| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,515,348 | A→C | L444V (TTG→GTG) | fecA ← | ferric citrate outer membrane transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,515,348 | 0 | A | C | 97.1% | 349.9 / ‑4.9 | 105 | L444V (TTG→GTG) | fecA | ferric citrate outer membrane transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/0); new base C (47/55); total (50/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.05e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
AGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGCCGG‑ACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAG‑CCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCGTGGCTCAATACCGCGCACCCAGTAGTTACGCGGCGAGAGGGTGATGCGTTTGCCTTGCTCCAGGTAGCCGCTGCGCAGGGTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCAT > NC_000913/4515104‑4515590 | aGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATTCCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGCCGG‑ACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCACATAGCg < 1:351167/251‑1 (MQ=255) cGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGCCGG‑ACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCACATAGCGAt < 1:158417/251‑1 (MQ=255) cGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGCCGG‑ACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCACATAGCGAt < 1:543449/251‑1 (MQ=255) cGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGCCGG‑ACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGGGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCACATAGCGAt > 1:199668/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |