| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 46,253 | G→C | A149A (GCG→GCC) | yaaU → | putative transporter YaaU |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 46,253 | 0 | G | C | 96.6% | 184.0 / ‑0.5 | 60 | A149A (GCG→GCC) | yaaU | putative transporter YaaU |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base C (26/31); total (28/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.37e-01 | |||||||||||
GTTGGCACATCGCTGTTTGGTTATATTTCCGATAAAGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATTGCCGCGATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGTGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATCAAAC‑TGTTTGGCGAACCGGTGGCTTTCGATGAAGAGCAGCC > NC_000913/46008‑46489 | gTTGGCACATCGCTGTTTGGCTATATTTCCGATAAAGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCAtgtg < 1:356385/251‑1 (MQ=255) aTCGCTGTTTGGCTATATTTCCGATAAAGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCg > 1:384570/1‑251 (MQ=255) ttGGCTATATTTCCGATAAAGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGAc < 1:600524/250‑1 (MQ=255) tcctaTAAAGTCGGAAGGCGCAAAAGGGTGCTCATTGATATCATCGACAGCGGCGTGATAACGGTGGCGACGATGGTTGTGTCATCCCCCGCCGAACTGTTGGTGATGCGTGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCATTGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTGATCGCCGCCAGGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATc < 2:120487/246‑1 (MQ=255) cctgtcaaGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTTATATCATCGCCATCGGGGTGATATCGGTGGCGACGATTTTTGTTTCATCCCCCGTCTAACTTTTGGTGATGCGGGTACGTATCGGCTTTGTCATCGGTGCAGATTATGCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CTAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTAGGGCGGCGCGACCTGCGACGATCt < 2:588030/244‑1 (MQ=255) aaaGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGGGGCGGCGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTctg > 1:408958/1‑249 (MQ=255) aGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCt < 1:568699/251‑1 (MQ=255) aCGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCGTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGcc < 1:606994/232‑1 (MQ=255) aCGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGAGGAGACGAAGTTTGTTTCATACCCCGTCGAACTGGTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCCTCGGTGCAGATTATACCATCGCCCCCTCACTGAT‑ACACGCGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATACGCTTTATCGCCGCCCTGTGGGTTGGCGGCGCGACCTGCGcccgatcggaaaggcgtcg > 2:606994/1‑232 (MQ=255) attgattacagcGCCATCGGCGTGATATCGGGGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGGTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCAGCGGTGCAGATTATCCCAGCGCCTCCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGTTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCGGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAggcg < 2:607070/239‑1 (MQ=255) atatCAACGCCAACGGGGTGATTGTGGTGGGGACGGTGGTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGGTCTTATCGGCATTGGCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTATTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTg < 1:539730/250‑1 (MQ=255) gTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGt > 1:341508/1‑249 (MQ=255) gATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAgcg > 1:622451/1‑251 (MQ=255) atatCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAgcgc > 1:266733/1‑251 (MQ=255) gTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGACACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGAt > 1:604232/1‑251 (MQ=255) gggCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCGGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATc < 2:478774/250‑1 (MQ=255) gtaTGTGTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTCCTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCCCCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCtgt < 2:63072/249‑1 (MQ=255) gtttgtttCATCCCCCGTCGAACTGTCGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCtgtttgt < 2:266733/251‑1 (MQ=255) ttgtttCATCCCCCTTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCtgtttgtt < 1:658930/250‑1 (MQ=255) gtttCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCCATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGGCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGACGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGttgat > 2:50130/1‑251 (MQ=255) aTCCCCCGTCGAACTGTTGGGGATGCGGGTACTTATCGGCATTTTCCTCGGTGCAGATTAGCCCATCGCCACCACAATGATCCC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCTGCTTTATCGCCGTCATGTTGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGttgattttga < 1:509438/251‑1 (MQ=255) cGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATACCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTgggc > 1:237485/1‑249 (MQ=255) gAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGAtt > 1:181573/1‑251 (MQ=255) aaCTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTc < 1:109080/251‑1 (MQ=255) aCTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCg > 1:328457/1‑251 (MQ=255) aCTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGACATAGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGCTCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGAGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTCATGGCTTTATGATGTGGATGGCGGCTGGCGCTGGATACTGGGTAGCGCGGCGATCCCATGGTTGCTGATTTTGATTGGTCGAGTCg > 2:329949/1‑251 (MQ=255) tGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACt < 1:428597/250‑1 (MQ=255) gTACTTTTCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTcc < 1:162936/251‑1 (MQ=255) tACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTATCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATTGCCGCGATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGTGCCGGTCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGGAGCGCTGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGCATCTccc > 2:128324/1‑251 (MQ=255) aCTTAGCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCAGCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTcccc < 1:242186/251‑1 (MQ=255) tATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCt > 1:79230/1‑251 (MQ=255) aTCGTCATTGTCATCGGTGCAGATGATCCCATCGCCACCTCAATGAGCAC‑CGAGTGCGCCAGGTCCCGTCAGCTGGCGTTGTCCATCAGCTTTACCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATTATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGGTCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTg < 2:237485/251‑1 (MQ=255) tCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAA‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCCGAGGGCGTTTTACATCAGCATTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGAACAGCGCCGAGCTGGTCGGCTAATGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCAGGAGCTTGATGCGGGGTAGCGCGGGGTTGCCCTGTGTGTTGTTTTTGATTGGTAGATTCGACATGACTGAATATCCCAGCTgg > 2:224068/1‑251 (MQ=255) aTTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGttatt > 1:198851/1‑251 (MQ=255) cATCGGTGCAGATTATCCCAGCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTTGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCa < 1:388127/251‑1 (MQ=255) aTCGGGGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACGGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCaa < 2:98193/251‑1 (MQ=255) cGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCaaa < 2:181573/250‑1 (MQ=255) cGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAg < 1:178434/251‑1 (MQ=255) ggTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCGCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAgg < 2:341508/251‑1 (MQ=255) gCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCg > 1:12692/1‑251 (MQ=255) cAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGaa < 1:413222/221‑1 (MQ=255) cAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGAGCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTgga > 2:413222/1‑219 (MQ=255) aGATTATCCCGTCGCCAACTCAATGATCAC‑AGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTTTCGCCGCACTGTGGTATGTCGGCGCGACCTGAGCCGCTCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGCTGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGGAGCGCGGCGTTCCCCTGTTTGTTGATTTTTATTGGTCGGTTCGCACTGCCTGACTCTCACCTCTGGTTCTTACGCCAAggcgg > 2:616268/1‑246 (MQ=255) aGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTTTTACGCAAAGGGCg > 2:630090/1‑249 (MQ=255) gATTATCCCATCTCCACCTCCATGTCCAC‑CGTGTTCTCCAGTTCCCGTCAGCGGGCTTTTTCCATCAGCTTTATCTCCGCCATGTGTTATGTCTTCGCGACCTGCTCCGATCTGGTCTGCTACTTGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGTTAGCGCTGCTATCCCCTGTTTTTTGATTTTGATTGTTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGt < 1:289010/251‑1 (MQ=255) gATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGGATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCAACTGGCTTTATGATGTGGCAGGCGGCTGGCGCTGGAGGCGGGGTGGCGCGGCGATCCGCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGCACTTCATGAACCCCCCCCCTGGttattagccacagggcgggg > 2:142829/1‑237 (MQ=255) tATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTaa < 1:178085/250‑1 (MQ=255) gCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTCCTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTCGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGACCTGCCTGAATCTCCCCTCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGAGCgg > 2:178797/1‑250 (MQ=255) aCCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTTGGACTGCCTGAATCCCCCCGCTGGTTATTACACAAAGGGCGGGTAAAATAGTGCGacgg > 2:4070/1‑248 (MQ=255) ccTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGGACCCGGCAGCGGGCGTGTGCCATCAGCATTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGGAGCGCGTCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCGGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAagag < 1:289695/251‑1 (MQ=255) ccTCAAGGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAagag < 1:259034/251‑1 (MQ=255) tCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAag > 1:583514/1‑247 (MQ=255) cAATGATCAC‑CGATTTATCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCATCTTTATTGCCGCGATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGTGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCTGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAgat < 1:128324/250‑1 (MQ=255) aTGAACAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAAGCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAgatgat < 2:583514/251‑1 (MQ=255) cccGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATAAAAC‑TGTTTGGCGAACCg < 2:12692/251‑1 (MQ=255) cccGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGAGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGACATGATGATAAAAC‑TGTTTGGAGAACCg > 2:469152/1‑251 (MQ=255) gggCGTTTTCCATCTGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGTTCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGATATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGAT‑AAACATGTTTGGCGAACAGGAGGCtttg > 2:542839/1‑250 (MQ=255) ttttCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTCGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAACGAGGGCGAAGAGATGATGATAAAAC‑TGTTTGGCGAACGGGTGGCTTTCgttg > 2:218096/1‑247 (MQ=255) aTCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATAAAAC‑TGTTTGGCGAACCGGTGGCTTTCGATGAAGagc > 1:357437/1‑250 (MQ=255) aGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCACTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGAGTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATAAAAC‑TGTTTGGCGAACCGGTGGCTTTCGATGAAGAGCAGcc < 1:652487/251‑1 (MQ=255) | GTTGGCACATCGCTGTTTGGTTATATTTCCGATAAAGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCAC‑CGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATTGCCGCGATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGTGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATCAAAC‑TGTTTGGCGAACCGGTGGCTTTCGATGAAGAGCAGCC > NC_000913/46008‑46489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |