| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 582,597 | C→T | intergenic (+500/‑278) | tfaD → / → tfaX | putative tail fiber assembly protein TfaD/protein TfaX |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 582,597 | 0 | C | T | 100.0% | 69.2 / NA | 23 | intergenic (+500/‑278) | tfaD/tfaX | putative tail fiber assembly protein TfaD/protein TfaX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (10/13); total (10/13) | |||||||||||
CGTCAGTTAAGGCCTGCGCCGCATTGCGTATTACACAGCTTTTTGTAGATATATTTCCAGGCAGGCAGTGAAGAAGGTAAGACATGGAAATGGAATCAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATA‑TCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTT > NC_000913/582367‑582821 | cGTCAGTTAAGGCCTGCGCCGCATTGCGTATTACACAGCTTTTTGTAGATATATTTCCAGGCAGGCAGTGAAGAAGGTAAGACATGGAAATGGAATCAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATA‑TCAGATTACTCTCAGGTACGTGAGt < 1:498176/250‑1 (MQ=255) 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2:317433/1‑152 (MQ=255) gCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATA‑TCAGATTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGgtg < 1:317433/152‑1 (MQ=255) ccGCGTTCAGGCTAACTTCGTTCAAATCAATAAAAGATA‑ACAGATTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTAGTGTGTAAATTCTATCCCCATCATCTGTGttttt < 2:209946/250‑1 (MQ=255) aGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATA‑TCAGATTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCa < 1:477476/249‑1 (MQ=255) 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CGTCAGTTAAGGCCTGCGCCGCATTGCGTATTACACAGCTTTTTGTAGATATATTTCCAGGCAGGCAGTGAAGAAGGTAAGACATGGAAATGGAATCAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATA‑TCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTT > NC_000913/582367‑582821 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |