| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,201,548 | A→C | T18P (ACC→CCA) | ymfI → | uncharacterized protein YmfI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,201,548 | 0 | A | C | 94.9% | 164.3 / 2.4 | 60 | coding (52/342 nt) | ymfI | uncharacterized protein YmfI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base C (23/33); minor base . (2/1); total (26/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 | |||||||||||
ACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGACCAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACGCAAATATATTTGTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGA > NC_000913/1201303‑1201789 | cccAGGCGGGTGGGTATCCACAGAATGTCGATTGTCAGCCTCACCCTTAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAG‑CCaaa < 2:639723/249‑1 (MQ=255)acCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAG‑CCaaa > 1:639723/1‑250 (MQ=255) ggCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCCAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCCGTTATGTGCCTGTCTTTTCCCCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCCAAAACAGCCCGCAAACAAGGAAACTTATTGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGCAAAAACAGCCGA‑CACACCaaa‑aact > 2:196214/1‑248 (MQ=255) gCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTACCCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAAtt < 1:589470/251‑1 (MQ=255) cGGGAGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCACGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGCCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAAttt > 2:542326/1‑251 (MQ=255) tgggtATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTga > 1:110281/1‑249 (MQ=255) acaGAAGGTCGATTTTCAGCCTCAACCTTAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCTCAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGc < 2:338211/251‑1 (MQ=255) aaGGTCGATTGTCAGCCTCAGCCTTAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATGCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACTCATCCAAACATCCAAAA‑AAATTTTAAGAATTAATGCTTaa < 1:212943/251‑1 (MQ=255) aaGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTa > 1:355696/1‑250 (MQ=255) gTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACtt > 1:200039/1‑251 (MQ=255) cGATTGTCAGCATCAACCTTAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACACTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTAGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACACGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCTGAACAGCCAAAA‑AAATTTGACAAATTAATGCTTAACtatt > 2:657611/1‑248 (MQ=255) tCAGCCTCAACCTTAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTAcc > 1:601826/1‑251 (MQ=255) cAGCCTCAACCTTAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCa < 1:89995/251‑1 (MQ=255) tAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTa > 2:479591/1‑250 (MQ=255) tAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTa > 1:500304/1‑250 (MQ=255) cgcgTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGt < 1:187460/251‑1 (MQ=255) ttGCGATGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGATGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTCTTTGAAGACACAGCCGAACAG‑CCAAACAAATTTGAAGGATTAATGCTTAACTTTCTGTGCCAGAAAACAGTTAACGAGtatg > 2:275139/2‑248 (MQ=255) gTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTTGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTGTTATGATCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTg < 2:199639/251‑1 (MQ=255) ggctcTGAGCCGCATTCCCCACAACGCTTAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGa < 2:355696/247‑1 (MQ=255) tGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGAt > 2:225191/1‑250 (MQ=255) gcatgcacctgaaCGCTAAGGAGTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTTGCGTTTCACCTCTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCGCACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTGGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATATGAAGAATTAATGCTTATCTTACTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAgctgct < 2:216436/240‑1 (MQ=255) cacaACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTg < 2:500304/251‑1 (MQ=255) aGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAgg < 1:635568/251‑1 (MQ=255) ggTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTc < 1:140534/250‑1 (MQ=255) ggTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTc < 1:545414/250‑1 (MQ=255) aTACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTAc > 1:389914/1‑250 (MQ=255) tGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGa < 1:642209/224‑1 (MQ=255) tGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGa > 2:642209/1‑224 (MQ=255) gTTATGTGCCTTTCTTTACACCACGTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCGCACAAATCCAGCAAGCAATGACACTTAATGAACCAGTTTTAAGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGCACAGCCAAAA‑AAATTTGAGGACTTAATGCTCAACTTTCTGTACCAGACAACAGTTAAAGAGTATGACAAGAGATGCTGAAGCCTGTTTCCACAGGGAACTATCCTCACAAGTACAATgctctgac > 2:345104/1‑244 (MQ=255) gTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACGTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTGAATGAACCAGTGTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAAGTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGc < 2:13430/250‑1 (MQ=255) tATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCca < 1:196214/250‑1 (MQ=255) aTGTTCCTGTCTTTTCACCTCTTCAGGCTCGGTGGTATTCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCcaac < 1:419824/251‑1 (MQ=255) aTGTGCCTGTCTTTGCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCcaa < 1:657356/250‑1 (MQ=255) gtgCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCGGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACGTAATGAACCAGTTTTATGGGCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCcaaca < 2:601826/250‑1 (MQ=255) gTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGTTATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCtt > 2:40817/1‑251 (MQ=255) ttttCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAAAGGGATATATCCTCACAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGAt > 2:232585/1‑251 (MQ=255) caccccTTCAGGCTTGGTGTTATGCTTGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCaaa < 2:148439/251‑1 (MQ=255) aGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACa < 1:521070/151‑1 (MQ=255) aGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACa > 2:521070/1‑151 (MQ=255) gtCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAAAAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTg < 1:672977/250‑1 (MQ=255) aTGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCTAACAGTg < 1:225191/251‑1 (MQ=255) ggtgttatcACACAGCCCTCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACATTCGTCTATGTGAAGACACAGTCGACCAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTTACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGTATTGCCAACGAATCCTTGATCAAACATTGTCAATTGCTTACAGTGCCGgt < 2:55466/244‑1 (MQ=255) cacacaGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAAAAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAACGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCTACCAGTACCGGTGTTGACGc > 2:505607/1‑251 (MQ=255) acaGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACGCaa > 1:390359/1‑250 (MQ=255) cagcAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCt > 1:467229/1‑105 (MQ=255) cagcAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATGAATTCTTAACTTTCt < 2:467229/105‑1 (MQ=255) caagcaagGAAACTTAAGGAACCAATGTTATTGTCACGTGCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGATTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGTTATATCCTCAAAAGTTCAATGAACTGCCAACAAATCCGAGATCAAACATTTTCAAGTGCTAACAGTGCCGGTGTGGACGAAAATATATTTg < 2:329702/251‑1 (MQ=255) aagcaagGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACGCAAATATATTTGt > 1:202939/1‑251 (MQ=255) aaCTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGGTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACGCAAATATATTTGTCTGTAAAtt < 1:560608/251‑1 (MQ=255) aCTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACGCAAATATATTTGTCTGTAAAttt < 2:110281/251‑1 (MQ=255) aaagAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATGTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAATCAGTTTCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACGCAAATATATTTGTCTGTAAATTTGAAc < 2:10762/248‑1 (MQ=255) aaTGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAATTACAATGAACTGCCAACAAAGCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACGCAAATATATTTGTCTGTAAATTTGAAc < 2:390359/251‑1 (MQ=255) aTGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACGCAAATATATTTGTCTGTAAATTTGAAc > 1:402707/1‑250 (MQ=255) aCCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATTCTGAACTTTCTTGACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTTCCGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAAAGAACTGCCAACAAATCCTTTATCAAACATTTGCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACGCAAATATATTTGTCTGTAAATTTGAACAAAgc < 2:524046/251‑1 (MQ=255) ttATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACGCAAATATATTTTTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCt > 2:642721/1‑251 (MQ=255) tCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACGCAAATATATTTGTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTc > 1:613165/1‑251 (MQ=255) aTTTGAAGACACAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACGCAAATATATTTGTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCtt < 1:55156/248‑1 (MQ=255) aaGACACAGCCGAACAGCTAAAA‑AAAGTTGAAGAATTAATGCTTAACTCTCTGTACCATAAAACAGTTAAATAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTTCAATGAACTGCCATCAAATCCTTTATCAAGCATTTTCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACTCAAATATATTTGTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGGCTGCTTCCTTata < 2:616436/250‑3 (MQ=255) acacAGCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGAACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTACAGAGGGATATATACTCAAAAGTACAATGAACTGCCACCAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCAAACAGTTCCGGTGTTGACGCAAATATATTTGTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGt > 2:606268/1‑251 (MQ=255) gCCGAACAGCCAAAA‑AAATTTGAAGAATTAATTCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACGCAAATATATTTGTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCGGCTTCCTTAGTTGGTACCGa < 2:227807/251‑1 (MQ=255) | ACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAACCCGCGTGCGCTGAGCCGCATTCACCACAACGCTAAGGATTCTCTCTGGTTGAAAATACTTAGCTGTTATGTGCCTGTCTTTTCACCACTTCAGGCTCGGTGGTATGCTGGAGTTCTCACACAGCCAGCAAGCAAGGAAACTTAATGAACCAGTTTTATGTTCACGTTCGTCTATTTGAAGACACAGCCGAACAGACCAAA‑AAATTTGAAGAATTAATGCTTAACTTTCTGTACCAGAAAACAGTTAAAGAGTCTGACGATAGCTGCTGCAGACTGATTCCAGAGGGATATATCCTCAAAAGTACAATGAACTGCCAACAAATCCTTGATCAAACATTTTCAATTGCTAACAGTGCCGGTGTTGACGCAAATATATTTGTCTGTAAATTTGAACAAAGCGCATGCTTACTTCCGTCTGCTTCCTTAGTTGGTAACGA > NC_000913/1201303‑1201789 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |