| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,637,943 | T→G | L416L (CTT→CTG) | creC → | sensory histidine kinase CreC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,637,943 | 0 | T | G | 98.7% | 217.3 / ‑5.2 | 74 | L416L (CTT→CTG) | creC | sensory histidine kinase CreC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base G (42/31); total (42/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.79e-01 | |||||||||||
GCCGCGTCAGCGAAGCGCGCACCGTGCAGTTGGCAGAAAAAAAAATCACTCTGCATGTTACGCCCACCGAGGTTAACGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGAAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTTGCATCACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑ACGCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTTTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCTCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGTGGCGTGCTGGCCTCGCTTCGACTTCACCGTCACTTCACATAGCTTCAAATTCTTCCCACATAGTCTTCGTATCCTGCTGCCATTGCAAAGGAGAAGACTATGTTGAAATCC > NC_000913/4637699‑4638189 | gccgcGTCAGCGAAGCGCGCACCGTGCAGTTGGCAGAAAAAAACATCACTCTACATGTTATGCCCACTGAGGTTAATGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGGGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGt > 1:386117/1‑251 (MQ=255) gTCAGCGAAGCGCGCTCCGTGCAGTGAGAAGAAAAAAACAGCACGCTACAGGTTAAGCCCACGGAGGTGAATGTTGCAGCTGAACCGGCGTTACCGTAGCAGGAGCTGGGGAATTTACTTGATAACGCCATCGAATTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGATGGATAGCGGTAGTGGTATTCCTGACATCGCGCTGTCACTTAtttt < 2:69701/251‑1 (MQ=255) tCAGCGAAGCGCGCACCGTGCAGTTGGCAGAAAAAAACATCACTCTACATGATATGCCCACTGAGGTTAATCTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGACGCTGCGGAATTTACTGGATAACGCAATAGATTTTACCCCCGAAAGCGGTCGCATCACGCTAAGCGCAGAAGGGGATCAGGAACAAGTC‑CCCCTTAAGGTGCAGGAAACCGGTAGGGGTTTTCATGACTACGCGATGTCACGAAttttt > 1:668988/1‑251 (MQ=255) aGCGCGCACCGTGCAGTTGGCAGAAAAAAACATCACTCTACATGTTATGCCCACTGAGGTTAATGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCt < 1:10495/251‑1 (MQ=255) cgcACCGTGCAGTTGGCAGAAAAAAACAGCACTCTACATGTTATGCCCACTGAGGTTAATGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGGCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGATCACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATTCCGGTAGTGGTATTCCTGACTGCGCGCTGTCATGTATTTTTGAGCGTTTTTa < 2:318241/251‑1 (MQ=255) cccGTGCAGTTGGCAGAAAAAAACATCACTCTACATGTTATGCCCACTGAGGTTAATGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTActc < 1:384307/250‑1 (MQ=255) gTGCAGTTGGCAGAAAAAAACATCACTCTACATGTTATGCCCACTGAGGTTAATGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTTCTCttt < 2:165030/251‑1 (MQ=255) cAGTTGGCAGAAAAAAACATCACTCTACATGTTATGCCCACTGAGGTTAATGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAAAGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGCACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTATTCTTTGcc > 2:7121/1‑251 (MQ=255) aGTTGGCAGAAAAAAACATCACTCTACATGTTATGCCCACTGAGGTTAATGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGccg < 1:60501/251‑2 (MQ=255) gCAGAAAAAAACATCACTCTACATGTTATGCCCACTGAGGTTAATGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATACCGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCCTAACGCTAAGCGCCGAAGTAGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTCAGGTGCCGGCTACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGccgcggtc > 2:86737/1‑245 (MQ=255) cAGAAAAAAACATCACTCTACATGTTATGCCCACTGAGGTTAATGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGc > 1:535481/1‑250 (MQ=255) cAGAAAAAAACATCACTCTACATGTTATGCCCACTGAGGTTAATGTTGATGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGAC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGGATTCCTGCCTACGCGCTGTCACGTCTTGTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGc > 2:598509/1‑250 (MQ=255) aGAAAAAAACATCACTCTACATGTTATGCACACTGAGGTTAATGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGCTCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGAGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCCCGTATTTTTGAACGCTTTTAATCTTTGCCGCGTGcc > 1:433202/1‑249 (MQ=255) 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gCCCACTGAGGTTAATGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGt > 1:562475/1‑251 (MQ=255) tgAGGTTAATGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGCTAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGCAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGCTACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTATTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGTCGt > 2:409127/2‑251 (MQ=255) aGGTTAATGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTc < 1:3515/251‑1 (MQ=255) aGGTTAATGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTc < 2:281782/251‑1 (MQ=255) tgTTGCTGCTGAACCCGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGCTTTTACCACCGAGAGCGGTGGCATAACGCTAAGCGACGAAGTGGCTCAGGGACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGCTACCGGTAGTGGAATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGGGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGTGTTAGTCAGTg > 2:264863/2‑251 (MQ=255) tgctgcTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAgg > 1:181873/1‑251 (MQ=255) gctgctGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATTCCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTTAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGt < 1:264863/251‑1 (MQ=255) gctgctGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGGAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCAGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTccttggtggagg > 2:587711/1‑240 (MQ=255) ctgAACCGGCGTTACTGGAGCCGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTTCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGGTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGcc > 2:121530/1‑251 (MQ=255) 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ggCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCgtttgt < 1:7121/251‑1 (MQ=255) ggAGCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCAc < 1:490717/149‑1 (MQ=255) ggAGCAGGCACTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAAAGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCAc > 2:490717/1‑149 (MQ=255) gCAGGCGCTGGGGAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGGCGCCCGTTTGTTTAACGGCGa > 2:62712/1‑249 (MQ=255) aaTTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCa > 1:524426/1‑250 (MQ=255) tttACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAACTGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGACGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACg > 1:56344/1‑251 (MQ=255) ttACTGGATATCGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGTACACGGC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGGCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGGCTGGGGTTGGCGTGCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGTCGAAGTCACGCTGCGCAACg < 2:655592/250‑1 (MQ=255) tACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGt < 1:184287/250‑1 (MQ=255) tACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGCCGCATAACGCTAAGCGACGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTATGGAGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGATGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGAGAGGCCGCCCGATTGTTTAACGGAGAAGTCACGCAGCGCaaaggg > 2:622637/1‑247 (MQ=255) ggATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTCGCATAACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑GCCCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAgg < 1:459385/251‑1 (MQ=255) 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acgtcgcccTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGAGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGAGGCGTGCTGGCCTCGCTTCGACTTCACCGTCACTTCACATAGCTTCAAATTCTTCCAACAt > 2:487096/9‑249 (MQ=255) cgtcgcccTTAAGGTGCTGGATCCCGGTAGTGGGATTCCTGACTACGCGCTGTCACGCATTTTTGACCGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGGGGCGTGCTGGCCTCGCTTCGACTTCACCGTCACTTCCCATCGCTTCAAATTCTTCCCACATAgc > 2:576003/8‑250 (MQ=255) gtcgcccTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGCGGCGGGCTGGCCTCGCTTCGACTTCACCGTCACTTCACATAGATTCAAATTCTTCCCACATAgcc > 2:571366/7‑249 (MQ=255) 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aaGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGTGGCGTGCTGGCCTCGCTTCGACTTCACCGTCACTTCACATAGCTTCAAATTCTTCCCACATAGCCTTCGTATc < 1:86737/250‑1 (MQ=255) aggttccggATACCGGTAGTGTGATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTAGTTTTGAACGTTTTTACTCTTGGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGTGGCGTTCTGTCCTCGCTTCGACTTCACCTTCACTTCACATAGCTTCAAATTCTTCCCACATAGTCTTCTTATCct < 2:119926/244‑1 (MQ=255) ggATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGTGGCGTGCTGGCCTCGCTTCGACTTCACCGTCACTTCACATAGCTTCAAATTCTTCCCACATAGCCTTCGTATCCTGCTGcct > 1:183997/1‑250 (MQ=255) aTACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGTGGCGTGCTGGCCTCGCTTCGACTTCACCGTCACTTCACATAGCTTCAAATTCTTCCCACATAGCCTTCGTATCCTGCTGCCAtt < 1:239199/251‑1 (MQ=255) aGTGGTATTCCTGACTACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGTGGCGTGCTGGCCTCGCTTCGACTTCACCGTCACTTCACATAGCTTCAAATTCTTCCCACATAGCCTTCGTATCCTGCTGCCATTGCAAAGga < 1:571366/251‑1 (MQ=255) tACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGCGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGTGGCGTGCTGGCCTCGCTTCGACTTCACCGTCACTTCACATAGCTTCAAATTCTTCCcaca > 2:183393/1‑204 (MQ=255) tACGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGTGGCGTGCTGGCCTCGCTTCGACTTCACCGGCACTTCACATAGCTTCAAATTCTTCCcaca < 1:183393/204‑1 (MQ=255) aCGCGCTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGTGGCGTGCTGGCCTCGCTTCGACTTCACCGTCACTTCACATAGCTTCAAATTCTTCCCACATAGCCTTCGTATCCTGCTGCCATTGCAAAGGAGAAGACTATGTTGaaa < 1:69019/251‑1 (MQ=255) cgcTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTTGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGTGGCGTGCTGGCCTCGCTTCGACTTCACCGTCACTTCACATAGCTTCAAATTCTTCCCACATAGCCTTCGTATCCTGCTGCCATTGCAAAGGAGAAGACTATGTTGAAATcc < 1:31996/251‑1 (MQ=255) cgcTGTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCGCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGTGGCGTGCTGGCCTCGCTTCGACTTCACCGTCACTTCACATAGCTTCAAATTCTTCCCACATAGCCTTCGTATCCTGCTGCCATTGCAAAGGAGAAGACTATGTTGAAATcc < 1:121530/251‑1 (MQ=255) | GCCGCGTCAGCGAAGCGCGCACCGTGCAGTTGGCAGAAAAAAAAATCACTCTGCATGTTACGCCCACCGAGGTTAACGTTGCTGCTGAACCGGCGTTACTGGAGCAGGCGCTGGGAAATTTACTGGATAACGCCATCGATTTTACCCCCGAGAGCGGTTGCATCACGCTAAGCGCCGAAGTGGATCAGGAACACGTC‑ACGCTTAAGGTGCTGGATACCGGTAGTGGTATTCCTGACTACGCGCTTTCACGTATTTTTGAACGCTTTTACTCTTTGCCTCGTGCAAATGGGCAAAAAAGCAGCGGTCTGGGGTTGGCGTTCGTCAGTGAGGTCGCCCGTTTGTTTAACGGCGAAGTCACGCTGCGCAACGTGCAGGAAGGTGGCGTGCTGGCCTCGCTTCGACTTCACCGTCACTTCACATAGCTTCAAATTCTTCCCACATAGTCTTCGTATCCTGCTGCCATTGCAAAGGAGAAGACTATGTTGAAATCC > NC_000913/4637699‑4638189 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |