| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 46,943 | T→C | S379S (AGT→AGC) | yaaU → | putative transporter YaaU |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 46,943 | 0 | T | C | 98.2% | 174.7 / NA | 55 | S379S (AGT→AGC) | yaaU | putative transporter YaaU |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (24/30); minor base G (0/1); total (24/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
GTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTAATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGTCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTACCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAGACCAGCAATATGACGATCCGCGGGCAGAGAATGGGGTAAATTGTTCAGATTTCTCTCTTTTCTGAATCAATATTATTGACTATAAGCCG > NC_000913/46709‑47188 | gtgGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCAt < 1:341949/249‑1 (MQ=255) gtgaaaCACTGCCGTACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACTCTGTCGCTGGCGGTTTTGGGTCTGATCCCGGATATGGGGTTCTG‑GCTGGTAGTGATGGCTTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCGCCATTGttt < 1:23149/248‑1 (MQ=255) tAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCGGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTc < 1:618116/250‑1 (MQ=255) gCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTgg < 1:584196/249‑1 (MQ=255) gggcGGCGTCTGTTGTTGTTTGGCAGCTTTGCCATGATGGCGTTGGCGGTGGCGGTGGTGGGGCTGTGCCTGGATATGGGGAT‑TGTGATGGTGGTGATGGCCGTTGCGGGGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGGTGTG‑GCTCTATCCTAATGAACGCTTCCCGACAGATAGCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGGGATTATTTCCGGAAGCCGTATTGGCACCATTGTGGCGACCTGGGCACt < 2:320848/248‑1 (MQ=255) ggCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGGTCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTTTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATACTTATGAACTCTTTCCGACAGATATCCCCGCCTCTGCCCCGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCCCCATTGGTTTGACCTGGGCACTTCCg > 1:5035/1‑251 (MQ=255) ccATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCtt < 1:367092/251‑1 (MQ=255) tGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGGGATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGGAATTTGCAGTG‑GGTCTATCCTTATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGGGGGCGTGATTATTTCCTTAAGCCGTATTTGCCCCATTGTTTCGTCCCTGGCACTGCCGATCTTTTTTAATAAtt > 1:114375/1‑251 (MQ=255) gggcaggatggcggtggcgctggcgGTTTTGGGGCTGATCACGGGTATGGGGATCTG‑GCTGGTGGTGATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑TCTCTATCCTAATGAACTCTTCCTGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCGTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACTGTATc < 2:436444/236‑1 (MQ=255) gatgaCGCGGGCGTTGGTGGTTTTGGGGCTGAAGCCGGATTTGGGGATTTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGTTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTATTTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAaca < 2:465329/251‑1 (MQ=255) cgctggcgctggCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATg < 1:31775/251‑1 (MQ=255) ggcgGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATgggg < 1:515448/250‑1 (MQ=255) gtgtttGGGGCTTATTCCGGATATGGGGTTCTG‑GTTGGGTGTTATGGCCTTTGCTGGGTAGGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCGAATGAACTCTTCCCTACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGTGGGCgg < 2:404272/248‑1 (MQ=255) ggggCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTAtct > 1:176086/1‑251 (MQ=255) gctgttCCCGGATAGGGGGATCTG‑GTTGGTAGTGATGGCCGTGGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCTTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGc < 1:632369/246‑1 (MQ=255) gctgaTCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGCACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCCATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGc > 1:287504/5‑251 (MQ=255) agttctgatctgggtgtCTG‑GATGGTAGTGGTGGTCTTTGTGGTGTTTGCCCTTTTCTCTG‑GCTGCCCTTATAATTTGCCGTG‑TCGCTATCTTCACGAGCTTTTCCCGTCTAATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTCTTGGTTCTATTGTTTCGACATGGGCACTGCCGATCTTTATGAACAAGTACGATATCAGTAGCACGATGCTAATGTCTGCGGGTAtctaactgt < 2:502694/234‑7 (MQ=255) gcgggttgttttggtcttggCGGTGTATGCCTTTTTC‑GTGTGCGGGTCGGGTAATTTGCTGTG‑GATCGATCATAAGGAACTCTTCCAGAAAGATTCCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAATGCGTATTGGCCCCATTGTTTCGACCTGGGCGCTGCCGATCTTTATCAATAATTGCTGTATCAGTATCACGATGCTAATGGGGGAGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCTGTAg < 2:213120/232‑1 (MQ=255) ggTAGTGATGGCCTTTTCGGTGTATGCCTTTTCCTCTG‑GCGGGCCGGGTAAGTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGt < 1:494381/217‑1 (MQ=255) aGTGATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTg > 1:11697/1‑251 (MQ=255) gctGGCCATTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGACGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATAACCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGGATTGACTCCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCCTTATCAATACTTACGGTATCAGTAACACGGTGCTAATGGGGGAggg > 2:12168/3‑210 (MQ=255) gATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCggg < 1:12168/210‑1 (MQ=255) gtcgctgccggtggagtccTTGTTCTCTG‑GCGGGCGGGGGAATTGGCA‑TGTGCTCTATCTCAAGGAACTCTTCCCGACAGATATCCGAGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCATCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTCCGGTAGCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCTTAGCGTTTGcgccc < 2:90872/233‑5 (MQ=255) tGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTc > 1:678129/1‑251 (MQ=255) gtATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAgggg > 1:304951/1‑250 (MQ=255) tGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGGATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAACGTTTGCCCCGGGGGCTCGAGGGATgg > 1:142978/1‑250 (MQ=255) gCCTTTTTCGCTG‑GCGGGCCTGGTAATTTGCAGTG‑GCTCGATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGt < 1:632653/250‑1 (MQ=255) cGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAAccc > 2:115025/1‑250 (MQ=255) gggCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCCCTGGCGCAAAcc > 1:670789/1‑249 (MQ=255) cGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCt < 1:584956/160‑1 (MQ=255) cGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGCTTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGGTGTCACTGGCGCAAACCAGCact > 2:268390/1‑249 (MQ=255) cGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGAGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCt > 2:584956/1‑160 (MQ=255) aTTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCtt < 2:587990/121‑1 (MQ=255) aTTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCtt > 1:587990/1‑121 (MQ=255) gTG‑GCGCTATCATAATGATCTTGTCCCGACAGTTATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGCCCTGGGCACTGCTGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAACCAGCAATATGCCGTTCcgcg < 2:243067/251‑1 (MQ=255) tG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGAGATCCGAGCCTCTGCCGTGGGCGGGATTATGTCCTTAAGCCGGATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGAATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTTCCCCGGAGACTCGAAGGATGTCACTGGCGCAAACCAGCAATATGACGATCCGCgg > 1:120723/1‑251 (MQ=255) tctATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAACCAGCAatat > 1:104138/1‑235 (MQ=255) tctATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAACCAGCAatat < 2:104138/235‑1 (MQ=255) aTCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAACCAGCAATATGACGATCCGCGGGCagag < 1:22015/250‑1 (MQ=255) aTCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAACCAGCAATATGACGATCCGCGGGCAgaga < 1:445783/251‑1 (MQ=255) aataatatcttcccaccagagttCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGGATTGGCACCATTGTGTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAACCAGCAATATGACGATCCGCGGGCAGAGAATggg < 2:520398/229‑1 (MQ=255) aaTGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTTGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAACCAGCAATATGACGATCCGCGGGCAGAGAATgg < 1:614875/250‑1 (MQ=255) tGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAACCAGCAATATGACGATCCGCGGGCAGAGAATg < 1:633316/247‑1 (MQ=255) tGAACTCTTCCCAAAAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGCGGTTATGTCCTTCAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGTTTTCCGTAACGTTTGACACGGAGAATCGAGGGATGTAACTGGCGCAAACCAGCACTATGACGACGCGCGGGCAGGGGATgggg > 2:633316/1‑250 (MQ=255) ccGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAACCCGCCATATGACGATCCGCGGGCAGAGAATGGGGTAAATTGTTc > 2:506845/1‑250 (MQ=255) tatCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGATAATGGGGGCGGGt < 1:298522/127‑1 (MQ=255) tatCCGCGCATCTGCCGTGGGCGAGATTATGTCATTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCTATAATTACGGTATCAGTAACCCGATGCTAATGGGGGCGGGt > 2:298522/1‑127 (MQ=255) atCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAACCAGCAATATGACGATCCGCGGGCAGAGAATGGGGTAAATTGTTCAGATTtctct > 1:487794/1‑251 (MQ=255) gTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAACCAGCAATATGACGATCCGCGGGCAGAGAATGGGGTAAATTGTTCAGATTTCTCTCTTTTCTGAATCAat > 2:483332/1‑251 (MQ=255) gTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAACCAGCAATATGACGATCCGCGGGCAGAGAATGGGGTAAATTGTTCAGATTTCTCTCTTTTCTGAATCAat > 1:239336/1‑251 (MQ=255) tGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGCGACTCGAgg > 2:344893/1‑163 (MQ=255) tGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAgg < 1:344893/163‑1 (MQ=255) gggCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAACCAGCAATATGACGATCCGCGGGCAGAGAATGGGGTAAATTGTTCAGATTTCTCTCTTTTCTGAATCAata < 1:569073/250‑1 (MQ=255) ggCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTCTCAATAATTACGGAATCAGTAACACGATGCTAATGTGGGCGGGGATCTCGCAGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGTGTCTCGAGGGATGTCACTGGCGAAACCCAGAATTATGAACATCCGAGGGCTGGGATTGGGGGAATTTTTTCAGGTTTCTCCCTTTTCTTAAtacataat > 2:619842/1‑244 (MQ=255) tAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAAACCAGCAATATGACGATCCGCGGGCAGAGAATGGGGTAAATTGTTCAGATTTCTCTCTTTTCTGAATCAATATTATTGACTATAAGCcg < 1:483332/250‑1 (MQ=255) | GTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTAATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTGTATGCCTTTTTCTCTG‑GCGGGCCGGGTAATTTGCAGTG‑GCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGTCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTACCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCTCGCTGTTTGGCTTGTTGATTTCCGTAGCGTTTGCCCCGGAGACTCGAGGGATGTCACTGGCGCAGACCAGCAATATGACGATCCGCGGGCAGAGAATGGGGTAAATTGTTCAGATTTCTCTCTTTTCTGAATCAATATTATTGACTATAAGCCG > NC_000913/46709‑47188 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |