| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,760 | T→C | A808A (GCT→GCC) | thrA → | fused aspartate kinase/homoserine dehydrogenase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,760 | 0 | T | C | 98.2% | 176.3 / NA | 57 | A808A (GCT→GCC) | thrA | fused aspartate kinase/homoserine dehydrogenase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (28/28); minor base A (0/1); total (28/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.51e-01 | |||||||||||
ATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGCGTCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGATAAGCTGCCGTCAGAACCACGGGAAAATATCGTTTATCAGTG > NC_000913/2516‑3003 | aTCTCTTTGCCGCTGGCTTGGATAAGGCCCGTGTAGAAGGAAAATTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATTAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAATTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCTCTATTAGCAGCCGCTTCCGTGGGTGCTGCGCGGGTATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTTCCGGTGGCTTTGCCGATc < 2:652199/249‑1 (MQ=255) ctTTGCCGCGCGCGTGGCGAATGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCt < 1:24331/246‑1 (MQ=255) ctTTGCCGAGCGCGGGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGAGCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCt < 2:8201/246‑1 (MQ=255) ttgacgcgcgcgTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGAGTGAAGAATGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTa < 2:278477/244‑1 (MQ=255) cgggcgTGGCGAAGGCCCGTGAGGAAGGAAAAGTTTGGCGCTATGTGGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGATGTGGATGGTAATGAGCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCct < 2:291882/247‑1 (MQ=255) gAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGt > 1:251103/1‑251 (MQ=255) ccgctcttcctatctgttgtGCGTTATGTTTGCAATATTGGTGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGt < 2:133250/232‑1 (MQ=255) atgaAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTg > 1:601277/1‑250 (MQ=255) aaGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACAt < 1:100415/251‑1 (MQ=255) ggAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGATGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTGGGAGTCTGACATgg > 2:180342/1‑251 (MQ=255) aaaaGGTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCGCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGtt < 1:225365/251‑1 (MQ=255) gTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGt > 1:133250/1‑236 (MQ=255) tttGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGtt > 2:305415/1‑251 (MQ=255) ggCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCtt > 1:190824/1‑251 (MQ=255) tatTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGt > 1:460251/1‑251 (MQ=255) atTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGt < 1:305415/250‑1 (MQ=255) gaAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAat > 1:575287/1‑250 (MQ=255) gccTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCg > 1:379228/3‑251 (MQ=255) gccTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCg > 2:207748/3‑251 (MQ=255) cTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGACGTTAGGAGTATGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGAGTCggg > 1:27894/1‑251 (MQ=255) gATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTACGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTAACCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTc > 1:94729/1‑251 (MQ=255) aTTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCg > 1:617875/1‑251 (MQ=255) gacGAAGTGGAGGTTAATGATCCGCTGCTCAAAGTGTAAAATGGCGAAATCGCCCGGGTCGGTTATAGCAACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGGGCGGCGCGGATAGGGTGCGGGCAATGACGTTACAGTTGCCGGGGTCTTTGCAGATATGGTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCTCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGAGGTGCTTgggg < 2:451180/249‑1 (MQ=255) aaGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGggcggc > 1:455118/1‑251 (MQ=255) tGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCAGCTGCCGCTGGAGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGGGTCTTTGGCGATCTGCTACGACCCCGATCATGGGAGTTAGGAGTCTGACATGGTTATAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCATTATGAGCGTCGGGTTTGCTGTGCTCGGGGcggcggg > 2:176281/1‑250 (MQ=255) ggATGGGAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTg < 2:601277/251‑1 (MQ=255) ggTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGaca < 1:151121/250‑1 (MQ=255) tCCGCTGTTCAAAGTGCAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCAGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCCCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTACAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGAGTCGGGTTTGATGTGCACGGGGCGGCAGTGaacacggttgat > 2:301041/1‑240 (MQ=255) tCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGc > 2:581244/1‑209 (MQ=255) tCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGc < 1:581244/209‑1 (MQ=255) tGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGa < 2:392542/161‑1 (MQ=255) tGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGa > 1:392542/1‑161 (MQ=255) cAAAGTGAAAAATGGCGAAAACTCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATGATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTg < 1:364040/251‑1 (MQ=255) aaaTGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGGGAt > 1:500776/1‑251 (MQ=255) aTGGCGAAAACGCCATGGCCTTTTATAGACACTATTATCAGCCGCTGCCAGTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTCCCGGGGTATTTGCCGATCTGCTACGAAACCTCTCTTGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGATAAAGTTAATGCCCCGGCTTCCAGAGCAAATATGAGCGTAGGGTTTAATGTGCGCGGGTCGGCGAGGGCACCCGTTGATGGTGcgatgtctggggcggt > 2:406982/1‑236 (MQ=255) ggCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGt > 1:428810/1‑249 (MQ=255) aacgccctggctgttattaGCCACTATTATCATACGCGGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAGTGACGTGACAGCTGCCGGTGTCTGTGCCGATTGGCTACGTACCCTCTCATGGAAGGTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTGTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTTGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACgg < 2:379228/234‑1 (MQ=255) gCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTg < 1:296470/251‑1 (MQ=255) cTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGACGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACACTCTCATGGCAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTAGGGGCGGCGGGGACACCCGTTGATGGTGCATTGCTTGGAGATGTAGTAACGGTTgggg > 2:398468/1‑248 (MQ=255) ggCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAggc < 1:80135/250‑1 (MQ=255) gCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGcggcgg > 1:370757/1‑251 (MQ=255) cttttataGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGACGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGATTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGGGCTCGGGGCGGCGGGGACACCTGTTGATGGGGCATTGCTCGGAGATGTAGACACGGTTGGggcggc > 2:416797/5‑250 (MQ=255) cACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCa < 1:353139/251‑1 (MQ=255) attatCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGt < 2:251103/249‑1 (MQ=255) attagCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGt < 1:428272/221‑1 (MQ=255) cAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTcaac > 1:649352/1‑250 (MQ=255) ccGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGTATATGGTGCGGGCAAAGTCTTTACAGCTGCCGGTTTATTTGCCGATCTGCTACGACCCCTCCCATTGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGGTTATGCCCCGGCTTCGAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTTCATGGCTCGGAGATCTAGGCACGGTTGAGTCTGCAGCGACATGCAGTCCCAACAAcc < 2:33220/251‑1 (MQ=255) cTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGGTGGTGCATTGATCGGAGCTGTAGTCACGGTTGAGGCGGCCGAGACATTCAGTCTCAACAAccccg > 2:137465/1‑248 (MQ=255) cGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATTGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGGGTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGAct < 1:398468/251‑2 (MQ=255) atGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGATAAGCTGcc < 1:416797/251‑1 (MQ=255) gggCGGGCGATGACGGTACAGCTGCCGGTGTAGTTGCCGATCTACTACGTACCCTCATATGTAAGTTAGGAGTCTGACATGGTGAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCTAATATGAGCGGCGGGTTGGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACATGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGCAGTCACGGGTGAGGCGGCGGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGATATCCTGCCGta < 2:107464/249‑2 (MQ=255) gCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGATAAGCTGCCGTCAg < 1:601582/251‑1 (MQ=255) cGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGATAAGCTGCCGTc > 1:486787/1‑248 (MQ=255) caagtgcGTTACAGGTGCAGGTGTCTTAGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGATAAGCTGCCGTCAGAACCa < 2:460251/245‑1 (MQ=255) aTGACGTTACAGCTGCCGGTGGTTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGATAATCTGCCGTCAGAACCACg < 2:502664/251‑1 (MQ=255) gtgtCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGATAAGCTGCCGTCAGAACCACGGGAAAATATCGTTTATc > 1:321868/1‑250 (MQ=255) ttGCCGATCTGCTACGTACCCTTTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTGCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACTCCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGATAAGCTGCCGTCAGAACCACGGGAAAATATCGTTTATCAGTg < 2:391545/248‑1 (MQ=255) | ATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGCGTCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTGAAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCTTTGCCGATAAGCTGCCGTCAGAACCACGGGAAAATATCGTTTATCAGTG > NC_000913/2516‑3003 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |