| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 26,534 | T→C | S86S (AGT→AGC) | ispH → | 4‑hydroxy‑3‑methylbut‑2‑enyl diphosphate reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 26,534 | 0 | T | C | 95.9% | 203.5 / NA | 75 | S86S (AGT→AGC) | ispH | 4‑hydroxy‑3‑methylbut‑2‑enyl diphosphate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); major base C (31/39); minor base A (3/0); total (34/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.62e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTGGCCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGTCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑TCGCCGTGGCGAAGAATCTATTCTCATCGGTCACGCCGGGCACCCGGAAGTGGAAGGGACAATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAACTGACGGTCAAAAACGAAGAGAAGCTCTCCTTTATGACCCAGACCAC > NC_000913/26289‑26779 | ttGGCCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCcgcg < 2:387209/250‑1 (MQ=255) aaCCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGAc > 1:356409/1‑251 (MQ=255) cctgcttgggttttGTGCCGGTGTAGACCGCGATATCAACATTGTTTAAATCGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCTAGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATATCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTGAGTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGTGCGGCGCGATCCTCATTGTCTCCGCACACGGTGGTTCTCAGGCGGTACGGAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACgg < 2:46346/241‑1 (MQ=255) ggTGGTTTTGGGGCCGGGGTAGATCGCGCTATAAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCTCACCGATATATGTACGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGgtggt < 2:74769/250‑3 (MQ=255) gggTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCg > 1:305220/1‑251 (MQ=255) ggTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATACATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGTGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAATCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCt < 1:486065/245‑1 (MQ=255) ggTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAAAGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCCCGTAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGTGCAGATTAGCGAAGTACCGAACGGCGCGATCATGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCCAAAAGCCGCGTTTTGACGGTGTTTGATGCCAcat > 2:486065/1‑243 (MQ=255) aGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGTCGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTgg < 1:370852/251‑1 (MQ=255) gcgcTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGAcc > 1:43184/1‑251 (MQ=255) gcTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCa > 1:496297/1‑250 (MQ=255) cTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCaa > 1:558736/1‑250 (MQ=255) aGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGACGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAACCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAgggc > 1:356068/1‑247 (MQ=255) gCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGAGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCat > 1:122761/1‑251 (MQ=255) aTTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCatat < 1:322902/251‑1 (MQ=255) aTTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCatat < 1:236397/251‑1 (MQ=255) tgttgAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATg < 1:627362/250‑1 (MQ=255) tgttgAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATg < 1:499591/250‑1 (MQ=255) tgcaaaCGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGTTAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGAACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGCCGGTGTTTGTTGCCACCTGTCAGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGa > 2:641691/4‑249 (MQ=255) tgAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGa > 1:555783/1‑249 (MQ=255) gAAAACGCGCTGGCCAGTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGAGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAg < 2:124569/250‑1 (MQ=255) gcTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCcgcg > 1:287409/1‑251 (MQ=255) cTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGACGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGAGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACAAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCgcgc > 1:666689/1‑251 (MQ=255) gCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCACGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGAGTTTATCCGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGACGAGATTTGACGGTGTTTGATGCCCCCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCACGCGcc > 2:593580/1‑249 (MQ=255) ccATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGTTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAgc < 1:260272/251‑2 (MQ=255) ccATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAgc > 2:146492/1‑250 (MQ=255) cGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCgaagag < 1:31484/251‑2 (MQ=255) cGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCgaagag < 2:305220/251‑2 (MQ=255) tatatGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCAcc > 1:573248/1‑188 (MQ=255) tatatGCCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATATCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCAcc < 2:573248/188‑1 (MQ=255) atGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCATGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCgaagagtcgatt > 1:56617/1‑244 (MQ=255) aCGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGGCGATAGGTTGCGTGAGCGAGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGACTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCCTATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCAtaggc > 1:272532/1‑247 (MQ=255) tACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCGCACGGTGGTTCTCAGGCGGTACTTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCcgcg < 1:629386/207‑1 (MQ=255) tACATAAACGCTATGTGGTCGATAGCTAGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGCGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCAGCTGGTGACCAACGTGCATATGGAAGTCGCCcgcg > 2:629386/1‑207 (MQ=255) ccGCTATGAGGACGATAGCTCGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTCTTGAGCAGATTAGCGAAGTACAGGACGGCGCGATCCTGATTGTCTTCGCACACGGGGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGACGCGATTTGACGGAGGTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGGTGCGAAAAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCgg > 2:137683/1‑251 (MQ=255) attgggTCGATAGCTTTCGTGAGCGTGGGGTTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTGCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGTCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑TCGCCGTGGCGAAGAATCTATTCTCATCGGTCACGCCGGGCCCCCGGAAg < 2:479571/245‑1 (MQ=255) gtgGTCGAGATCTTGCTTTAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTATCGAAGTTCCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTTCGTAACGAAGCAAAAAGCCTCGATTTGACGGTGTGTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAATTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGa < 2:541023/251‑1 (MQ=255) aTAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGCAGTACCGGCCGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGCGACCAAAGGGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGCGGTGGAAggtacg > 1:651350/1‑247 (MQ=255) aGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAggtacgat < 1:504640/251‑7 (MQ=255) ggAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCcagt < 1:290244/250‑1 (MQ=255) ggCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCcagtac < 1:1879/250‑1 (MQ=255) ggggCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCcagtacagta > 1:96062/1‑250 (MQ=255) gggCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAAc > 1:58327/1‑251 (MQ=255) ggCTATCTTTATTGGGCAGATTAGCGAAGTACCGGCCGGCGCGATCCTGATTTTCCCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGGCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAAcc < 2:43184/251‑1 (MQ=255) gCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACTGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGt < 1:51101/251‑1 (MQ=255) gATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATc < 1:233382/251‑1 (MQ=255) tttAGAGAAGAACCGGACGGCGCGATCCTGCTTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAAAGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGCTGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAACGTGAATCTGGAAGTAGCACGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGGAGAGTCGCTTCTCATAGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACAATGGGCCAGCACAGTAACCCGGCAggggggctgattct > 2:239633/2‑242 (MQ=255) cGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCg < 1:204726/251‑1 (MQ=255) gTACCGGACGGCGCGATCCTTATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCGCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATGTGACGGTGTTTGATGCCCCCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATc < 2:194581/251‑1 (MQ=255) gaCCGGACGGCGAGATTCTGTTTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGTTGCGTTGTGGCGGTGTTTGATGCCACCGGTCCGCTGGGGTCCAAAGGGCATATGGAAGCCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCAGCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTCCAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTAGaagcg < 2:376735/250‑4 (MQ=255) aCCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCg < 1:17025/250‑1 (MQ=255) cGGACAGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGACGAATCGCCg > 1:489675/1‑251 (MQ=255) gACGGCGCGATCCGTATTTCTTCCGCACCCGGTGTTTCGCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGAGTCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCTCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCAGGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGTGCCAGTACAGTAGCCCGGAAGGGGGAATTTATCTGGTCGAATTGCCGGa < 2:640303/251‑1 (MQ=255) aCGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCTCACGTTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGGTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGAc < 1:524642/251‑1 (MQ=255) aCGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGAc > 1:511134/1‑251 (MQ=255) cgcgATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGAtg < 1:618366/251‑1 (MQ=255) gcgATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGAtgt > 1:194208/1‑251 (MQ=255) gATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGCAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGGATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGAtgtgt > 1:567684/1‑251 (MQ=255) atttctgccGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTCCGTAACGAAGCAAAAAGCCGAGATTTGACGGTGTTTGATGCCCCCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGAATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGGGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGGATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAAca < 2:33752/244‑2 (MQ=255) atttatgccgactaggttgttCTTAGGCGGGACGTAAAGAAGCAAAAAGCAGCGATTTGACGGGGTTTTATGCAACCGGCCTGCTGGTGCCCAAAGTGCATATGGAAGGCGCCCGCGCCAGCTTGCAG‑GGCGAAGAGTCGATTCCCAACGGACACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCTGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCTGACGATGTGTGGAAACTg < 2:126036/232‑1 (MQ=255) tttCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCTCCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAACTg < 1:16671/250‑1 (MQ=255) cGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAACTGACGGTc > 1:589189/1‑250 (MQ=255) cGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAACTGACGGTCa < 1:324194/251‑1 (MQ=255) cacaCGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGTAGTGGTAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGGAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGAGTTGGGGGAACTAACGGTCaa > 2:253061/1‑250 (MQ=255) acGGTGGTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGAGTTGACGGTGTGTGAGGCCCCCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAACTGACGGTCAAAAAc < 2:58327/251‑1 (MQ=255) tgtTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAACTGACGGTCAAAAACGa > 1:78523/1‑249 (MQ=255) aGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGACGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGACGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAACTGACGGTCAAAAACGACGAGAAGctc > 1:483803/1‑251 (MQ=255) ggCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAATTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAACTGACGGTCAAAAACGAAGAGAAGctct < 1:382809/251‑1 (MQ=255) gtgtatgTAACCAAGCAAAAAGCCGTGAGTTGAAGTTGTTTGAGGCACCCTGTCCGCTGGTGCCCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGTAGTTACGATGGGCCAGTACAGGAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCTGACGATGGGTGGAAACTGACGGTCAAAATCGAAGAGAAGctctac < 2:479171/245‑3 (MQ=255) accgaaCGAAGCAAAAAGCCGTGATTTGACGGTTTTTGATGCCGCCTTGCCGCTGGTGTCCAAATTGCATTTGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGGGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAACTGACGGTCAAAAACGAAGAGAAGCTCTCCttt < 2:430311/246‑1 (MQ=255) aCGTAACGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAACTGACGGTCAAAAACGAAGAGAAGCTCTCCTTTa < 1:146492/251‑1 (MQ=255) aaCGAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAACTGACGGTCAAAAACGAAGAGAAGCTCTCCTTTATGAc > 1:397084/1‑251 (MQ=255) gAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCat > 1:392346/1‑125 (MQ=255) gAAGCAAAAAGCCGCGATTTGACGGGGTTTGATGCCACCTTTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCTAAGAGTCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCat < 2:392346/126‑2 (MQ=255) aaaaGCCGCGATTGGACTGTGTTTGTTGCTACCTGGCCGCTGGTGACCAAAGTGCTTATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGGCGTGGCGAAGAGGCGATTCTCATCGGCCACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTATCCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTAGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAACTGACGGTCAAAAACGAAGAGAAGCTCTCCTTTATGACCCAGACCAc < 2:356409/251‑1 (MQ=255) aaaGCCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑CCGTCGTGGCGAAGAGTCGATTCTCATCGGCAACGCCGGGCATCCGGAAGTGGAAGGTACGATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAACTGACGGTCAAAAACGAAGAGAAGCTCTCCTTTATGACCCAGAcaa > 1:389067/1‑247 (MQ=255) | TTGGCCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCACGAAGTGGTACATAACCGCTATGTGGTCGATAGCTTGCGTGAGCGTGGGGCTATCTTTATTGAGCAGATTAGCGAAGTACCGGACGGCGCGATCCTGATTTTCTCCGCACACGGTGTTTCTCAGGCGGTACGTAACGAAGCAAAAAGTCGCGATTTGACGGTGTTTGATGCCACCTGTCCGCTGGTGACCAAAGTGCATATGGAAGTCGCCCGCGCCAG‑TCGCCGTGGCGAAGAATCTATTCTCATCGGTCACGCCGGGCACCCGGAAGTGGAAGGGACAATGGGCCAGTACAGTAACCCGGAAGGGGGAATGTATCTGGTCGAATCGCCGGACGATGTGTGGAAACTGACGGTCAAAAACGAAGAGAAGCTCTCCTTTATGACCCAGACCAC > NC_000913/26289‑26779 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |