| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 46,790 | A→G | L328L (CTA→CTG) | yaaU → | putative transporter YaaU |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 46,790 | 0 | A | G | 95.7% | 123.6 / NA | 48 | L328L (CTA→CTG) | yaaU | putative transporter YaaU |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base G (15/30); minor base T (0/2); total (15/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
GTTTGTTGCCGCCATCTGGACCTGCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGATTGGGGGTTGGCAAAAACGCGGCACTAGGGAATGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTAATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGTCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTACCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCT > NC_000913/46544‑47034 | gtttgttGCCGCCATCTGGACCTGCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGATTGGGTGTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGGAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATcc > 1:436444/1‑251 (MQ=255)gtttgtgGCCCCCATCTGGACCTGCCAGTGGATCCCAATGTTCGCCATTTACTCCTGTGGCCCGCAAATCGTTGTGTTGTTGGGATTGGTTGTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGGAACGTGGTGATTAGCCTGTGCTTTAGGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGTCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATcc < 2:237571/251‑1 (MQ=255) ccATCTGGACCTGCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGATTGGGTGTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGGAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGGTCCCGGGTATgggg > 1:404272/1‑251 (MQ=255) gggACCTGCCAGGGGATCCCAAGGTTCGCCATTTACGCCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGATTGGGTGTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGGAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATctg < 2:90185/250‑1 (MQ=255) ggACCTGCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGATTGGGTGTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGGAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATct < 1:118849/249‑1 (MQ=255) ccTGCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGATTGGGTGTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGGAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATctg‑gctg < 1:493978/251‑1 (MQ=255) ggTGATCCGAATGTGCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGATTGGGTGTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGGAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATTCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGAGTGGCAGCTTTGCCATGATTACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGa < 1:646487/251‑1 (MQ=255) ccAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGATTGGGTGTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGGAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCtt < 1:112850/251‑1 (MQ=255) gTTCTCCAGTTACCCCTTTGGCCCGCAAATCGGTGGTTTTGGGGGATTGGGGGTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGGAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCCCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACCCTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATTACGCGGGCGCTGGCTGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGTGCTTTGct < 2:218386/250‑2 (MQ=255) cATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGATTGGGTGTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGGAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTTCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATg < 1:640553/251‑1 (MQ=255) 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aaaaTCGTGGGGTTGATGGGATGGGGTGTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGAAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCGCGGCTGTATGCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCTGACGTCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTGTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCGTATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTGTCTCTGGCGGGcc < 2:644146/250‑1 (MQ=255) tgttgGGATTGGGTGTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGGAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCa < 1:565165/250‑1 (MQ=255) gttgGGATTGGGAGTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGGAACGCGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGATGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCTATGATGACGCTGGCGCTGGCGGCTTTGGGGCTGATACCGGGTATGGGGATCTC‑GCTGGGTGGGGTGGCCTTTGCGGAG‑TATGGCCTTTTT‑TCTCGCGGGACGGGGAATTTGCAgg > 1:43415/1‑250 (MQ=255) aTTGGGTGTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGGAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGGATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGGTGATCCCGGGTTTGGGGGACTG‑GCTGGGAGGGATGGCGCTTGCGGGGGTTTG‑C‑TTTTTTTCTGGCGGGCCgggggattttgcatgggctc > 2:19161/1‑234 (MQ=255) gggtgTTGGCAAAAACGCGGCGCTGGGGATCGGGTTGATTAGCTTGTTCTTTATGCTCGGTTGTATTCCTCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACTCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGTGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATc < 2:560773/247‑1 (MQ=255) gCAAAAACGCGGCGCTGGGGAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGGTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGAAGTGATGGCCTTTGCGGGG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGGGATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATgg > 1:465329/1‑249 (MQ=255) ctggggAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTAAGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGATTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCGGATACCGGACTGGGGGATCCG‑GGTGGTGGGGATGGACTTTGAGGGG‑GAAG‑CCGTTTTTTCTGGCGGGCCGGGGCATTTGCAGAGGCTCTATCCCAAttgaatattcccggac > 1:146893/4‑234 (MQ=255) tggggAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGGAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑GATG‑CCTTTTTTTCTTGCGGGCCGGGGAATTTGCCGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GCCAGa > 1:520398/3‑250 (MQ=255) ggggAACGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCCCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTTGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGat < 1:238618/249‑1 (MQ=255) ccgtggtgttgttctttgtCTTTATGCACGGCTGTATTCCGCCGATTCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCcgc < 2:460681/233‑1 (MQ=255) gtgATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGTCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCctc < 1:47977/251‑1 (MQ=255) tgATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGGTATGGGGGTGTG‑GCTGGGAGTGATGGGCTTTGCGGTG‑GATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGGCGGGGAATTTGCAGGGGCTCTATCCTTATTAACTCTTCCC‑GACAGAAATACGCGCctcc > 1:213120/1‑250 (MQ=255) ccTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑GATG‑CCTTTTTTTCTGGCGGGCCGGGGAATTTTCAGTGGGTCTATCCTAATTAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCCTCTTCCGTgg > 1:245293/1‑251 (MQ=255) ggctggttcccgccgATGCTGGGGGTAAACTCTTCCGGACGGCGTCCGTTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGGGCTGGCGGTTTTGGTGCTAAGCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGGGATGGCCGTTGCGGTG‑TATT‑CCTTTTTCTCTGGCGGTCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGTCGTGATTATGTCCta < 2:545222/242‑2 (MQ=255) ggCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGGTAAGGGGATCTG‑GCTGGGAGTGATGGACTTTGCGGGG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGGCGGGGAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCCGACA‑TTATCCGCGCCTCCTCCGGGGGCGCGATTTTGTTCtt > 1:449880/1‑251 (MQ=255) gTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAgc < 1:19161/251‑2 (MQ=255) cgATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGGTATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGGG‑TATG‑CCTTTTTCTCTTGCGGGCCGGGTAATTTTCAGGGGCTCTTTCCTTATTAACTCTTCCC‑GGCAGaaa > 1:118602/1‑202 (MQ=255) cgATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGGCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGata < 2:118602/204‑1 (MQ=255) gtgGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCAt < 1:341949/249‑1 (MQ=255) gtgaaaCACTGCCGTACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACTCTGTCGCTGGCGGTTTTGGGTCTGATCCCGGATATGGGGTTCTG‑GCTGGTAGTGATGGCTTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCGCCATTGttt < 1:23149/248‑1 (MQ=255) gTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATTGGGATCTT‑GCTGGTAGGGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTTTCTTGCGGGCCCGGGAATTTGCAGTGGCTCTATCCTTATGGAATCTTCCC‑CACAGATATCCGCGCCTCCTCCGTGGGCGGGATTATATccctcagacgttttggtcccatttttt > 1:493480/1‑226 (MQ=255) tAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTgg < 1:39542/161‑1 (MQ=255) tAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCGGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTc < 1:618116/250‑1 (MQ=255) acTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAg < 1:456826/224‑1 (MQ=255) gCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTgg < 1:584196/249‑1 (MQ=255) gggcGGCGTCTGTTGTTGTTTGGCAGCTTTGCCATGATGGCGTTGGCGGTGGCGGTGGTGGGGCTGTGCCTGGATATGGGGAT‑TGTGATGGTGGTGATGGCCGTTGCGGGG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGGTGTGGCTCTATCCTAATGAACGCTTCCC‑GACAGATAGCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGGGATTATTTCCGGAAGCCGTATTGGCACCATTGTGGCGACCTGGGCACt < 2:320848/248‑1 (MQ=255) ggCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGGTCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTTTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATACTTATGAACTCTTTCC‑GACAGATATCCCCGCCTCTGCCCCGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCCCCATTGGTTTGACCTGGGCACTTCCg > 1:5035/1‑251 (MQ=255) ccATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCtt < 1:367092/251‑1 (MQ=255) tGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGGGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGGAATTTGCAGTGGGTCTATCCTTATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCCTCTGCCGGGGGCGTGATTATTTCCTTAAGCCGTATTTGCCCCATTGTTTCGTCCCTGGCACTGCCGATCTTTTTTAATAAtt > 1:114375/1‑251 (MQ=255) gggcaggatggcggtggcgctggcgGTTTTGGGGCTGATCACGGGTATGGGGATCTG‑GCTGGTGGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGTCTCTATCCTAATGAACTCTTCCT‑GACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCGTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACTGTATc < 2:436444/236‑1 (MQ=255) gatgaCGCGGGCGTTGGTGGTTTTGGGGCTGAAGCCGGATTTGGGGATTTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGTTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTATTTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAaca < 2:465329/251‑1 (MQ=255) 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ggggCTGATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGCCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTGCCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTAtct > 1:176086/1‑251 (MQ=255) | GTTTGTTGCCGCCATCTGGACCTGCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGATTGGGGGTTGGCAAAAACGCGGCACTAGGGAATGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGCTGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTAATCCCGGATATGGGGATCTG‑GCTGGTAGTGATGGCCTTTGCGGTG‑TATG‑CCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCC‑GACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGTCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTACCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCT > NC_000913/46544‑47034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |