| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,636,474 | T→G | T156T (ACT→ACG) | creB → | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,636,474 | 0 | T | G | 96.6% | 159.6 / ‑2.6 | 59 | T156T (ACT→ACG) | creB | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base G (36/21); total (37/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.81e-01 | |||||||||||
CGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGGTTGTTG > NC_000913/4636230‑4636719 | cGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCAGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGATTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAACCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGCAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGACCAGC‑TGGATTGACACGCCTTTAACGCTGACGCGGTAt > 2:71973/1‑251 (MQ=255) gTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATg > 1:482054/1‑251 (MQ=255) ttACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATgg > 1:321587/1‑250 (MQ=255) ccTGTGCTGTTCCTGACGGCCCGGAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGGGCTGTCGACTAGGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCTTCTCCCGTCATCCGTTTTGGTCATTTTGAATTGAAGGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGtt < 2:583153/251‑1 (MQ=255) tGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTAttg > 1:397432/1‑251 (MQ=255) tGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGCAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCAATTAACGCTGCCGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGa > 2:311061/1‑249 (MQ=255) gAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACCATGTGGCTAAACCGTTTTACCCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTc < 1:334850/251‑1 (MQ=255) ggTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCGGGAAATTGGTGCTGACGACGATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCTCTTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCaa < 2:36546/250‑1 (MQ=255) cGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGCGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGcc > 1:327344/1‑251 (MQ=255) gATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGAAGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAAACGTTCTCGACGCCATCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGCATTGACTGAACCCGCGGCGCAGATCACC‑TGGTTTGCCCCACCATTAGCGATGACGCGGGATGAGTTTTTATTGTTGAAGTCGTTACTCAAGTCCCCGGGCcg > 2:482146/1‑251 (MQ=255) 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gTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTAACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTACGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATg > 1:214944/1‑251 (MQ=255) atgTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTgg > 2:466021/3‑251 (MQ=255) cTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGa > 1:379891/1‑247 (MQ=255) 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cGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTg > 1:641338/1‑236 (MQ=255) cccGTCATCCGTATGGGTCATTTTGAATTAAATGACCCCGGGGCGCAGACCAGC‑TGTTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCt < 1:466021/251‑1 (MQ=255) cATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCAc > 1:333231/1‑251 (MQ=255) 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gatggtagaacacGACATTAACGCTGGCGCGGTAGGAGTTTTTCGTGAGAAAGACGTAACTCAAGTCGCAAGGCCGCGTCTGGACCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTaa < 2:139903/242‑1 (MQ=255) acacGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCg > 1:485272/1‑251 (MQ=255) cGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCAACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGACATCAACCCCGAACTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCGGTAATGCGTaacgtc > 2:408000/1‑245 (MQ=255) gCCATTAACGCTGACGAGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGACAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGGGCCAAGCAGCGCGCCATCGACCCCGCTCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGTAATCGCCTGAGGGGCCTGAAATGCGTATCGGcg > 2:223812/1‑249 (MQ=255) cccATTAACGCTGACGCGTTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACTTTACTCAGTTCGCCAGGCCTCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGTAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCAt < 1:221253/250‑1 (MQ=255) taacgcTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTCCTCAAGCCGCAAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCgg < 1:21529/247‑1 (MQ=255) accgcTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGGCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGgtt < 1:140312/249‑1 (MQ=255) cTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGGAATGCGTATCGGCATGCGgttgctg > 2:675297/1‑248 (MQ=255) | CGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGC‑TGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCGTGCCAAGCTGCGCGCCATCAACCCCGATCTTTCACCGATTAATACTCATCGCGGCATGGGATATAGCCTGAGGGGCCTGTAATGCGTATCGGCATGCGGTTGTTG > NC_000913/4636230‑4636719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |