| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4053613 | 51 (1.010) | 3 (0.060) | 3/442 | 3.3 | 4.8% | intergenic (+195/+34) | hemN/yshB | coproporphyrinogen III dehydrogenase/uncharacterized protein YshB |
| ? | NC_000913 | 4285379 = | 72 (1.560) | intergenic (‑166/+34) | yjcH/acs | DUF485 domain‑containing inner membrane protein YjcH/acetyl‑CoA synthetase (AMP‑forming) | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTATCGCCCAGGTTGCTGGTATCGCCCGCCGCAATTTTGCGCAGAATACGGCGCATAATTTTGCCGGAGCGGGTTTTAGGCAGGGAGTCGGTCCAGTGCAGCACGTCTGGCGTCGCCAGCGGGCCAATCTCTTTAC > NC_000913/4285131‑4285621 | aTGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACTCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACaaa < 1:335528/251‑1 (MQ=255)aTGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACaaa < 1:48104/251‑1 (MQ=255) gtgggCAAACCTTTGCCTTTTTGCGTCGAACTCCCTGAATTGCGATTTGTCTTCTATACGCTGATAAATAGGTCCAGTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGTGATTGGTTTAATTCCTGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCAGCCGGCAACCAATGCCTGATGCGACTCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACaatcc < 2:386741/248‑4 (MQ=255) gCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTa < 1:14291/251‑1 (MQ=255) cctttGCCGTTGTTCGATTAACCCTCTGAAATGCTCATTGTCTTCTATCCGTTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCTACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGAc < 2:563432/248‑1 (MQ=255) ttttCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCCCATCCGGCACTCAATCCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCCACTCGcctc > 2:140844/1‑245 (MQ=255) ttttCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAAAAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGGAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATc < 1:140844/248‑1 (MQ=255) tgcgaataactgacTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCGTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGGAGGCCGGATAAGGCGTTGACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGTGACGCTGGCGAGTCTTATAAGGACGACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGc < 1:211300/237‑1 (MQ=255) ttgACTAAATACCTGAAATGCGCATTGTATTTTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTATGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCAGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCa < 2:330305/248‑1 (MQ=39) gACTAACTCCCGGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCGGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATGCTCCAGAGGGAATGAAGGGATTGTTTTAATGCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGTCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAAtt < 2:21916/251‑1 (MQ=39) ccggAAATGCGCATTTTCTTCTATCCTCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTTTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTAc < 2:320584/248‑1 (MQ=255) ccTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCCTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTTTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTAc < 1:482639/251‑1 (MQ=255) ggtgttctAACCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCCCAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTGAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGAt < 2:471204/247‑1 (MQ=255) ggtattctATCCGCTGGTAAATAGTGCCATTCTTCACAGATTCGCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTCTGGGAGAAGGTTACCGCCCGGGTAACCCTTGCCGAATTTAGGCCGGAGAAGGCGTTTACTCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTTTCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTATGATGGCAGCGCGa < 2:330458/246‑1 (MQ=255) ttctATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGAAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGcc > 1:370537/1‑251 (MQ=255) aTCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCTGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGGCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCt > 1:430307/1‑251 (MQ=255) gagaaTAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCATAGATAAGGTAGGGATTTTTTTAATTCCCGCTCCCTGTTGGGAGAAGGTTAAAGCTCGGATAACCCTTGCCGAATTGAGTCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGAAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATCgcttgcttgtc < 2:15598/247‑4 (MQ=37) gCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTtctc > 2:70975/1‑251 (MQ=255) tAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGCGGTAATGTAGGGATTGATTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGAATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGCTAGCCTGCTTCTCTTCa > 1:489777/1‑250 (MQ=255) tAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCa > 1:322715/1‑250 (MQ=255) gTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGACTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCAGCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAACAGCt > 2:293093/1‑251 (MQ=255) gCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTtc < 1:142253/251‑1 (MQ=255) 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aGATTCTCCAGAGGTAAAGTAGGGAGTTTTTAAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGGTAACGCCCGGGTACCCCTTTCCGAATGGAGGCCGGTTAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAACCAATGCCTGGTGCGACGCTGTCGCGTCTTATCATGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCTATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCa < 2:22025/251‑1 (MQ=255) atcCAGCGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCACTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCACTTGTGGGTTACGCAGGCATCGCGGTAGCCTGCTTATCTTCAAGCAGCTTCTCCGCTACGcacggatc > 2:266880/2‑244 (MQ=38) tcCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACACCAGGATCg > 2:183172/1‑251 (MQ=255) 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ggATTGTTTTAATGCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGTTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAAGTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTAt < 2:80760/251‑1 (MQ=255) ttAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTATCGCCCAg < 1:137990/250‑1 (MQ=255) aaTTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCTTCGAGGTATCGCCCAGGtt > 2:288290/1‑251 (MQ=255) 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atcaatGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTATCGCCCAGGTTGCTGGTATCGCCCGCCGCAATTTTGCGCAGAATACGGCGCATAATTTTGCCGGAGCGGGTTTTAGGCAGGGAGTCGGTCCAGTgcagc > 1:132284/1‑251 (MQ=255) cgatggCGACGCGGTCGCTTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTCACGATGGCAGCGCGATAGCCTGCTTCCCTGCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTATCGCCCAGGTTGCTGGTATCGCCCGCCGCAATTTTGCGCAGAATACGGCGCATAATTTTGCCTGAGCGGGTTTTAGGCAGGGAGTCGGTCCAGTGCAGCACGTCTgg < 1:166799/246‑1 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTATCGCCCAGGTTGCTGGTATCGCCCGCCGCAATTTTGCGCAGAATACGGCGCATAATTTTGCCGGAGCGGGTTTTAGGCAGGGAGTCGGTCCAGTGCAGCACGTCTgg > 1:305829/1‑251 (MQ=255) 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cGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTATCGCCCAGGTTGCTGGTATCGCCCGCCGCAATTTTGCGCAGAATACGGCGCATCATTTTGCCGGAGCGGGTTTTAGGCATGGAGGCGGTCCAGTGCAGCACGtaggtagga > 2:5667/1‑241 (MQ=255) gACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTATCGCCCAGGTTGCTGGTATCGCCCGCCGCAATTTTGCGCAGAATACGGCGCATAATTTTGCCGGAGCGGGCTTTAGGCAGGGAGTCGGTCCAGTGCAGCACGTCTGGCGTCGcc > 2:161578/1‑251 (MQ=255) ccGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTATCGCCCAGGTTGCTGGTATCGCCCGCCGCAATTTTGCGCAGAATACGGCGCATAATTTTGCCGGAGCGGGTTTTAGGCAGGGAGTCGGTCCAGTGCAGCACGTCTGGCGTCGCCa < 1:292477/250‑1 (MQ=255) 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aGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCAGCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTATCGCCCAGGTTGCTGGTATCGCCCGCCGCAATTTTGCGCAGAATACGGCGCATAATTTTGCCGGAGCGGGTTTTAGGCAGGGAGTCGGTCCAGTGCAGCACGTCTGGCGTCGCCAGCGGGCCAATCTCTTTAc < 1:422035/251‑1 (MQ=255) | ATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTATCGCCCAGGTTGCTGGTATCGCCCGCCGCAATTTTGCGCAGAATACGGCGCATAATTTTGCCGGAGCGGGTTTTAGGCAGGGAGTCGGTCCAGTGCAGCACGTCTGGCGTCGCCAGCGGGCCAATCTCTTTAC > NC_000913/4285131‑4285621 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |