| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,636,493 | T→C | L163L (TTG→CTG) | creB → | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,636,493 | 0 | T | C | 94.3% | 146.3 / ‑1.3 | 55 | L163L (TTG→CTG) | creB | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base C (31/19); total (34/21) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.92e-01 | |||||||||||
TGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGGTTGTTGCTGGGCTATTTTTTACT > NC_000913/4636248‑4636736 | tGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGCAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCAATTAACGCTGCCGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGa > 2:311061/1‑249 (MQ=255) gAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACCATGTGGCTAAACCGTTTTACCCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTc < 1:334850/251‑1 (MQ=255) ggTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCGGGAAATTGGTGCTGACGACGATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCTCTTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCaa < 2:36546/250‑1 (MQ=255) cGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGCGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGcc > 1:327344/1‑251 (MQ=255) gATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGAAGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAAACGTTCTCGACGCCATCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGCATTGACTGAACCCGCGGCGCAGATCACC‑TGGTTTGCCCCACCATTAGCGATGACGCGGGATGAGTTTTTATTGTTGAAGTCGTTACTCAAGTCCCCGGGCcg > 2:482146/1‑251 (MQ=255) cGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTTGGTGGCTAAACCGTTTTCCCCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCcgcg < 1:344495/250‑1 (MQ=255) cGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCGGAAGACGTTTCTCCAGTCGCCAGGCCGCGt > 1:596986/1‑251 (MQ=255) cTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCCTTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTg > 2:624645/1‑251 (MQ=255) gCTTGGGCTGGAAATGGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAATTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTgg < 1:457204/250‑1 (MQ=255) gggCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTccc < 1:311061/250‑1 (MQ=255) aTTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCCACt > 2:100626/1‑251 (MQ=255) gTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTAACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTACGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATg > 1:214944/1‑251 (MQ=255) atgTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTgg > 2:466021/3‑251 (MQ=255) cTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGa > 1:379891/1‑247 (MQ=255) aaaCCGTTTTCACCTCGCGAAGTGAGCGACAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTAAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCACGTCATACGTATGGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGGCAGGCACTTAACGCTGACGCGGAATGAGTTTTTATTTATTAAGACGTTACTCATGTCGCCAGTCCGCGACCGGTCCCGCCAGCCACTACTGGCAAGCGCGTGGGAAGATgc > 2:60120/1‑251 (MQ=255) aCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGAGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGCGAAACAGTTCTCGTCGCCGTCCCCCGTCCTCCGTATTGGTCCTTTTGTATTGAATGAACCCGCAGCGCAGATCCGC‑TGGTTTGACACGCAATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTCTTGCTGCAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGACGTTgcgc > 1:443676/1‑251 (MQ=255) 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cGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTg > 1:641338/1‑236 (MQ=255) cccGTCATCCGTATGGGTCATTTTGAATTAAATGACCCCGGGGCGCAGACCAGC‑TGTTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCt < 1:466021/251‑1 (MQ=255) cATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCAc > 1:333231/1‑251 (MQ=255) cGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGACCCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGTTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGATTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGAt < 1:465711/251‑1 (MQ=255) gTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTg > 1:610809/1‑221 (MQ=255) cATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTa > 2:267647/1‑167 (MQ=255) cATTTTAAATTAAATGACCCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTa < 1:267647/167‑1 (MQ=255) 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TGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGGTTGTTGCTGGGCTATTTTTTACT > NC_000913/4636248‑4636736 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |