| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 19,398 | T→G | A228A (GCT→GCG) | nhaR → | DNA‑binding transcriptional activator NhaR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 19,398 | 0 | T | G | 98.5% | 218.3 / NA | 68 | A228A (GCT→GCG) | nhaR | DNA‑binding transcriptional activator NhaR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base G (23/44); total (23/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
ATGATCATTTCTGACTGTCCGATAGACTCTACGCAGCAGGAAGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCC‑AAAGTTA > NC_000913/19153‑19641 | atGATCATTTCTGACTGTCCGATAGACTCTACGCAGCAGGAAGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATTATGCCGCGTtgat < 1:535492/251‑1 (MQ=255)atGATCATTTCTGACTGTCCGATAGACTCTACGCAGCAGGAAGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTtgat < 2:184256/251‑1 (MQ=255) tCATTTCTGACTGTCCGATAGACTCTACGCAGCAGGAAGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGaa > 1:224140/1‑250 (MQ=255) ttCTGACTGTCCGATAGACTCTACGCAGCAGGAAGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCTAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCt < 2:333971/250‑1 (MQ=255) cTGACTGTCCGATAGACTCTACGCAGCAGGAAGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAAGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATTATGCCCCGTTGATATAAGCtttt > 2:262493/1‑251 (MQ=255) tGTCCGATAGACTCTACGCAGCAGGAAGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTACCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACGTTTGATTACTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCCAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGGAGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGttg > 2:514340/1‑249 (MQ=255) cgagaGACTCTACGCAGCAGGAAGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTTGTGTACAAGTCCACCACCAGAAAATCCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCGCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGAGATg < 2:212593/247‑1 (MQ=255) agGAAGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACAGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGtt > 1:332191/1‑251 (MQ=255) agGAAAGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTTGCGTGAGTGTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTTCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGGTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAAGCCTCGGCGAGTTTGAGGATGCCTCGTTGATGAAAGCGTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGtt < 2:53568/251‑1 (MQ=255) gCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCa < 1:94412/251‑1 (MQ=255) ccTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCCATGTTAGGGCTCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCAGCGAGATTGATAATGACCCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGTTGCACAATTCAATCTTCGGTGCCCCa > 2:313335/1‑250 (MQ=255) gTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACg < 1:330213/250‑1 (MQ=255) gTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACg < 1:445981/250‑1 (MQ=255) gCGAATGTGGCGTTATGTTCTGGTGTCCAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAATGTCGACTTTTGATTCCTTGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTTACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCTCAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACttt < 1:43072/251‑1 (MQ=255) aggttgCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATg < 1:656115/246‑1 (MQ=255) cGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACCATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCggt > 2:119309/1‑248 (MQ=255) gTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATa > 1:527244/1‑250 (MQ=255) tGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCTAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGTGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTAGTTGCCCCAAGGCTTTATGCATATGACTTTTATGACGATaa > 1:617396/1‑250 (MQ=255) tGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATaa > 1:617413/1‑250 (MQ=255) gAGTTGCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATaaa < 1:22936/250‑1 (MQ=255) aGTTTCTGGTGTACATATACACCTACAAAAAAATCGTTCCCTTCT‑GTTTGGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGTCGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTTCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGAGTAAACGTAGAAAGCCTCTGCGAGTCTGAGGATGCCGCGTTGATTAAATCTTTTTGTGTGTTGCATAAGGCAATCTTCGTTGGCCCAACGCTTTATACATATGACTTTTATGACGATAAAAc < 2:670512/251‑1 (MQ=255) ttCTGGTGTACACATCCACCACCAGAAAAAACGTTCACGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCCACTTTTGCTTCCTGGGAGACGGTCAATGCTAGGGCGCAAATCGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGACTAAACGTAGAAATCCTCGGAGAGTTTGATGATGCCCCGTTGGTGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGccagttctgaagg > 2:56277/1‑240 (MQ=255) ttCTGGTGTACAAATCCTCCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACGCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGcc < 1:56277/240‑1 (MQ=255) ttCTGGTGCACAAATCCACCACCAGAGAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGTCTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTg < 2:451673/250‑1 (MQ=255) ggTGTACAAATCCTCCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTGCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTc < 1:232593/248‑1 (MQ=255) aaaaaCCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGTGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAAt < 1:437740/251‑1 (MQ=255) aaaCCGTTCCCGGCTTGTCGGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAAtgt < 2:258984/251‑1 (MQ=255) cGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATg < 1:469441/251‑1 (MQ=255) cccGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGaa < 1:158967/250‑1 (MQ=255) gCTTGGCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGTGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGGTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACGGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTa < 1:675133/251‑1 (MQ=255) cTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTAc > 1:612947/1‑251 (MQ=255) ggg‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACGATGCt < 1:228011/250‑1 (MQ=255) g‑aagaaCGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAATCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCGCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTAt < 2:55690/251‑1 (MQ=255) aagaaCGTCTACTTTTTATTCCTGGGATACGTGATATGTTAGGGCGCAAATTGCGTAACTGGTTTAACTCCCAGTGATTAAACGTAGAAATCCGCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTGCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCGAtt < 2:474093/251‑1 (MQ=255) aagaaCGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTAtt > 1:13536/1‑251 (MQ=255) agaaCGGCGACTGTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTAttt < 2:641019/251‑1 (MQ=255) cGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGa < 1:8291/251‑1 (MQ=255) cGACTTTTGATTCCTGGGCGACGGTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTACCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGAAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGCTGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTgg > 2:607267/1‑250 (MQ=255) ccTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGc < 1:485571/250‑1 (MQ=255) ttGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAAc < 2:370903/185‑1 (MQ=255) ttGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAAc > 1:370903/1‑185 (MQ=255) tGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTGTGCTGAGCGgat < 2:445248/250‑1 (MQ=255) atgccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCTCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGgatgat < 2:671879/248‑1 (MQ=255) aTTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCGTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGgatgat < 1:474530/251‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGAGATTAAACGGAGAAATCCTCGGCGATGTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTTAGCGGATGATTc < 2:639336/250‑1 (MQ=255) gACGTTCAATGTTAGGGCGCAACTTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAACTTGGTCGCGTCgag > 2:539815/1‑197 (MQ=255) gACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCgag < 1:539815/197‑1 (MQ=255) cGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGCTTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTc > 2:255165/1‑174 (MQ=255) cGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTc < 1:255165/174‑1 (MQ=255) ttCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGAt > 1:18052/1‑163 (MQ=255) ttCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGAt < 2:18052/163‑1 (MQ=255) gTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGc < 1:121436/251‑1 (MQ=255) aaTTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTAt < 1:614456/125‑1 (MQ=255) aaTTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATACTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTAt > 2:614456/1‑125 (MQ=255) cTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACACTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGGAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCGGCAATCCggg > 2:582941/1‑250 (MQ=255) aaCTGGTTAACCACCCAGGGATTAACCGTACAAATCCCCCGCGAGTTTGATGATGCCGCGCTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACTATGCAATCTCCGTTGCTCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGAGAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGCTGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAACGAATCTGCAATACGGatta < 2:1922/251‑1 (MQ=255) gggttAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGattagt < 2:91865/246‑3 (MQ=255) ggTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTc < 1:462684/250‑1 (MQ=255) ggTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTc < 1:119309/250‑1 (MQ=255) tAACCCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCTAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTgcg < 2:391796/250‑1 (MQ=255) cccAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCttt < 1:311824/249‑1 (MQ=255) tAAACGAAGCAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGAACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGTTGATTCAGAACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCg > 2:330983/1‑251 (MQ=255) aaTCCTCGTCGAGGTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGCTGCAAAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCTAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGTTAGTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGTACCCGGCGGTACAGCTAATCTGCAATACGGTTTATTCTGTGCTTGTTAGGCTAGCGTCGCGTTAAt < 2:630658/251‑1 (MQ=255) ccTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGGACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGCTGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGCGCGTTAATCgg > 2:522855/1‑251 (MQ=255) gAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCggc < 2:556730/233‑2 (MQ=255) gAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCggc > 1:556730/1‑232 (MQ=255) ttGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGCGCGTTacacggcaccttccccc > 2:646022/1‑235 (MQ=255) gCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGCGCGTTAATCGGCACCTCCCCCCAAAGTTa < 1:646022/250‑1 (MQ=255) | ATGATCATTTCTGACTGTCCGATAGACTCTACGCAGCAGGAAGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGG‑AAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCC‑AAAGTTA > NC_000913/19153‑19641 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |