| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 5,851 | G→T | I203I (ATC→ATA) | yaaA ← | DNA binding and peroxide stress response protein YaaA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 5,851 | 0 | G | T | 97.8% | 146.5 / NA | 46 | I203I (ATC→ATA) | yaaA | DNA binding and peroxide stress response protein YaaA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (27/18); total (27/19) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
GCATGCTTTTGTAGGCAGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCATTGACTGCAAACTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAATCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATGAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATGATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATCTTTCCCTCGGGCATTCTCAAGACGGATCCCCATTTCCAGACGAT > NC_000913/5626‑6080 | gCATGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCATTGACTGCAAACTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGttcttc < 1:494859/247‑1 (MQ=255) cATGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCATTGACTGCAAACTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATc > 1:533019/1‑251 (MQ=255) gTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCATTGACTGCAAACTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAacac > 2:404160/1‑251 (MQ=255) aGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCATTGACTGCAAACTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACAcc < 1:404160/250‑1 (MQ=255) aGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCATTGACTGCAAACTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCg < 1:636923/251‑1 (MQ=255) aGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCATTGACTGCAAACTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCg > 2:636923/1‑251 (MQ=255) cGTTCACGCCGCATCCGGCATTGACTGCAAACTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAAtctc > 1:483204/1‑251 (MQ=255) cGGCATTGACTGCAAACTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATttctt < 1:275816/251‑1 (MQ=255) gCATTGACTGCAAACTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATTATCTCGGCATTCAATTTCTTCg > 2:497737/1‑251 (MQ=255) taaggCAAACGTAACGCGGCTCGGAGCGTTTAAACACCAGTATGACATTGCTGGAGTAATCCGCATATAAGAATTAACCGTCTCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTATCAATAATGAAACGACTCATCAGACCCCGTGCTTTCTTATCGTAGTAGCTGATGAGCTTAAATTGGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACTGGCTTGATAAGCTCGGCATTCATTttcttcttctt < 2:38190/246‑6 (MQ=255) gACTGCAAACTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTc > 1:32262/1‑251 (MQ=255) gCAAACTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCAcc < 1:510718/250‑1 (MQ=255) aaCTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCgctt > 1:350470/1‑248 (MQ=255) aCTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAAGCTCGGCGTTCAATTTCTTCTGCTTCACCGAttt < 1:185716/251‑1 (MQ=255) tgctCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACAcc > 1:124855/1‑198 (MQ=255) tgctCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGACAGTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACAcc < 2:124855/198‑1 (MQ=255) tttAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGACCACCGGCTTGATAATCTCGGCCTTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGcc > 1:633782/1‑250 (MQ=255) aaaCACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAACTACTCATCTGACGcc > 1:361146/1‑247 (MQ=255) cacCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAAGCTTCATCAAAGAAGTATCCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTaa < 1:190024/251‑1 (MQ=255) ggaggaAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATATTCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCCTCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCtt > 2:245797/1‑251 (MQ=255) ggaAGCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTtgtg > 1:425439/1‑251 (MQ=255) tAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTc > 1:114642/1‑249 (MQ=255) aTTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGt < 1:245797/249‑1 (MQ=255) aaaCCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTGCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCTTGCTTTCGTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTgatgat < 1:665823/251‑1 (MQ=255) gtcagtTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTcc > 2:664721/1‑251 (MQ=255) agtTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTcccc > 1:469103/1‑250 (MQ=255) ttGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTcccc > 1:603313/1‑248 (MQ=255) tctGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTg > 1:286857/1‑251 (MQ=255) gCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGCTGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATCTTTc > 1:283429/1‑251 (MQ=255) gCCGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATCTTTc < 1:591713/251‑1 (MQ=255) gCCGAATTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGACACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCCTCTGACGCCAGATTAATCACCACCTTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATAATATCTCCCCAGCATTGTTACCGATCTTTc > 2:345334/1‑251 (MQ=255) ccGATTTTCAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGaa < 1:302907/93‑1 (MQ=255) ccGATTTTAAATAATAAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGaa > 2:302907/1‑93 (MQ=255) aTTTTCAATAATAAAACGACTCAACAGTCCTCGTTCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCGTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCTCCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCACCCCAGAATTGATACAGATCTTTCCCTc < 2:603313/251‑1 (MQ=255) aataaaaCGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGGTCAGCTTGTTGGTGAGGATTTCTCCCCGGAATTGATACAGATCTTTCCCTCGGGCTTtct > 2:191519/5‑251 (MQ=255) aCGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACATATCTTTCCCTCGGGCATTCTCAAGAc < 1:191519/251‑1 (MQ=255) aCGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATCTTTCCCTCGGGCATTCTCAAGAc > 1:467893/1‑251 (MQ=255) cGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATCTTTCCCTCGGGCCTTCTCAAGACg > 1:598658/1‑251 (MQ=255) gACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTAACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATCTTTACCTCGGGCATTATCAAGACgg > 2:49905/1‑251 (MQ=255) cccctcatatcgggatctgtcgtAGCGTAGAAGCTGATTATCTCAAATTTGCCGTTCTACTCATCTAGAAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATGTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCTGAGTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCGGCGAGTGCCTCGGTCAGCTGGGTGGTGATGATATCTCCCCAGAATGGTTACATATCGTTCCCTCGGGCAGTCTCAAGTCGGa < 2:635402/228‑1 (MQ=255) tcatcaGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATAtc < 2:537743/202‑1 (MQ=255) tcatcaGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATAtc > 1:537743/1‑202 (MQ=255) catcaGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATCTTTCCCTCGGGCATTCTCAAGACGGATcc > 1:563371/1‑251 (MQ=255) catcaGACCGCGTGCGTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGGGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATCTTTCCCTCGGGTATTCTCAAGACGGATcc < 1:71833/251‑1 (MQ=255) gACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATGTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATCTTTCCCTCGGGCATTCTCAAGACGGATCCCCAtt < 1:430376/251‑1 (MQ=255) ttCTTAGCGTAGAAGCTGATTATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATCTTTCCCTCGGGCATTCTCAAGACGGATCCCCATTTCCAGACGAt > 1:320074/1‑250 (MQ=255) | GCATGCTTTTGTAGGCAGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCATTGACTGCAAACTTAACGCTGCTCGTAGCGTTTAAACACCAGTTCGCCATTGCTGGAGGAATCTTCATCAAAGAAGTAACCTTCGCTATTAAAACCAGTCAGTTGCTCTGGTTTGGTCAGCCGATTTTCAATAATGAAACGACTCATCAGACCGCGTGCTTTCTTAGCGTAGAAGCTGATGATCTTAAATTTGCCGTTCTTCTCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAAAATACTCATCTGACGCCAGATTAATCACCACATTATCGCCTTGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATCTTTCCCTCGGGCATTCTCAAGACGGATCCCCATTTCCAGACGAT > NC_000913/5626‑6080 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |