| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,279,276 | C→G | F121L (TTC→TTG) | kbaZ → | putative tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 1 chaperone |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,279,276 | 0 | C | G | 93.8% | 143.9 / ‑4.2 | 51 | F121L (TTC→TTG) | kbaZ | putative tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 1 chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); major base G (15/30); minor base T (2/1); total (19/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.83e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTCAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTG > NC_000913/3279040‑3279516 | ccGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGGGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCCATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGGATT‑GAAAAAATCCACCt > 1:423373/1‑251 (MQ=255) cTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATAACGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGGTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCCGGATGCGTTGATTCTTGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGGTGCGGCCGG‑ATTTAAAAAAATCCAACTTT‑ATTg > 1:524361/1‑251 (MQ=255) aaCCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGGTATACCGGAATACCGCCCCCCGCTTTTCGCGGCTTTTGTTGTCCGACCGCCGCCTCGATGAAATTTCCGCAGGGTTCGTTGTTTCTGGGGGGTGACCATCTGGGGCCACACCGCTGGCAAAACCTGCCCGCCGCTCCCGCCATGGCCACTGCCCGTGATTTACTTAAAACCGACCTTGCGGCAGG‑TTTTGCAAAAATCCAcccttcttgaaacatgtccc > 2:196907/1‑233 (MQ=255) gACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGGCGATCCGAt > 1:552887/1‑251 (MQ=255) gcggTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACt > 1:84338/1‑251 (MQ=255) taccacgagatcccccccgccGATTTGCGCGGCTTTGTTTGGCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAATCCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATTATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCTCCTTG‑ATTGCATCATGGCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACtgatg < 2:542600/235‑1 (MQ=255) ataCGGGAATGACGCCCGCCGATTTGAGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCACCTCGTTGAAGTTCCCGCAGGATGCGTTGATGCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGAc < 2:290873/251‑1 (MQ=255) aggACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGc < 1:464529/249‑1 (MQ=255) tccgccctccGATGTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCTCCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCt < 1:434124/248‑1 (MQ=255) cccgccGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAAcg > 1:55308/1‑251 (MQ=255) cgccgATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAAcgcg < 1:196907/251‑1 (MQ=255) cgATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCCATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTg > 1:602350/1‑201 (MQ=255) cgATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCCTTCAGGGCGCTCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGGACGcgccg > 2:172286/1‑251 (MQ=255) attgtCGCGGCTTTGTTGGTGAGCTCGCCGATTCGTTGAATTTCCCGCAAGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCGGGGGCCAAACCGCTGGCAAATCCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGGTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATGGCAGCATTTCCTGTCAGGACGGTCCGAGTCCCTTAACTTATGACATCGTGGCTGAACGCgccgcc < 2:614327/247‑1 (MQ=255) cgcgGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCt < 1:579032/251‑1 (MQ=255) cgcgGCTTTGTTCGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTCAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTcc > 2:210708/1‑250 (MQ=255) gcgGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTg < 1:390719/251‑1 (MQ=255) ggtcacctcgcctctgcGTTGAACATCCCGCAGGAGGCGGTGATGCTGTGTGGTGACCATATGGTGCCAACCCGCTGGCAAATTCTTCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGTCGATGATTTGATGAAAAGCTGCGTTTCGGCAGG‑ATTGAAAAAAAGCCGCCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCGTCACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCTTCGGGAGAAAGTGGc < 2:278529/235‑1 (MQ=255) gtCAGCGCGCCGACCTGTTGAATTTCCCGCAGGATGCTTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCTCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCCCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTCGATTAAAAGCTACGTGGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCg < 2:406268/251‑1 (MQ=255) cAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCgg > 1:448001/1‑250 (MQ=255) cTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAg < 1:585569/241‑1 (MQ=255) cTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAAATGCTGACATCGTGGCTGAACGCGCCCCCCGTTCGGCGAAAg > 2:585569/1‑241 (MQ=255) cTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAgg < 1:306772/173‑1 (MQ=255) cGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTCAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAGGA‑AACCTGTCtt < 1:210708/251‑1 (MQ=255) atgccccGCAGTATGCGTGGATTCTGGGTGGTGACCATCGGGGGCAAAACCGCTGGAAAAACCTGCCGGCCGCTAAGGCAATGGCCAATGCCGATGAGTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACGGAGGACAGCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCGGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAacac < 2:200121/247‑1 (MQ=255) aTTTCCCTCATGATGCGTTGATGCTGGGTGGTGACAATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTGAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAacac < 2:312413/251‑1 (MQ=255) tttCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGGACACt > 1:396705/1‑251 (MQ=255) ccGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTgg < 1:28169/251‑1 (MQ=255) ccGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTgg < 2:552887/251‑1 (MQ=255) aGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGa > 1:149772/1‑250 (MQ=255) aTGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGcc < 1:427164/251‑1 (MQ=255) tGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCAAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCt < 1:364631/250‑1 (MQ=255) gACCCTCTGGGGCCAAACCGCTGGAAAAACCTGCCGTCTGCGTAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTTCTTTGCGTCAGG‑ATAGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCACGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGTTCTGGAGTATGTCATTg < 2:423373/250‑1 (MQ=255) ggaaataccctccggccgCTCAGGAAAGTGCCAATGCCGATGATTTGATAAAAAGCTACGTTGCGGCATG‑ATTTAAAAAAATCCACCGTG‑ATTGCAGCATGTCCTGGTAGGACGCTCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAATTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACGTGGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTTAGTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTgg < 2:515019/239‑1 (MQ=255) gccggccgCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATg < 1:172286/251‑1 (MQ=255) gCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGGAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGTAGCCGATCTGGAGTATGGCATTGGTACCAAAGTGCCAGTACCTGGCGGCGCGCATGAAAccct > 1:472769/1‑249 (MQ=255) cTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑GTTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAACCTGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAGAACC‑GGCTTGAACACTTTTGCGGAGCCGATCTGGGGGATGTACTTGGTTCCGAAGGGCCGGTAACTGgcggcgggaatgacaccct > 1:322960/1‑237 (MQ=255) ggcAATGACGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGc < 1:621344/249‑1 (MQ=255) cAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAACCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCGGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGccc < 1:100528/128‑1 (MQ=255) aTGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTc < 1:230850/251‑1 (MQ=255) gCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTca < 1:245011/250‑1 (MQ=255) cGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCt < 2:218012/177‑1 (MQ=255) cGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCt > 1:218012/1‑177 (MQ=255) gCTACGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGGCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCCCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCCAGCCGGATGccaccccc > 1:114094/1‑249 (MQ=255) aCGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCGTG‑ATTGCAGCATGGCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGATCTGGCGGTCACCTCGCCGGATGCCGCCcgcg < 2:84338/249‑1 (MQ=255) cGTTGCGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCa < 1:521646/251‑1 (MQ=255) gCGGCATG‑ATTGAAAAAAA‑CCACCCTGTATTGCAGAATGTCCTGTCAGGACGTGCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCCGGCGAAAGGGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGATCACTTTGGCGAAGCCGATCTTGAGTATGTCATTGGGACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGCAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCcgcgtctcgct < 2:434048/251‑8 (MQ=255) cGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTg < 1:460239/251‑1 (MQ=255) cGGCAGG‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGAGGCTGAACGAGCCGCCCGTCTGGCGAAAGGGGCGGCAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGAATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAACGAGATGGCGGGCACCCCGCCGAGTGCCGCCCGCGCCCCGCTg > 1:60707/1‑251 (MQ=255) g‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGGCGATCTGGAGTATGTc > 2:124368/1‑155 (MQ=255) g‑ATTGAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTc < 1:124368/155‑1 (MQ=255) | CCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGG‑ATTCAAAAAAATCCACCTTG‑ATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGA‑AACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTG > NC_000913/3279040‑3279516 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |