATTGCCTGCGACAATCGCcgcg < 1:145659/250‑1 (MQ=255) atttCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGCCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCCTACTGGCGGCCGGTTGTGCCCGCGATGCCGCCTGCTGTTCGGTACGACTTGAGAGATCGTTATTTCCTTCGGCAATCTcctcgtt > 1:62523/4‑246 (MQ=255) ccAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGTTTGTGCCCGCGATGCCGCCTGCTGTTCGGTACGACTTGAGAGATCGTTATTGCCTGCGACAAACTCCGCGATAccca > 1:53794/1‑248 (MQ=255) 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gCGATCTCCTGCATGTTGTTAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGTTTGTGCCAGCGATGCCGCCTGCTGTTCGGTACGACTTGAGAGATCGTTATTGCCTGCGACAATCTCCGCGATACCAATGTGCATCTCCTGGCTTCCCtt < 1:560099/251‑1 (MQ=255) ccccTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGCCCTGAACCCCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCTGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGTTTGTGCCAGCGATGCCGCCTGCTGTTCGGTACGACTTGAGAGATCGTTATTGCCTGCGACAATCTCCGCGATACCAATGTGCATCTCCTGGCTTCCCTTA‑CGca < 2:540417/249‑1 (MQ=255) tGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGTTTGTGCCAGCGATGCCGCCTGCTGTTCGGTACGACTTGCGAGATCGTTATTGCCTGCGACAATCTCCGCGATACCAATGTGCATCTCCTGGCTTCCCTTA‑CGCACATCACtt > 1:395011/1‑251 (MQ=255) gtcaggggaCTGGCCTGAACACCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCATTTCCGACGCCTGGCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGTTTAATTGCTCCATATTTGCGGCCGTTTGTGCCAGCGATGCCTCCTGCTGTTCGGTACGACTTGAGAGATCGTTATTGCCTGCGACAATCTCCGCGATACCAATGTGCATCTCCTGGCTTCCCTTA‑CGCTCATCACTTACCGTccc < 2:491369/243‑1 (MQ=255) tACTGACCTGAACACCGCCCGTCTACGCCGTAGTCGCGGCCTTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCATACCGTGGAGGTTCATAGCTCCATGCTGGCGGCCGTTTGTGCCCGCGCTGCCGCCTGCGTTTCTGCACGAATGTAGAGCTCGTTATTGCCTCCGGCAATCTCCCCGATACAACTGTACCTCCCCCGACTTCCCTTATCAAACA‑CACTTACCGTCCCACGCaa > 2:279914/1‑250 (MQ=255) acCGCCCGTCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGTTTGTGCCAGCGATGCCCCCTGCTGTTCGGTAAGACTTGAGAGATCGTTATTGCCTGCGACAATCTCCGCGATACCAATGTGCATCTCCTGGCTTCCCTTA‑CGCCCATACCTTACCGTCCCACGCAAAGCCCGCTGCATgg > 1:504084/1‑251 (MQ=255) ccgcccggCTGCGCCGTGGCCGCTGCCGTTTTTTCCAGTTCCTACTCCTGTCGTGCTTTATCGGCGTTTGGCCCTTCCGGGGCGGTTAATTGCTCCATCTTTGCGGCCTGTTGAGCCAGCGATGCCGCCTGCTGTTCGGGACGACTTGAGAGATCGTTATTGCCTGCGACAATCTCCGCGATACCAATGTGCATCTCCTGGCTTCCCTTA‑CGCCCATCACTTACCTGCCCACGCAAAGCCTGCTGCATGGt < 2:216930/251‑1 (MQ=255) | CAGCCCTTTGATCTCTTTTGCTGCCTGCGCGCTACGGCTGGCAAGATTGCGCACTTCACCTGCCACTACCGCAAAACCACGCCCCTGCTCTCC‑GGCGCGAGCCGCTTCCACTGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGGAAAGCAATTCCGTCGATAACGCTGATAATGTCGCCAATT‑TTTTGCGAGCTGGTGGCGATCTCCTGCATGGTGTGAGTCATG‑GTACTGACCTGAACACCGCCCGCCTGCGCCGTTGTCGCGGCATTTTTTGCCAGTTCCGACGCCTGTCGTGCGTTATCGGCGTTTTGCCCTACCGTGGCGGTTAATTGCTCCATACTGGCGGCCGTTTGTGCCAGCGATGCCGCCTGCTGTTCGGTACGACTTGAGAGATCGTTATTGCCTGCGACAATCTCCGCGATACCAATGTGCATCTCCTGGCTTCCCTTA‑CGCACATCACTTACCGTCCCACGCAAAGCCTGCTGCATGGT > NC_000913/1969737‑1970225 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |